Read alignment evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | change | freq | score | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 294,210 | 6 | .→A | 2.4% | 2.2 0.0 ‑0.4 | 82 | coding (590/855 nt) | yagM | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein |
Rejected: Polymorphism does not pass frequency cutoff. | ||||||||||
Rejected: Polymorphism prediction not supported by minimum number of reads on both strands. | ||||||||||
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (1/1): ref base (49/31): total (50/32) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 1.00e+00 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 3.77e-01 |
CATAATTGTTTGTCCTTCTTTGTTACCTCTTAGGTTCTGCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGA > NC_000913/293916‑294510 | cATAATTGTTTGTCCTTCTTTGTTACCTCTTAGGTTCTGCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTATTCTAAGAACTTCATTTATCCCACATATAATCGATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTTCCGGGCATCACAGTAATAACACTCAAAGTTTGTTCTCT‑‑‑‑‑‑caataa > 2:316925/1‑301 (MQ=255) ttGTTACCTCTTAGGTTCTGCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTACATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCACTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGACTATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCACAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATACTGTTTGAATATc > 2:44627/1‑300 (MQ=255) ctctTAGGTTCTGCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGACTCTCATCAATTGGGATGTTGACAATAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAACGTAATAACCCTCAACGGTTGTTCTCT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGaca > 2:266054/1‑301 (MQ=255) tctTAGGTTCTGCTCTCTTGTGAGTAGGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTAAATGAACACGGTTGGAAACATCTGGTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATGTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGacac < 1:266048/301‑1 (MQ=255) gagatttgtagaagagacaggAGTCTGGGTTTAGAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTTGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCAGTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGacac < 2:253687/280‑1 (MQ=255) tCTGCTCTCTTTTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGc < 2:399476/301‑1 (MQ=255) gCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGGAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCGTACCAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGAAAAGAGTAGAGCCTGACAGGCATCAAAGTAATAACCCTACACGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATACGAATAATGTTTGAATATGCTGAGACACTTTGATGCttt > 2:75725/1‑301 (MQ=255) gCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGAGGAGCACTGGCAACATAACCACCATATCATTGACATGGTAAATATCAATCAAACAAACAACCGGATAAGGCATAAAAAGCCACTTTCTTCTAAGAAATTCATTTATAAAGAATATAACCGATTGGGATGTTGAAATGAGTAACGCCTGCCCGGCATAAAAATAATAACCAGCAAAGACTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAGAAAGAATAGTGTTTGGATATACTGAGACACATAGATgagtt > 2:251441/1‑297 (MQ=255) ctctTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTAAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAAAAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTaaa > 1:181611/1‑299 (MQ=255) ctTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCTGCATCAAAGTCATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GACTAAGAATAATGTTTGAATATCCTGACACCCTTTGATGCTTTACAt > 1:251571/1‑300 (MQ=255) ctTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCCAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATAACCTGAGACACTTTGATGCTTTACAta > 1:296594/1‑300 (MQ=255) gAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGCTGTTGACCAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCATCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTTAATATCCTGAGACACTTTTATTCTTTTAATCaaa > 2:209871/1‑299 (MQ=255) gAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACACGAATAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCATCAAAGGTGGTTCTAG‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCATGAGacaa > 1:253682/1‑279 (MQ=255) tggttgtgTTTTTAATGAGTGCATCCGGTAAATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTGGCGGAGCACTGGAAGCATAACCACCATGTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATg < 1:418312/294‑1 (MQ=255) gTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGGCATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATACTCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCACAGTAATAACCCTCAACGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATACTGTTTGCATATCCTGAGACACATTGATGCTTTACATCAACATGt > 2:63742/1‑301 (MQ=255) ggTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGCAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTCAATATCAATCCAACAAACAACCGAATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTGAAGCCTACACGGCATCAAAGTGCTAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAGTAAGAATACTGTTTGACTATACTGAGCCAATTTGATGCTTTACATCAAACTGTCtttt > 2:403642/1‑300 (MQ=255) ggTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGACTCAAAGTAATAACCCTCACAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATTTTTTACATCAAAATGTCttta > 1:435215/1‑300 (MQ=255) tttATAATGATGTCATCCGGGACATTAAAACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGAACTGGCAGCATAACCACCATTACATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGAt < 1:44627/301‑1 (MQ=255) tataCTGATGTCACACGGTACATTAACACGGTTGGACACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATtg < 2:296600/301‑1 (MQ=255) atgTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATtttaaatga > 1:72979/1‑300 (MQ=255) ccGGTACATTAACACAGTTTGAAACATCTTTTTAGCAGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTTACATGATAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAATTAATAACCCTCAAAGTTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGGTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGc < 2:181612/301‑1 (MQ=255) cATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGGTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTCCATCAAACTGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCtttttt > 2:1381/1‑300 (MQ=255) tttAACACCGTTGTAAACATCTGTTTTGCGGAGCACGTGCATCATAACCACCATTTCAGTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCAGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑TAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACAGCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTcc < 1:251436/300‑1 (MQ=255) gTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCAGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCATGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCCACGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGATTAATGTTTGAATATCCTGAGACAATTTGATGCTTTACATCACAATGTCGTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTGTTCCATATCTTaa > 2:6266/1‑301 (MQ=255) aaaCATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTTTAAATGTAAATTGCTTTTTCCATATAGTAAtttt > 1:430977/1‑300 (MQ=255) cATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCATGCCCGGCATCACAGTAATAACCCTCCAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGACTATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATAGTAAttttac > 2:217455/1‑297 (MQ=255) tcaaacaTAACCACCAATTCATTTACCTGGTAAATCTCAATCCCACAAACAAACTGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTCTACAATAGTAGAGCCTGCTCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTCTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATTCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCAc < 2:430987/296‑1 (MQ=255) gcaTAACCACCATTTCATTGCCATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAACGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATAACCTGAAACACTTTGATGCTTTACATAAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCCTATTGTAATTTTCCCTTTGTGTGGCTAGACTTTTACGtat > 2:237209/1‑301 (MQ=255) tttCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTGTCTTCTAAGAACTGCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTc < 2:251576/301‑1 (MQ=255) ttCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACACTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGtttttt > 2:121025/1‑299 (MQ=255) cATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTcc > 1:93133/1‑300 (MQ=255) gTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGaa > 1:218195/1‑169 (MQ=255) gTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCACGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGAAACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTTTAACTGTTTTTTAATCTTTCCCCAtt > 2:149954/1‑300 (MQ=255) atatCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTTACAAGAGTAGAGCCTGCCCTGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGACTAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATAAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTATATGGCTTTTTCCATATCTTAATTTTCTCTTAGCCAGTATATCCTTTTCCTTTTCAATGTTTTTTCATATTTCCTCagtcatt > 2:180837/1‑295 (MQ=255) aacCGGATAAGGCATAACAAACCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAAGTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGGTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGt < 2:72979/301‑1 (MQ=255) aGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATg < 1:344482/133‑1 (MQ=255) aGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCATTTGAAAGTaa > 1:152935/1‑301 (MQ=255) ggCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATCATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTGGATTGTAAATGTAAATGTCTTTTTCCATATCTTAATTTTCCCTTAGCGAGGATCGCCTTTCACGTATAATTTTTTTTTAATCTTTCCCCATTAATTCATCTTTACAGTTCATTTAAAATTAAt > 1:321007/1‑301 (MQ=255) ggCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCATCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCATGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTATCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTATTCTTTCACCATGACTTCATCATTAGCGTTCGGTTGAAAGTAAt > 2:81648/1‑301 (MQ=255) cttctAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAACATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCTAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCTTTTAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGTATTTTTa > 1:149163/1‑301 (MQ=255) tctAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCATCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAACGTATTCTGCAATGGGGATTTTTAAt > 2:247004/1‑301 (MQ=255) tCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGt > 2:68243/1‑268 (MQ=255) tCATTTATCCCGAAATGAATTAATTGGGATGTGGACAAGAGGAGAGACTGCACGGAATCAAATTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAAGAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATTCTTTACATCAAAATGTCTGGGATTGTAAATGTAAATGGCTGTTTCAATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTGTTCATCTTTCCCCATTAATTCATCATTAGCGGTCAGTGGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCatga < 2:149164/301‑1 (MQ=255) tCAGTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGt < 1:68243/268‑1 (MQ=255) cATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGACTTCATCTTTAGCGTTCAGTTTAACGTAATCTGCATTGGGGATTTTTAATGGAc > 2:372104/1‑300 (MQ=255) cATTTATCCCGAAAATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTATGAATAAGAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGAc < 1:372095/300‑1 (MQ=255) gctcggagatgtgtataagaaaaaTGTTGACAAGAGTAGAGACTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGGTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCGTTGATTGTAAATGTAAATTGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGtt < 2:227450/277‑1 (MQ=255) aaTATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GCATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCATTTACAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTca > 1:144746/1‑300 (MQ=255) aaTATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGCGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCATTGGGGATTTTTCATTGACTCTTGTTTTTCTTTTTc > 1:226294/1‑300 (MQ=255) aaTCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTAAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGTATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATACCTGTTTTTTCATCTTTCACCATGAATTCATCTTTAGCGTTCAGTTGCAAGTAATCTGAAATGGTGATTTTTAGTGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGAtt > 1:64273/1‑301 (MQ=255) aaTCAATTGGGATGTTGAAAAGAGTAGAGCCTGACCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGGTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATtcatca < 1:119399/232‑1 (MQ=255) tttGGGATTTTGAAAATAGTAGGTCCCGCCCTGCATCAAAGTAATAACCCTTAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTTAATATCCTGAGACACTTGTATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGa < 1:1381/300‑1 (MQ=255) aTTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAACATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGACTTCATCATTAGCTTTCAGTTGAAATTACTCTGCAATTGGGTTTTTTATTGACCTCATGTTTTTCTTTTTCCTGTTTAATGa > 1:172693/1‑301 (MQ=255) aTTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCAc < 2:7343/189‑1 (MQ=255) aTTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCAc > 1:7343/1‑189 (MQ=255) tggATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGGAATAACCCTCAAAGGTTTGTCTAT‑‑‑‑‑‑TAATAAGAATAAGGTTTGAATATCCTGAGACACGTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCAGATCGTAATGTTCCCTTAGCTAGTATAGCCTGTCACGTAGAACTGTTGTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATGAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAAGGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAAc < 2:64273/299‑1 (MQ=255) ggATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCCTGAATTCATCATTAGCGTTCCGTTGACAGTAATCTGCAATGGGAATTTTTAATGGACTCATTATGTTCGTTTTCCAGATTaagtaccat > 2:17080/1‑294 (MQ=255) tGTTGAAAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTAc < 1:75725/301‑1 (MQ=255) gTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCCAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTCGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGTTTTTTAATGGACTCATGTTTTTctgtcttttttacaccttttact > 1:227445/1‑276 (MQ=255) gTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACTACCAGTa > 1:27569/1‑299 (MQ=255) aaaaGAGTAGAGCCTGACCGGAATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTc < 2:152936/299‑1 (MQ=255) aCAAGAGTAGTGCCGGACACGCATGAAATTAATAACACTCAAATGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATTAGAATAATGTTTTAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACAGCAAAAGGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCTTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTc < 2:226299/301‑1 (MQ=255) cAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTAAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCATGATTAACGAACattcattttc > 1:408704/1‑291 (MQ=255) gagTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCCTGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGAACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAAAGACCATTACTCTTCCaga > 1:1075/1‑301 (MQ=255) gagTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGCAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTACAGATTAACGAACAGTATTCTTCCaga > 1:430234/1‑301 (MQ=255) gagTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTACTCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATTATGTTCTTTTTCCAGTTTAACAACAAGTACTCTTCCaga > 1:136105/1‑301 (MQ=255) gagTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTACTGGACTCTTGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTTCTCTTCCaaa > 1:165120/1‑299 (MQ=255) gagTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCaga > 1:237888/1‑301 (MQ=255) ggagggCCTGACCGGCAGAAAAGTAAGAACCCTCAATGGTTGTTCTAG‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTGGAATATCCTGGGACACGTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCagag < 1:6266/295‑1 (MQ=255) ccGGCAGCAAAGTAATAAACCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTGTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGttt < 1:403633/301‑1 (MQ=255) taaCCCTCAAAGGTTGTTTTAT‑‑‑‑‑‑GAAGAAGAATAAGTTTGGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGGCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCGCGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATCTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGAt < 1:217450/301‑1 (MQ=255) catcccTCAAATGTTTTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTTATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGAt < 1:18389/298‑1 (MQ=255) cccTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAATAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCg < 2:339238/186‑1 (MQ=255) cccTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCGTTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCTGATTACCGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACTTCGGCTTCgttctt > 2:18389/1‑296 (MQ=255) cccTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCg > 1:339230/1‑186 (MQ=255) ggTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGACCAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTCATGcttt > 2:135753/1‑299 (MQ=255) tCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGTCACTTTGATTCTTTACATCAAAATTTTTTTGATGGTAAATTGAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCTCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGTGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTtat < 2:172694/300‑1 (MQ=255) ttAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGGGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATag < 2:237893/300‑1 (MQ=255) cTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGAGACTTTGAGGCGTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAAGGTAAATGGCTTGTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAACCTTTCACGTATAAATGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATag < 2:435225/301‑1 (MQ=255) cTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGct > 2:63937/1‑290 (MQ=255) cTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGct < 1:63937/290‑1 (MQ=255) cTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTAATCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGTTTGATGCTTTCTTTTATag > 2:200538/1‑301 (MQ=255) aT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGCCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCACTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGTGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACG‑ACCGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGCTTGATGCTTTCTTTTATAgaga > 2:133707/1‑301 (MQ=255) | CATAATTGTTTGTCCTTCTTTGTTACCTCTTAGGTTCTGCTCTCTTGTGAGTATGGGTTTATAATGATGTCATCCGGTACATTAACACGGTTGGAAACATCTGTTTTGCGGAGCACTGGCAGCATAACCACCATTTCATTGACATGGTAAATATCAATCCAACAAACAACCGGATAAGGCATAACAATCCCCTTTCTTCTAAGAACTTCATTTATCCCGAATATAATCAATTGGGATGTTGACAAGAGTAGAGCCTGCCCGGCATCAAAGTAATAACCCTCAAAGGTTGTTCTAT‑‑‑‑‑‑GAATAAGAATAATGTTTGAATATCCTGAGACACTTTGATGCTTTACATCAAAATGTCTTTGATTGTAAATGTAAATGGCTTTTTCCATATCGTAATTTTCCCTTAGCGAGGATAGCCTTTCACGTATAACTGTTTTTTCATCTTTCCCCATGAATTCATCATTAGCGTTCAGTTGAAAGTAATCTGCAATGGGGATTTTTAATGGACTCATGATGTTCGTTTTCCAGATTAACGAACAGTACTCTTCCAGAGTTACTTCTGTTTTACCTCGGCTTCGATTGATGCTTTCTTTTATAGAGA > NC_000913/293916‑294510 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |