| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,396,100 | Δ3 bp | 1.8% | coding (36‑38/1338 nt) | amiB → | N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase II |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4396103 = | 166 (1.230) | 3 (0.020) | 3/532 | NT | 1.8% | coding (39/1338 nt) | amiB | N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase II |
| ? | NC_000913 | = 4396099 | 163 (1.250) | coding (35/1338 nt) | amiB | N‑acetylmuramoyl‑l‑alanine amidase II | |||||
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGTTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGATATCAAACAAACGGGCGTGATTCAGGGACTGCCGTTGTTGTTCAGCGGCAATAATCTGGTGAAGGCGATTCGCTCTGGAACGCCTAAAGATGCACAAACGCTACGGCTGGTGGTCGATCTTACCGAAAACGGTAAAACCGAAGCGGTGAAGCGG > NC_000913/4395805‑4396403 | acttaatggtctatcactttgatttgtaccgccttgccgatcccgaggagctggagtttatggggatccgcgattattttgccaacgatgccatctgcctggtggagtggccacaacaaggtacaggtgttcttcctgacccggatgtcgaaatacacattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacg < 2:60043‑M1/1‑1 (MQ=255)acttaatggtctatcactttgatttgtaccgccttgccgatcccgaggagctggagtttatggggatccgcgattattttgccaacgatgccatctgcctggtggagtggccacaacaaggtacaggtgttcttcctgacccggatgtcgaaatacacattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagtgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggatgatgtatcgcatcagaaattggttggtagcgacg < 1:120043‑M1/1‑1 (MQ=255)acttaatggtctatcactttgatttgtaccgccttgccgatcccgaggagctggagtttatggggatccgcgattattttgccaacgatgccatctgcctggtggagtggccacaacaaggtacaggtgttcttcctgacccggatgtcgaaatacacattgattatcaggcacaaggccgtgaggcgcgcgtgagcgcggtttcctctgcgggtgaattgttgctggcgcgtttagccggttaacctttgaaaggtggcgggacgatgtatcggctcagaaattgggtggtagcgacgc < 1:1014295‑M1/2‑1 (MQ=255) gTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGTTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGCGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCAAAAGGCCGTGCGGCGCGCGTGAGTTCGGTTTCCTCTGAGGGGGAATTGTTGCTGGCGCGTTTATCGTGTTAACCTTTGAACGGTTGCGGGAAGAGTTATCTCCTCAGAAATTGGTTTGTAGAGCCgctgctgctg > 1:678630/1‑300 (MQ=255) 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gttggtAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCGGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGATATCAAACAAACGGGCGTGATTCAGGGACTGCCGTTGTTGTTCAGCGGCAATAATCTGGTGAAGGCGATTCGCTCTGGAACGCCTAAAGATGCACAAACGCTACGGCTGGTGGTCGATCTTACCGAAAACGGTAAAAc < 1:850247/300‑1 (MQ=255) gttggtAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGATATCAAACAAACGGGCGTGATTCAGGGACTGCCGTTGTTGTTCAGCGGCAATAATCTGGTGAAGGCGATTCGCTCTGGAACGCCTAAAGATGCACAAACGCTACGGCTGGTGGTCGATCTTACCGAAAACGGTAAAAc < 2:720298/300‑1 (MQ=255) GCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGATATCAAACAAACGGGCGTGATTCAGGGACTGCCGTTGTTGTTCAGCGGCAATAATCTGGTGAAGGCGATTCGCTCTGGAACGCCTAAAGATGCACAAACGCTACGGCTGGTGGTCGATCTTACCGAAAACGGTAAAACCGAAGCGGTGAAGCgg < 2:356088‑M1/301‑1 (MQ=255) | TAATGGTCTATCACTTTGATTTGTACCGCCTTGCCGATCCCGAGGAGCTGGAGTTTATGGGGATCCGCGATTATTTTGCCAACGATGCCATCTGCCTGGTGGAGTGGCCACAACAAGGTACAGGTGTTCTTCCTGACCCGGATGTCGAAATACACATTGATTATCAGGCACAAGGCCGTGAGGCGCGCGTGAGTGCGGTTTCCTCTGCGGGTGAATTGTTGCTGGCGCGTTTAGCCGGTTAACCTTTGAAAGGTGGCGGGATGATGTATCGCATCAGAAATTGGTTGGTAGCGACGCTGCTGCTGCTGTGCACGCCGGTGGGTGCCGCGACGCTCTCTGATATTCAGGTTTCTAACGGTAATCAACAGGCGCGGATAACGTTGAGTTTTATTGGCGATCCTGATTATGCGTTTAGCCATCAAAGCAAACGCACCGTGGCGCTCGATATCAAACAAACGGGCGTGATTCAGGGACTGCCGTTGTTGTTCAGCGGCAATAATCTGGTGAAGGCGATTCGCTCTGGAACGCCTAAAGATGCACAAACGCTACGGCTGGTGGTCGATCTTACCGAAAACGGTAAAACCGAAGCGGTGAAGCGG > NC_000913/4395805‑4396403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |