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ctctAATGGATATTCTTTTGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGTTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGAAGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATCAATGCCTAATTTTACGTCCACACCTTCa > 2:397982/1‑301 (MQ=255) ctctAATGGATATTCTTTTGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCACTTGGAAGTATGGAAATTCATGGCGTTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTACAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGCGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATAAATGCCTAATTTTACGTACA‑ACCtttca > 1:901401/1‑298 (MQ=255) tctAATGGATATTCTGTTGTAAAAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGATCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTTCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGTTCCGGCTCAAATTTGAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATCAATGCCTAATTTTACGTCCACACCTTCaa < 1:120452/301‑1 (MQ=255) 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GATCATTAATCCGTACTCATTATATTTTTCACTTGATAAAGAGCGGCAGATATCACTTGATGCATATCATAATATTTATACTCGGCCAAACGCCCGCCAAATATAACCTTGTCTTCTCTGCTAGCTAACTCTCTATATTTCTTAAAAAGCTCCATGTTTTTATTATCATTAACTGGATAGTAGGGTTCGTCGCCAACTTTCCACTCTAATGGATATTCTTTTGTAACAACCGTATGCTTTGTCTCAACATAGTCAAAATGTTTATGCTCAATTATTCTGGTATATGGTACATTAGCATCAGTGAAATTTATTACTGCATTCCCTTGGAAGTTTGGAAATTCATGGCGTTCCGTCTCAAATTTTAAAGAGCGATATTCTAACGCTCCAAACCTATAGTCGAAGTACTGATCAATGGGTCCAGTGTAGATGATTCTATGGGCTTTACTCGCTAGAGAATCTTTGTCTTTCAAAAAATCAATGCCTAATTTTACGTCCACACCTTCAAGCATTTTTTCAATAAGCTTAGTGT > NC_000913/2107221‑2107749 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |