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cATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGc > 2:754171/1‑145 (MQ=255) cATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGc < 1:754147/145‑1 (MQ=255) cATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCaa < 1:238802/197‑1 (MQ=255) cATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCaa > 2:238808/1‑197 (MQ=255) 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gACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAACAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCAATGGCTTCCATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGAGACCTCCCGCCTTAACACTGTGCTGGATTACATTTACGCGGTGACGGCa > 1:1164747/1‑301 (MQ=255) tttGATTATCGGTAGAAACAGAACATCCAGGGGTGATGTTTGTAGGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCAATGGCTTCTATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGAGACCTCCCGACTTAACACTGTGCTGGATTACATTGACGCGGTGACGGCAACAGATAcc < 1:401313/301‑1 (MQ=255) ttCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCAATGGCTTCCATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGAGACCTCCCGACTTAACACTGTGCTGGATTACATTGACGCGGTGACGGCAACAGATACCAGCAc < 2:986515/301‑1 (MQ=255) gATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCAATGGCTTCCATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGAGACCTCCCGACTTAACACTGTGCTGGATTACATTGACGCGGTGACGGCAACAGATACCAGCACcgcg > 2:332140/1‑300 (MQ=255) aTAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCAATGGCTTCCATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGCGACCTCCCGACTTAACACTGTGCTGGATTACATTGACGCGGTGACGGCCACAGATACCTGCCCCgcgc > 2:1039844/1‑300 (MQ=255) acacATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGAGTCGCAGTAGATGAAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGGTGGATACTGCAAGGGCTTCCATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGAGACCTCCCGACTTAACACTGGTCTGGATTGCATTGACGCGGTGGCGGCAAAGGATACCAGAACCGCGCCGGAt > 2:1126225/1‑301 (MQ=21) cacaTAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATACATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCCGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCAATGGCCTCCATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGAGCCCGCCCGACTTAACACTGTGCTGGATTACATTGACCCGGTTACGGCAAGAGATACCAACACCGCGCCGGATg > 1:143555/1‑301 (MQ=255) cacaTAACATCCAGGGGTTATGTTTGCATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCAATGGCTTCCATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGAGACCTCCCGACTTAACACTGTGCTGGATTACATTGACGCGGTGACGGCAACAGATACCAGCACCGCGCCGGATg > 1:202925/1‑301 (MQ=255) | CTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATTATCGTTATAAGTGATTCCTGTCTTATACTTAACATAAGGACTTCCACTTTGATTCTCGATAGACACATAACATCCAGGGGTTATGTTTGTATGCGTCCCGCGACTATCGCCCCATTAACGCCATACGATAAATGGGATGGTGAGAAATGGGTGACGGATACCGAGGCACAGCATAGCGTCGCAGTAGATGCAGCAGAAGCACAGCGCCAGTCGCTGATTGATACTGCAATGGCTTCCATTAGTCTGATTCAACTGAAATTACAGGCTGGGCGGAAGCTGATGCAGGCAGAGACCTCCCGACTTAACACTGTGCTGGATTACATTGACGCGGTGACGGCAACAGATACCAGCACCGCGCCGGATG > NC_000913/2470497‑2471076 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |