Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,304,523 | G→C | 7.6% | intergenic (+130/+585) | eco → / ← mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
Read alignment evidence... | ||||||||||
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* | NC_000913 | 2,304,523 | 0 | G→C | 7.6% | 5.0 ‑0.8 0.0 | 71 | intergenic (+130/+585) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): new base (5/2): ref base (34/30): total (39/32) | ||||||||||
Fisher's exact test strand distribution p-value = 4.46e-01 | ||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support polymorphism than reference p-value = 1.00e+00 |
CACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTATACGCCAGACAATGTAGATGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAATTGACAACGCGGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCG‑ACATCCAACGTCCGAGCCGGT > NC_000913/2304255‑2304808 | caacgcgGATCTGGGCGATGCTGGAATGTGGCGTTAAAACAGGAAGCTGCCGATCGTGGTGTGTACGCCAGACAATGTATGTGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAAGTGACAACGGGGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGGGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAAAGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCAcgccg < 2:138461/298‑1 (MQ=25) 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cgccgcacgggtggcacaacgacctgggcGGTTGCCTGGTGGGAGCGTGGCGCGGCTTATCAG‑GCCTAAC‑CGGC‑CGTGAAGGGAGGCACCCCGTAGGTCCGGCAAGGCGGTCACGCCGCATCGGCCATCCACCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGGGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCGACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCAGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGc < 2:174337/272‑1 (MQ=11) ctCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:174674/300‑1 (MQ=39) aTCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCGTAGGCGAGGCTGGCGCGTCTTATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:175649/301‑1 (MQ=255) cAACGCCCGAGCCGGTGGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTGATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:94881/301‑1 (MQ=39) cccGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCGTATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAg < 1:457596/301‑1 (MQ=38) gTTGCTTGAGGCGAGGTGGGCCCGTCTTCTCAG‑GGCT‑CA‑CCCCGTGTGAAGTGCGCCACACGGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATa < 2:60000/300‑1 (MQ=11) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATa < 1:653811/300‑1 (MQ=38) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAG‑GCCTAAA‑CGGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGACCGAGCGTGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGTTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCTACCCCGTAGGTTGGATa < 1:27908/300‑1 (MQ=255) tATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAACCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTCACGCCCAAGCCGGTTACCTGATGCACCGCTGGCGCGTCCTATCTGGCCTAACCCGCTGTGACATGCCCAACCCCCTACGCAGGCTCACGCGTTTACGCCGCCTCCG‑ACATCGaa > 2:591878/1‑301 (MQ=14) tATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTGCGCCGCATCCG‑ACATCCaa > 1:17185/1‑301 (MQ=39) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGATAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCTCGTCTTGTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCCTAGGTCGGATAAGACGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTTATGCAACACAGGCGCGTCTTATCCTGCCTTCACCGCGCCGCAGTTCCCCCCCCCTAAGTGTAGATAAGGCGGGTACGACCCACCCGCACACCCAGCGt > 2:415545/1‑300 (MQ=11) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGGCGCCGGCGCCTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTACGTCGGATAAGGCGGTTACGACGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGCTGCGGCGTCGGCTCGTCTTATGCAGCCTACAACGCGGTGCAGTGCTCCCCCCAGCTGTGTGGCACAGGCGGATACGACGCCGCCG‑CCAACCAACgca > 2:661816/1‑298 (MQ=11) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTacac > 2:531147/1‑122 (MQ=40) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTacac < 1:531158/122‑1 (MQ=40) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTacac > 1:80468/1‑235 (MQ=39) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCG‑ACATCCAACGTc > 1:432382/1‑300 (MQ=40) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCG‑ACATCCAACGTc > 1:240361/1‑300 (MQ=40) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTACGTCGGATAAGGCGGTTCCGCCGCATCCGACATCTAACGCCCTAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGACCGTCTTATCAGGCCTACACCGCGGTGAAGTGCTCCACCCCGTACGTTGGATAAGTCTGTTCCCCCGCATCCG‑ACCTCCacactc > 2:943560/1‑295 (MQ=14) g‑gCCTACA‑CCGC‑TGAGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCACCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTacac < 2:80468/235‑1 (MQ=255) aca‑cCGC‑TGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:765738/127‑1 (MQ=255) aca‑cCGC‑TGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg > 2:765709/1‑127 (MQ=255) aca‑cCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCCCGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCTCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCG‑ACATCCAACGTCCGAGcc < 1:337253/301‑1 (MQ=255) aca‑cCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATcc > 2:414301/1‑175 (MQ=255) aca‑cCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATcc < 1:414308/176‑2 (MQ=255) ccGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCG‑ACATCCAACGTCCTAGCCGGt > 1:871851/1‑301 (MQ=255) ccGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCG‑ACATCCAACGTCCGAGCCGGt > 1:478991/1‑301 (MQ=40) gTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCATGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 1:148459/227‑1 (MQ=255) gTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCCTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg > 2:148458/1‑227 (MQ=255) | CACCGCGTATCTGGGCGATGCTGGAATGCTGCGTTACAACAGCAAGCTGCCGATCGTGGTGTATACGCCAGACAATGTAGATGTGAAGTACCGCGTCTGGAAGGCGGAAGAGAAAATTGACAACGCGGTAGTTCGCTAAACTGCCGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAG‑GCCTACA‑CCGC‑TGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCG‑ACATCCAACGTCCGAGCCGGT > NC_000913/2304255‑2304808 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |