| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 3316548 = | 73 (1.100) | 85 (1.330) | 77/288 | 0.0 | 58.1% | coding (979/1488 nt) | nusA | transcription termination/antitermination L factor |
| ? | NC_000913 | = 3399212 | 52 (0.810) | coding (767/1104 nt) | mreC | cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC | |||||
GTGGGATGATAACCCGGCGCAGTTCGTGATTAACGCAATGGCACCGGCAGACGTTGCTTCTATCGTGGTGGATGAAGATAAACACACCATGGATATCGCCGTTGAAGCCGGTAACCTGGCGCAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3316702‑3316548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgtcCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCAGACG < NC_000913/3399212‑3399063 GTGGGATGATAACCCGGCGCAGTTCGTGATTAACGCAATGGCACCGGCAGACGTTGCTTCTATCGTGGTGGATGAAGATAAACACACCATGGATATCGCCGTTGAAGCCGGTAACCTGGCGCAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTG > 2:484361/1‑151GTGGGATGATAACCCGGCGCAGTTCGTGATTAACGCAATGGCACCGGCAGACGTTGCTTCTATCGTGGTGGATGAAGATAAACACACCATGGATATCGCCGTTGAAGCCGGTAACCTGGCGCAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTG < 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2:427973/151‑1 CGTAACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGC < 2:411445/151‑1 AACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGG > 1:1059517/1‑151 ACGGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGT < 2:1024712/151‑1 aGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGGGCATCGTGTTGCTAATGAAAGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTAT > 2:85406/2‑151 GGTCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTAT > 1:741743/1‑151 TCAGAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGGAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTG > 1:687338/1‑151 CAGAACGTGCGTCCGACGGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGC < 2:993225/151‑1 GAACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCT < 1:584380/151‑1 AACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTT > 2:499163/1‑151 ACGTGCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTC < 2:98244/151‑1 GCGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCA < 2:1059606/151‑1 CGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCAG < 2:532808/151‑1 CGTCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGGATTGCCTTCGCC > 2:222393/1‑149 TCCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCAGAC > 1:227642/1‑151 TCCGACTGCACGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCAGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGCAGAGGGGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGAATTGCCTCCCCCAGA > 2:948863/1‑150 CCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCAGACG < 2:325294/151‑1 GTGGGATGATAACCCGGCGCAGTTCGTGATTAACGCAATGGCACCGGCAGACGTTGCTTCTATCGTGGTGGATGAAGATAAACACACCATGGATATCGCCGTTGAAGCCGGTAACCTGGCGCAGGCGATTGGCCGTAACGGTCAGAACGTGCGTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3316702‑3316548‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgtcCGACTGCAGGGCTGCAACGTTTGCGTTATCTGCTGCTGCTGTGGGGGGCAGATCGTAACGGCGCTAACCCGATGACGCCGGAAGAGGTGCATCGTGTTGCTAATGAACGTCTGATGCAGATGATGCCGCAGGTATTGCCTTCGCCAGACG < NC_000913/3399212‑3399063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |