Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,326,450 | 0 | T | G | 43.6% | 133.2 / 14.6 | 78 | G114G (GGT→GGG) | atoB | acetyl‑CoA acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (7/37); new base G (34/0); total (41/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.75e-15 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTACCGCC > NC_000913/2326302‑2326594 | cGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTAt < 2:695018/151‑1 (MQ=255) cgcgTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATgg > 2:326648/1‑150 (MQ=255) gcgTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGa < 1:1353582/150‑1 (MQ=255) cAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGgaaa > 2:43349/1‑149 (MQ=255) gCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGa < 2:1122978/151‑1 (MQ=255) cACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAg < 2:957115/151‑1 (MQ=255) gTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTa < 2:313627/151‑1 (MQ=255) gTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTa < 1:462390/151‑1 (MQ=255) aaaaGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATGAGTTTAGccc > 2:723843/1‑151 (MQ=255) aaaGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGcccc < 1:963024/151‑1 (MQ=255) aaaGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGcccc < 2:1064204/151‑1 (MQ=255) gggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCtact < 1:245302/151‑1 (MQ=255) gggCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAAATGAGGTTAGCCCCCtac > 2:987222/1‑150 (MQ=255) gCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCtactta < 2:624887/151‑1 (MQ=255) tGGCAGAAACGGAGTGCGGATTCACGGTAAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGAGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATGAGTTTAGccccccaat > 1:806918/1‑143 (MQ=255) ggCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCtacttact < 2:745427/150‑1 (MQ=255) aaCGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGAAAAAATTGATTTAGCCCCCcactttcttg > 1:7340/1‑144 (MQ=255) aaCGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGGTTAGCCCCCTACTTACTCGATg > 2:935207/1‑149 (MQ=255) ggTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGGTTAGCCCCCTACTTTCTCGATg > 1:1214327/1‑146 (MQ=255) gtgtGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAg < 1:822378/151‑1 (MQ=255) tgtgCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCaaaa > 2:1096044/1‑149 (MQ=255) gttcgtaTTCACGGTCAATCAACTATTTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGTCGCTTGCCGCCCATGCCATTCAGGCAGGTCAGGCCCAATGCATTGTGGCGGCGGATATGTAAAATATGAATTTACCCCCCTACTTACTCCATGCaaaa < 1:654554/142‑1 (MQ=255) gCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCAc < 1:492344/150‑1 (MQ=255) gCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCAc < 2:993285/150‑1 (MQ=255) cGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAAATGAGTTTAGCCCCCTACTTAATCGATGCAAAAGCAc > 2:721041/1‑149 (MQ=255) ggATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAAATTTGGTTCGGCCCCcacttatttgcaggcaaa > 1:753351/1‑132 (MQ=255) aTTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGctct < 2:162488/151‑1 (MQ=255) ttCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAACACGctct > 2:1020577/1‑150 (MQ=255) cACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTgg > 2:292425/1‑150 (MQ=255) aCGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGACCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTg > 1:636125/1‑148 (MQ=255) aCGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAAAATGAGTTTAGCCCCCCACTTACTCGGTGGAAAAGCACGCTCTGGtt > 1:1070384/1‑151 (MQ=255) ggTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTAt > 2:636855/1‑151 (MQ=255) aTAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCt > 2:442717/1‑151 (MQ=255) aTAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGGTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGGTATCGTCt > 2:53488/1‑151 (MQ=255) tAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAACCCCCTACTTACTCGATGCAAAAACACGCTCTGGTTATCGTCtt > 2:1070886/1‑151 (MQ=255) tATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGGTATCGTCTTgg > 2:1380186/1‑148 (MQ=255) aTGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAc < 1:1040956/151‑1 (MQ=255) aTGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAc < 1:149639/151‑1 (MQ=255) tgtgGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGGGGTTTGCCCCCCACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGGTATTCTCtt > 1:915363/1‑144 (MQ=255) ggTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGttt < 1:720420/151‑1 (MQ=255) ggTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGGTTAACCCCCTACTTACTCGATGCAAAAACACGCTCTGGGTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGttt > 2:53498/1‑151 (MQ=255) tAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTGTGGAAAAAATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGGCAAAGCACGCTTTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGGTTATGAc > 2:292233/1‑151 (MQ=255) tAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATg < 1:43390/149‑1 (MQ=255) tAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGGAAAAGCACGCTCTGGTTATAGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGAc > 1:361590/1‑151 (MQ=255) aaaaGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACg < 1:427371/151‑1 (MQ=255) aaaGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGGTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAACACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGGTTATGAc > 2:953900/1‑149 (MQ=255) aGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTaa < 2:338238/151‑1 (MQ=255) gtgtGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAAt < 2:274043/151‑1 (MQ=255) gtgtGGCGCTTGCCGCCCAAGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAAt < 2:1291906/151‑1 (MQ=255) gtgGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATcc < 2:1151989/151‑1 (MQ=255) ggCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTg < 2:415654/151‑1 (MQ=255) ggCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAAATGAGGTTAGGCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGAAAGCTCTGGGTATCGTCTTGGGGAC‑GGACAGGGTTATGaaggaaaaccg > 2:1087741/1‑141 (MQ=255) cgcTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTgcg < 1:752828/151‑1 (MQ=255) gcTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGAAAAAATGAGTTTTGCCCCCTCCTTACTCCATGCAAAAGCACGCCCTGGTTATCGGCTTGGAGAC‑GGACAGGGTTTTGACGTAATCCcgcg > 1:991880/1‑150 (MQ=255) gccgccCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGAt < 2:372241/150‑1 (MQ=255) gccgccCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGAt > 2:136207/1‑150 (MQ=255) gccgccCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGCGGCGGGGGGGGTGGGAAAATTTAGGTTAGCGCCCCAATTAATCGGTGCCCAAAGGCGGTCTGGTTTTCGTCTTTGAGAC‑GGGCAGGGTTATGAccaaaatcc > 1:1042461/1‑135 (MQ=255) cgccCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGGTGGGAAAAATTTGTTTAGCCCCCCACTTAATCCATGCAAAAACACGCTCTGGTTATTCTTTTGGGGACGGGAAAGGTTT‑TGACGTAATCCTGCGCGGTgg > 1:792224/1‑150 (MQ=255) cgccCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGAAAGGTTTATGAAGTAATCCTGCGCGATgg > 2:916676/1‑150 (MQ=255) cccAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCt < 2:571215/151‑1 (MQ=255) ggCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTTGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTTGTTATCGTCTTTGAGAC‑GGACAGGTTTATTACGTAATCCTTCGCGATGGcc > 2:1271719/1‑146 (MQ=255) ccATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTTCTCGATGCAAAAGGCCGCTCTGGGTATCGTCTTTGAGAA‑TGGCAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGGTGGCCTGgtgt > 1:180844/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTgcg > 2:939726/1‑151 (MQ=255) caggcaggTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCCACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGGGAC‑GGACAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGcc > 2:912278/1‑150 (MQ=255) gTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATg < 1:1098580/150‑1 (MQ=255) aGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTTTTCGATGCAAAAACACGCGCTGGGTATTGTCTTGGAGAA‑GGACAGGGTTATGACGGAAACCCGCGCGCTGGCCTGATGGGCGCCACCCATgg > 1:515532/1‑148 (MQ=255) gcAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCat < 2:569557/151‑1 (MQ=255) gcAGAGCATTGTGGCGGGGGGGATGGGAAAAATGAGTTTATCCCCCGACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGTGAC‑GGAGAGGTTTATGACGCAAACCTGCGCGGTGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGtttt > 2:22458/1‑146 (MQ=255) cAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCata < 1:664560/151‑1 (MQ=255) agagCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCatat < 2:844386/151‑1 (MQ=255) agagCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCatat < 1:1119289/151‑1 (MQ=255) gCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGGTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATggg > 2:952695/1‑151 (MQ=255) cATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATgggg < 2:577267/151‑1 (MQ=255) aTTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGa < 1:635938/151‑1 (MQ=255) aTTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGa < 2:1375802/151‑1 (MQ=255) gtgGCGGGGGGGATGGAAAAAATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCCCTGGTTATCGTCTTGGGGAC‑GGGCAGGGTTTTGACGTAATCCTTCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATggggggt > 1:270554/1‑147 (MQ=255) gCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTAccg > 1:209531/1‑151 (MQ=255) ggggggTATCGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTAccgcc > 2:303400/1‑151 (MQ=255) | CGGCGCGTCAGGCACTGTTAAAAAGCGGGCTGGCAGAAACGGTGTGCGGATTCACGGTCAATAAAGTATGTGGTTCGGGTCTTAAAAGTGTGGCGCTTGCCGCCCAGGCCATTCAGGCAGGTCAGGCGCAGAGCATTGTGGCGGGGGGTATGGAAAATATGAGTTTAGCCCCCTACTTACTCGATGCAAAAGCACGCTCTGGTTATCGTCTTGGAGAC‑GGACAGGTTTATGACGTAATCCTGCGCGATGGCCTGATGTGCGCCACCCATGGTTATCATATGGGGATTACCGCC > NC_000913/2326302‑2326594 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |