| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,693,390 | 0 | T | G | 44.0% | 36.3 / 146.6 | 91 | K616T (AAA→ACA) | bcsA | cellulose synthase, catalytic subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/23); new base G (25/15); total (53/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
AGCATCTCGGTTGGCGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATGCGGC > NC_000913/3693240‑3693536 | aGCATCTCGGTTGGCGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAAtt < 1:1003616/151‑1 (MQ=255)aGCATCTCGGTTGGCGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAAtt < 2:675720/151‑1 (MQ=255) cGGTTGGCGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGcc < 1:717583/148‑1 (MQ=255) cGGTTGGCGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGc < 1:213741/147‑1 (MQ=255) cGGTTGGCGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGACCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCttt < 1:681359/151‑1 (MQ=255) gCGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCgg < 1:499075/151‑1 (MQ=255) cGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCggg > 2:467672/1‑151 (MQ=255) cgcCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGccacca < 2:1011429/151‑1 (MQ=255) gATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTc > 1:459927/1‑151 (MQ=255) tGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCgg > 2:1084929/1‑151 (MQ=255) gCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCggt < 2:145722/151‑1 (MQ=255) ccTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCggt > 2:372976/1‑150 (MQ=255) cGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCg < 2:31419/151‑1 (MQ=255) cGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCg < 2:674742/151‑1 (MQ=255) cGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCg > 1:1084734/1‑151 (MQ=255) gCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCg > 1:1125277/1‑150 (MQ=255) cAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGa < 1:1108825/150‑1 (MQ=255) aaCGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGata < 2:645501/151‑1 (MQ=255) aaCGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGat > 2:730584/1‑150 (MQ=255) aCGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGatat < 2:159596/151‑1 (MQ=255) cccACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATAcc < 2:632987/151‑1 (MQ=255) ccaccaGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATAcc > 1:1104507/1‑150 (MQ=255) caccaGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCAc < 2:1061337/151‑1 (MQ=255) ccaGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGc > 1:211594/1‑151 (MQ=255) caGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGcc > 1:828058/1‑151 (MQ=255) ggTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCa < 1:744754/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGCGGTGCGATATACCACGCCAGCAcc > 2:922062/1‑151 (MQ=255) aGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCg > 1:320460/1‑151 (MQ=255) aGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCg > 1:97580/1‑151 (MQ=255) gCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGt > 2:250592/1‑151 (MQ=255) aGGACAAGGAAGATGTAGCGCCGCGAGATCCCCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGttt < 2:224159/151‑1 (MQ=255) ggACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTc > 1:1083688/1‑151 (MQ=255) gACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCg > 2:303230/1‑151 (MQ=255) cAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGt > 2:98404/1‑150 (MQ=255) aaGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAg < 1:609800/151‑1 (MQ=255) aaGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAg < 2:798154/151‑1 (MQ=255) aaGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTa < 2:273496/150‑1 (MQ=255) gAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGAtt > 2:694967/1‑151 (MQ=255) 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ggCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGa < 2:420690/151‑1 (MQ=255) gCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGaa < 1:149753/151‑1 (MQ=255) cgcgAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGaa > 2:89986/1‑149 (MQ=255) gcgAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGaa > 2:588068/1‑148 (MQ=255) cgAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAag > 2:153773/1‑149 (MQ=255) agaTCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTg > 2:613451/1‑151 (MQ=255) agaTCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTg > 1:344207/1‑151 (MQ=255) gaTCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTgg > 2:467341/1‑151 (MQ=255) gaTCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTgg > 2:765938/1‑151 (MQ=255) aTCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGc > 2:147707/1‑151 (MQ=255) aCCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGat > 2:85828/1‑151 (MQ=255) cccAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGat < 2:424104/150‑1 (MQ=255) ccAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGatat < 1:205191/151‑1 (MQ=255) cAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGGTATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTGCACTCCAGAAAGAGTGGCGatat > 2:40412/1‑150 (MQ=255) aGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATAttt > 1:957171/1‑151 (MQ=255) 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tCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAgg > 2:1115704/1‑151 (MQ=255) tttGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGc > 2:265671/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCAt < 1:976687/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTGACGTTAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCAt < 1:587718/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATg < 1:1026157/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATg < 1:921663/150‑1 (MQ=255) gCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATgg > 2:963920/1‑150 (MQ=255) ggTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATc > 2:548256/1‑151 (MQ=255) cGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATg > 1:948228/1‑151 (MQ=255) cGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATg < 2:1040357/151‑1 (MQ=255) gTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATGc > 2:962784/1‑151 (MQ=255) tAAATGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATGCgg > 2:581938/1‑151 (MQ=255) aaaTGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATGCGgc > 2:752409/1‑151 (MQ=255) aaaTGTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATGCGgc < 1:154564/151‑1 (MQ=255) aaTTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATGCGgc > 1:277070/1‑150 (MQ=255) | AGCATCTCGGTTGGCGGGCCATAGAAGTAGCGCCAGATGCCTACCGCAACGCCCACCAGGTTGAGCAGGACAAGGAAGATGTAGGGCCGCGAGATCACCCAGTCGACGTACTCTTCTTCCACCAGTCCACCTTTGGCGGTGACGTTAAATTTGCCTTTGTGCGGGTTAATCAGCGCCACCAGCGTCGGTGGTGCGATATACCACGCCAGCACCGTTTCGTAGATTTCACTCCAGAAAGAGTGGCGATATTTGCCCTGGATCTTGGAGTTGGTCAGGCTGGCATGGATCATATGCGGC > NC_000913/3693240‑3693536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |