Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 987,494 | 0 | T | G | 42.0% | 127.7 / 11.5 | 70 | intergenic (‑512/+91) | ompF/asnS | outer membrane porin 1a (Ia;b;F)/asparaginyl tRNA synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (7/33); new base G (29/0); total (37/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.54e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGTTTT > NC_000913/987352‑987640 | aGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATa < 2:583720/151‑1 (MQ=255) gACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAg < 1:527538/151‑1 (MQ=255) cATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGAt < 2:393894/151‑1 (MQ=255) tCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑aaaaaaa > 2:8887/1‑144 (MQ=255) cAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAATaaaattct > 2:424690/1‑144 (MQ=255) cAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAAAAGATTgtt > 1:806248/1‑149 (MQ=255) aGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGT‑AAATAAATTGCtt > 1:842435/1‑151 (MQ=255) gAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTg < 2:320931/151‑1 (MQ=255) gAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAAAAGATTGttt > 2:146753/1‑150 (MQ=255) aaTGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGG‑AAATaaagttatt > 2:768798/1‑141 (MQ=255) ccAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTa < 1:201500/151‑1 (MQ=255) ccAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTa < 1:1072964/151‑1 (MQ=255) ccAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑AAATAAATTTCttttttt > 1:821164/1‑145 (MQ=255) aaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑AAAAAAAATTCTTTACTTaacaa > 1:763249/1‑150 (MQ=255) aTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAATAAATATCTTTACTTtacaaa > 1:386981/1‑149 (MQ=255) tAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAATAAATTAGTTTTCTTtacaaaca > 2:856280/1‑150 (MQ=255) aTGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGT‑AAAAAGAATTCTTGTCTTaaaaaaaaaaaa > 2:534600/1‑144 (MQ=255) aTGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAAAAAATTATTTTACTTaaaaaaaaaaaa > 1:617418/1‑144 (MQ=255) 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tAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGGA‑AAAAAAATTGTTTTA‑TTTACAAAAAA‑AAAAATTTACAGAaaaaaaaaaa > 2:696355/1‑150 (MQ=255) aaGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaa < 2:629598/151‑1 (MQ=255) aaGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATaaaaa < 2:1070083/150‑1 (MQ=255) gAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAag < 1:97215/151‑1 (MQ=255) gAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑GAAAAAAATGTTTGAGTTAACAAAAAA‑AAAAAATTACAGAAAAGATaaaaaaa > 2:358903/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAaga < 1:609993/151‑1 (MQ=255) aaaaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAaga < 2:1063494/151‑1 (MQ=255) aaaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATATAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAagag < 2:103351/151‑1 (MQ=255) aaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAAAAAAATGCTTGACTTTACAAAAAG‑ATAAATTGACAGaaaaaaaaaaaaaaaa > 2:234948/1‑147 (MQ=255) aaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGcc < 2:504024/151‑1 (MQ=255) aaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGcc < 2:779173/151‑1 (MQ=255) aaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCa < 2:261248/151‑1 (MQ=255) aaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCa < 2:690902/151‑1 (MQ=255) aCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑CAAAAAATTTGTTTGCTTTAAAAAAAG‑AAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAGACa > 2:1093363/1‑150 (MQ=255) cTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGT‑AAAAAGAAAGGTTTGGTTAAAAAAAAA‑AAAAATTGACAGAAAAGATaaaaaaaaa > 2:956798/1‑143 (MQ=255) cTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGCAAAATAAATATC‑TGACTTTACAAAAAA‑AAAAATTTGCAGGAAAGAaaaaaaaaaa > 2:317885/1‑143 (MQ=255) tAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGATGA‑GAAAAAAATGCTTGTCTTAAAAAACAG‑AAAACAAGTTAGAAAAGATaaaaaaaaaaa > 1:202962/1‑142 (MQ=255) aaTCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGc < 1:93169/149‑1 (MQ=255) aaTCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑AAAAAGAATGCTTTACTTAAAAAAAAA‑AAAACTTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCgg > 2:859143/1‑151 (MQ=255) ccGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGgc < 1:789817/150‑1 (MQ=255) aaTAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑AAATAAATTGCTTTACTTTACAAACAA‑AAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAACCAGCGGGGGCTgg > 2:1016652/1‑151 (MQ=255) aGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑AAAAAAAATGCTTTACTTAACAAAAAA‑AAAAAATTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCGGGGGGTgg > 2:725538/1‑147 (MQ=255) aGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGGGC‑TAAAAGAATGGGTTACTTTTAAAAAAA‑AAAACTTTACACCAaaaaaaaaaaaaaaaaccgcg > 2:102201/1‑130 (MQ=255) gCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGaa < 2:92418/150‑1 (MQ=255) ggATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAAAAGATTGCTTTATTTTACAAAAAG‑AAAACTTTACAGAAAAAATAAAAAAAAAACCAGCGGGGGCTggggctt > 2:683668/1‑140 (MQ=255) aTTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑AAAAAAATTGCTTTACTTTAAAAAAAA‑ATAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGCGGGCGCGGGCTCtt > 2:324622/1‑143 (MQ=255) aGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTa < 1:638479/150‑1 (MQ=255) aGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTa < 2:538057/150‑1 (MQ=255) tttttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAAAAAAATGTTTTATTTTATAAACAA‑ATAAATTGACAGAAAAAATAAAAAAAAAAACAGCGGGCGGCGGGGCTTGTAGAAGGTaaa > 1:840434/1‑150 (MQ=255) tttttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑CAATAGATTGCTTTGCTTTACAAAAAA‑AAAAATTTACAGAAAAGAAAAAAAAAAAACCAACGGGGGCTGGCTCTTTTAGAAGCCaaa > 2:636504/1‑150 (MQ=255) ttttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGC‑AAAAAGATTTATTTGTTTTACAAAAAGAAAAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG‑CAACGGGCGCGGGCTCtttgggaagcgaaa > 2:1088455/1‑137 (MQ=255) ttGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTa < 1:367538/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGc < 2:55304/151‑1 (MQ=255) aTGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGT‑AAATAGAATTCTTTACTTTAAAAACAA‑AAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACGGGCGGTGGGTCTTGAAAAAGCTAAATTAAAAGATgg > 2:888/1‑148 (MQ=255) gTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGtt < 2:613019/150‑1 (MQ=255) ttGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAAAAAAATGCTTTACTTTAAAAAAAA‑AAAAATTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAGGGGGCGGGGTCTTGAAAACGCCAAATTAAAAACTGGCggt > 2:678512/1‑147 (MQ=255) gTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑CAATAAATTTCTTGACTTAACAAAAAA‑AAAACATTACAAAAAAGAAAAAAAAAAAAACAACGGGCGCCGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAAAAGCTGGGGtttaccgg > 2:569119/1‑142 (MQ=255) aaTATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTAc < 2:615622/151‑1 (MQ=255) atTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTGTG‑AAAAAGATTTCTTTACTTAAAAAACAA‑ATAACTTTACAGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAACGGGCGCCGGCTTTTTTAGACGCTAAAATAAAAACAGGCGGTACGCGCAgg > 1:763238/1‑145 (MQ=255) tCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTgg < 1:903187/150‑1 (MQ=255) aaCAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACg < 1:295520/150‑1 (MQ=255) aCAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGGTGG‑AAAAAAAATTGTTGACTTTACAAAAAA‑AAAACATGATCGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACGGGGGCCGGCGCTTTGAAAAGCTAAATTAAAAACTGGGGTTATGCGGaagaccgggggacgg > 2:1038494/1‑136 (MQ=255) aTGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCacgtac < 1:983710/151‑1 (MQ=255) c‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGttt > 1:67014/1‑151 (MQ=255) c‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGttt > 1:804000/1‑151 (MQ=255) c‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGttt < 1:575101/151‑1 (MQ=255) ggggTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGtttt < 1:428410/151‑1 (MQ=255) | AGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGC‑GGGGTTGC‑AAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAG‑ATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGGCTCTTGAAGACGCTAAATTAGAAGCTGGCGTTACGCGGAGTACGTGGGAACGGAATCACATCACGTACGTTTT > NC_000913/987352‑987640 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |