New junction evidence | |||||||||||
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? | NZ_LN832404 | = 932184 | 0 (0.000) | intergenic (‑74/‑445) | EK12AG100_RS04715/EK12AG100_RS04720 | aspartate:alanine antiporter/hypothetical protein |
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CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGCTGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTG > 1:396934/1‑292 ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCG < 1:335368/292‑1 GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGAGGTCGGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTG < 1:101037/292‑1 CGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTT < 2:216788/167‑1 CGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTT > 1:216788/1‑167 GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGCCCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTCGCACTGGTGGTGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCTTTA > 2:604235/1‑292 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTT > 2:85827/1‑292 GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTT > 1:455355/1‑292 AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCA > 2:164069/1‑265 AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCA < 1:164069/265‑1 TGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGATAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGT > 1:251967/1‑292 TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGATTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCT > 1:775966/1‑292 tccgatgtcctggTGTCTTGAAATATAGGGGCAAATCCAGGTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTG < 2:17263/279‑1 AAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACAACGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACAGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGGGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGTTTTTGGGTTAGGTtggtag > 2:181757/1‑286 AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGT > 2:684474/1‑292 TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTCGCACTGTTGATGGTTGCACGTGCGCTGGGCATCGCCTGTGGGTTctgtatcttgttt > 2:441378/1‑279 ACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGagatcgga > 1:17263/1‑284 AAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCT < 1:85827/292‑1 AAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCT < 2:455355/292‑1 atctGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACG < 1:595105/288‑1 GGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGCTGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTGAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATGTTGGTCTGACGagat > 2:595105/1‑288 ATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTTCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGAGATTGGCCGTACGGCCGGGATGT > 2:186414/1‑292 AGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTG < 1:162921/275‑1 AGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTG > 2:162921/1‑275 GGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatcca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_LN832404/381610‑381810 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGTTACGACTTGGTTCGATCCAACTGGGTAATTCCATTGGCGTTTTAGTCGTATCGCTGTTATTAGGCCAACAACATTTCAGCATTAACACCGATGCGCTTAATCTTGGCTTTATGCTGTTTATTTTCTGCGTCGGGGTCGAAGCCGGACCGAACTTTTTTTCCATTTTTTTTCGCGATGGGAAAAATTACCTAATGTTAGCACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGT < NZ_LN832404/932184‑931819 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |