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| * | NZ_LN832404 | 3,769,682 | 1 | . | G | 77.6% | 233.5 / 72.8 | 85 | pseudogene (890/1913 nt) | EK12AG100_RS18705 | PTS mannitol transporter subunit IICBA |
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TGGGTATTCAGCAGTCCCATGAACTGGGTAAATCAATCTTCT‑TCCTGATTGAAGCTAACCCAGGTCCAGGTATGGGCGT‑GCTGCTGGCGTACATGTTCTTTGGTCGTGGTAGCGCTAAACAGTCTGCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGGGGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGATCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCCGGCATCTCC‑G‑GTTT‑TATCCTTGCTGTACTGGCGATGACACCAAAAGGTGCTTACTTCGCTAACATCGCGGGTGTGTGTGCGGCGATGGCTGTCTCCTTCGTTGTCTCTGCTATTTTGCTGAAAACCAGCAAAGTGAAAGAAGAAGATGATATTGAAGCAGCAACTCGTCGTATGCAGGACATGAAAGCTGAGTCTAAAGGCGCATCTCCGCTGTCTGCTGGCGATGTGACTAACGACCTGAGCCACGTACGTAAAATCATCGTTGCCTGTGACGCCGGTATGGGTTCCAGTG > NZ_LN832404/3769394‑3769965 | tGGGTATTCAGCAGTCCCATGAACTGGGTAAATCAATCTTCT‑TCCTGATTGAAGCTAACCCAGGTCCAGGTATGGGCGT‑GCTGCTGGCGTACATGTTCTTTGGTCGTGGTAGCGCTAAACAGTCTGCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGGGGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGATCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCCGGCATCTCC‑g > 1:501442/1‑290 (MQ=255) 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acctatgtccaggtAGGTGCGG‑GCTGCTGGCGTACCTGGTCTTGGTTCGTGGTAGCGCTAACCAGGTTGCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGGCGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGAGCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCCGGCATCTCCGG‑GTTC‑TATCCTTGCTGTACTGGCGATGACACCAAAAGGTGCTTACTTCGCTAACATc < 2:558448/284‑1 (MQ=255) ccaggtccaggtATGGGCGT‑GCTGCTGGCGTACATGTTCTTTGGTCGTGGTAGCGCTAAACAGTCTGCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGGGGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGATCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCCGGCATCTCCGG‑GTTC‑TATCCTTGCTGTACTGGCGATGACACCAAAAGGTGCTTACTTCGCTAACATcgc > 1:316708/1‑290 (MQ=255) aggtccaggtATGGGCGT‑GCTGCTGGCGTACATGTTCTTTGGTCGTGGTAGCGCTAAACAGTCTGCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGGGGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGATCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCTGGCATCTCCGG‑GTTC‑TATCCTTGCTGTACTGGCGATGACACCAAAAGGTGCTTCATTCGCTAACATAGCgg > 1:808968/1‑290 (MQ=255) aggtccaggtATGGGCGT‑GCTGCTGGCGTACATGTTCTTTGGTCGTGGTAGCGCTAAACAGTCTGCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGGGGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGATCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCCGGCATCTCCGG‑GTTC‑TATCCTTGCTGTACTGGCGATGACACCAAACGGTGCTTACTTCGCTAACATCGCgg > 1:670092/1‑290 (MQ=255) ggtccaggtATGGGCGT‑GCTGCTGGCGTACATGTTCTTTGGTCGTGGTAGCGCTAAACAGTCTGCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGGGGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGATCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCCGGCCTCTCCGG‑GTTC‑TATCCTTGCTGTACTGGCGATGACACCAAAAGGTGCTTACTTCGCTAACATCCCggg > 2:145785/1‑290 (MQ=255) tccaggtATGGGCGT‑GCTGCTGGCGTACATGTTCTTTGGTCGTGGTAGCGCTAAACAGTCTTCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGTGGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGATCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCCGGCATCTCCGG‑GTTC‑TATCCTTGCTGTACTGGCGATGACACCAAAAGGTGCTTACTTCGCTAACATCGCGGgtg < 1:166851/290‑1 (MQ=255) 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TGGGTATTCAGCAGTCCCATGAACTGGGTAAATCAATCTTCT‑TCCTGATTGAAGCTAACCCAGGTCCAGGTATGGGCGT‑GCTGCTGGCGTACATGTTCTTTGGTCGTGGTAGCGCTAAACAGTCTGCGGGCGGTGCGGCAATCATCCACTTCCTGGGGGGTATCCACGAAATCTACTTCCCGTATGTGCTGATGAATCCGCGTCTGATCCTCGCAGTCATCCTCGGCGGTATGACTGGCGTGTTCACGCTGACTATCCTGGGCGGTGGTCTGGTTTCTCCGGCATCTCC‑G‑GTTT‑TATCCTTGCTGTACTGGCGATGACACCAAAAGGTGCTTACTTCGCTAACATCGCGGGTGTGTGTGCGGCGATGGCTGTCTCCTTCGTTGTCTCTGCTATTTTGCTGAAAACCAGCAAAGTGAAAGAAGAAGATGATATTGAAGCAGCAACTCGTCGTATGCAGGACATGAAAGCTGAGTCTAAAGGCGCATCTCCGCTGTCTGCTGGCGATGTGACTAACGACCTGAGCCACGTACGTAAAATCATCGTTGCCTGTGACGCCGGTATGGGTTCCAGTG > NZ_LN832404/3769394‑3769965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |