Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_LN832404 | 1,780,369 | 0 | T | A | 77.8% | 279.9 / 78.5 | 128 | C377S (TGT→AGT) | EK12AG100_RS08915 | acyl CoA:acetate/3‑ketoacid CoA transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/16); new base A (43/56); total (56/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TTAGCCTGCCCCTAAACCAACGTAAATTAGTTGCGCGGCGCGCATTATTCGAAATGCGTAAAGGCGCGGTGGGGAATGTCGGCGTCGGTATTGCTGACGGCATTGGCCTGGTCGCCCGAGAAGAAGGTTGTGCTGATGACTTTATTCTGACGGTAGAAACAGGTCCGATTGGCGGAATTACTTCACAGGGGATCGCCTTTGGCGCGAACGTGAATACCCGTGCCATTCTGGATATGACGTCCCAGTTTGATTTTTATCACGGTGGCGGTCTGGATGTTTGTTATTTGTGT‑TTTGCTGAAGTCGACCAGCACGGTAACGTCGGCGTGCATAAATTCAATGGTAAAATCATGGGCACCGGTGGATTTATTGATATCAGTGCCACTTCGAAGAAAATCATTTTCTGCGGCACATTAACTGCGGGCAGTTTAAAAACAGAAATTACCGACGGCAAATTAAATATCGTCCAGGAAGGACGGGTGAAGAAATTTATTCGGGAACTACCGGAAATTACTTTCAGCGGAAAAATCGCTCTCGAGCGAGGGCTGGATGTTCGTTATATCACTGAGC > NZ_LN832404/1780082‑1780648 | ttggCCTGCCCCTAAACCAACGTAAATTAGTTGCGCGGCGCGCATTATTCGAAATGCGTAAAGGCGCGGTGGGGAATGTCGGCGTCGGTATTGCTGACGGCATTGGCCTGGTCGCCCGAGAAGAAGGTTGTGCTGATGACTTTATTCTGACGGTAGAAACAGGTCCGATTGGCGGAATTACTTCACAGGGGATCGCCTTTGGCGCGAACGTGAATACCCGTGCCATTCTGGATATGACGTCCCAGTTTGATTTTTATCACGGTGGCGGTCTGGATGTTTGTTATTTgtgt < 1:443547/287‑1 (MQ=255) 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gTCTGGATGTTTGTTATTTGTGT‑TTTGCTGAAGTCGACCAGCACGGTAACGTCGGCGTGCATAAATTCAATGGTAAAATCATGGGCACCGGTGGATTTATTGATATCAGTGCCACTTCGAAGAAAATCATTTTCTGCGGCACATTAACTGCGGGCAGTTTAAAAACAGAAATTACCGACGGCAAATTAAATATCGTCCAGGAAGGCCGGGTGAAGAAATTTATTCGGGAACTACCGGAAATTACTTTCAGCGGAAAACTCGCTCTCGAGCGAGGGCTGGGTGTTGGGtat > 2:137510/1‑290 (MQ=255) gttGGATGTTTGTT‑TTTGTGTGCTGGCTGAGGTCGAACAGCACGGGAACGTCGGGTTGCATAAATTCAATGGTAAAATCATGGGCACCGGGGGATTTAGTGATATCAGTGCAACTTCGAAGAAAATCATTTTCTGCGGCACATTAACTGCGGGCAGTTTAAAAACAGAAATTACCGACGGCAAATTAAATATCGTCCAGGAAGGACGGGTGAAGAAATTTATTCGGGAACTACCGGAAATTACTTTCAGCGGAAAAATCGCTCTCGAGCGAGGGCTGGATGTTCGTtata < 2:1053781/288‑1 (MQ=255) cTGGATGTTTGTTATTTGTGT‑TTTGCTGAAGTCGACCAGCACGGTAACGTCGGCGTGCATAAATTCAATGGTAAAATCATGGGCACCGGTGGATTTATTGATATCAGTGCCACTTCGAAGAAAATCATTTTCTGCGGCACATTAACTGCGGGCAGTTTAAAAACAGAAATTACCGACGGCAAATTAAATATCGTCCAGGAAGGACGGGTGAAGAAATTTATTCGGGAACTACCGGAAATTACTTTCAGCGGAAAAATCGCTCTCGCGCGAGGGCTGGATGTTAGTtataa > 1:607662/1‑289 (MQ=255) 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TTAGCCTGCCCCTAAACCAACGTAAATTAGTTGCGCGGCGCGCATTATTCGAAATGCGTAAAGGCGCGGTGGGGAATGTCGGCGTCGGTATTGCTGACGGCATTGGCCTGGTCGCCCGAGAAGAAGGTTGTGCTGATGACTTTATTCTGACGGTAGAAACAGGTCCGATTGGCGGAATTACTTCACAGGGGATCGCCTTTGGCGCGAACGTGAATACCCGTGCCATTCTGGATATGACGTCCCAGTTTGATTTTTATCACGGTGGCGGTCTGGATGTTTGTTATTTGTGT‑TTTGCTGAAGTCGACCAGCACGGTAACGTCGGCGTGCATAAATTCAATGGTAAAATCATGGGCACCGGTGGATTTATTGATATCAGTGCCACTTCGAAGAAAATCATTTTCTGCGGCACATTAACTGCGGGCAGTTTAAAAACAGAAATTACCGACGGCAAATTAAATATCGTCCAGGAAGGACGGGTGAAGAAATTTATTCGGGAACTACCGGAAATTACTTTCAGCGGAAAAATCGCTCTCGAGCGAGGGCTGGATGTTCGTTATATCACTGAGC > NZ_LN832404/1780082‑1780648 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |