Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NZ_LN832404 | 576,075 | C→T | 84.6% | intergenic (‑240/+50) | bor ← / ← EK12AG100_RS02865 | serum resistance lipoprotein Bor/DUF1398 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_LN832404 | 576,075 | 0 | C | T | 84.6% | 261.2 / 36.4 | 104 | intergenic (‑240/+50) | bor/EK12AG100_RS02865 | serum resistance lipoprotein Bor/DUF1398 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (7/9); new base T (47/40); total (54/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.88e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.56e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
AATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTT > NZ_LN832404/575794‑576356 | aataaGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGGGTACATGGTTTGGATTAAGc > 2:622757/1‑290 (MQ=255) taaGCAGGGACAGCGTAGTAGCGGGTAGCATTTTTTTCAAGGTGTGATGCCCGATGCTTTGTGAAGTTAGCAGAATCGTATGTGTATAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCaa < 2:394924/290‑1 (MQ=255) cAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAAcac > 1:858314/1‑288 (MQ=255) aGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACAcc > 1:466544/1‑290 (MQ=255) taGCGCAGTATGGAGTAGCAATTTTTTCATGGTGTTAATCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAAGTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGt < 2:514375/289‑1 (MQ=255) gcAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑Tg > 1:957585/1‑290 (MQ=255) gTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGacac < 2:608400/290‑1 (MQ=255) aGTAGCATTTTTTTCATGGTTTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAAGGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGgaag < 2:292297/290‑1 (MQ=255) aGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGACTAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTTCACTTATTGCATTTTGCCAACGCCCCGGTGC‑TGAACCGgaagaacc > 2:123013/1‑288 (MQ=255) tttCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGtt < 1:824766/290‑1 (MQ=255) tttCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATAGTCATAGTATTCACGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCAGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACAAAGGGTTTAGAGCGTACATGAATGGTATTAGGCCAAACACACGGTGC‑TGACACGGAAGACACGGGaaga > 2:674645/1‑287 (MQ=255) ttCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGATTTAGCGCGTACATGTATTGTCTTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGCCGtt > 2:150308/1‑290 (MQ=255) gtaTGGTGTTATTCCCGATGCTGTTTTAAGTTCGCAGAATCGGATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAAGGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCATACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTa < 2:81013/288‑1 (MQ=255) cATGGTGTTATGCCCGATGCTTGTTGAAGTTCGCAGAAGCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATg < 1:737825/290‑1 (MQ=255) tGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGCTTAATTATGTCCACAGCCCTGACGGGGACCTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGCATACTTAA‑AAACGATGCACCCAGGGTTTAGCGCGTACATGAATTGTATTATGACAACCCCCAGTTCG‑TGACACTGAAGAACCCTGACGTTATGa > 2:206407/1‑290 (MQ=255) ggTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGAt < 2:110146/290‑1 (MQ=255) ggTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGAt < 1:1019966/290‑1 (MQ=255) tgtTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTa < 1:128016/290‑1 (MQ=255) tgtTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGAttt > 1:219548/1‑290 (MQ=255) ttATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGACCACGGGGTTTCGGGCGTACATGTATTTTCTTATGCCAAAACCCCGGTGCTTGAC‑CGGACGAATACGGACGTTagtgtataa > 2:560549/1‑282 (MQ=255) tATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGCATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGc < 1:777270/290‑1 (MQ=255) ccGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGa > 1:586042/1‑290 (MQ=255) cGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGaa < 1:987784/290‑1 (MQ=255) tttttGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGAttt < 1:839870/290‑1 (MQ=255) ttttGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTtg < 1:255619/290‑1 (MQ=255) aaGGTCGCATAAACGTATGTGTAGAAAATTAAACAAAACCTAAACAATTAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTGATTAAGGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATGCCCGGATTAACGATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTTTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAg < 2:681364/290‑1 (MQ=255) aGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAAGCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGGGTTCTGa > 1:788147/1‑290 (MQ=255) aTCGTATGTGTAGAAAATGAAACAAACCCTAAACAAGGAGGTGAAATGTCATATTGTTAATATTTATGAATGTATGCCAGGTGCGAGGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATg < 2:478089/290‑1 (MQ=255) aTGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACCTGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGCCGTTCTGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTTAATGCtctc > 2:407854/1‑290 (MQ=255) tgggtAAAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTTAAAGTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTAATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCa < 2:922913/287‑1 (MQ=255) tgtAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTGTAAATTTCTGATTGTTAATATTTATTAATGTCTGCCAGGTGCCATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTTCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGt < 2:869917/290‑1 (MQ=255) tAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTaaa < 1:1031187/290‑1 (MQ=255) tgAAATTGAAACAAACCCTAACATAGGATTTTAAATTTCATATTGTTTATATTTAGTAATGTAGGCCAGTTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTTACGTGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGTGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGTGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTaaa < 2:87129/289‑1 (MQ=255) aaacCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGCATAATT‑ACAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACCCGGACGAAACCGGCCGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTGGTGTAGTGTTATGAATGCTCTCAGTCAATAGTAAGGAAtt > 2:469803/1‑290 (MQ=255) aacCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTAt > 1:230273/1‑290 (MQ=255) acccgtaaCAAGTAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTAt < 1:195649/284‑1 (MQ=255) cccTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATc > 1:170033/1‑290 (MQ=255) aCAATTAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATGAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGTAACTTCTTTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGt < 1:630818/290‑1 (MQ=255) aCAATGATTTTAAATTTCATATTTTTAATATTTATTAATTTATGCCATGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCTGATTAACTTTGTCCACTGCCCTGTCTGGTAACTTCTCTGCTGTATTTTCCGTGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGTTTTTAGCTCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACTGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTTTTCTGAATGCTCTCATTAAATAGTAATGAATTATCAAAgtt < 1:630813/290‑3 (MQ=255) aCAATGATTTGAAATTTCATATGGTTAATATTTATTAATGTATGTAAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGTAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGta < 1:705466/290‑1 (MQ=255) cAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGCAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGta > 2:574708/1‑290 (MQ=255) aTGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGtata > 1:153780/1‑290 (MQ=255) tGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGCAGCGGAAGAAACCGGACGGTATGATTTAGAGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTATTAATCTTCTCCTTAAATAGTATTGATTTATCAAAGGtgtac > 2:538817/1‑289 (MQ=255) gAGTTGACATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGt > 1:599778/1‑290 (MQ=255) gAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACCCGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGCTTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAATTAGTAATGAATTATCAACGGTATAGt > 1:352345/1‑290 (MQ=255) tttacaTTTCATATTGTTAATATTTATTAAGGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCTGATTAACTATTTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TTACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAACTAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAat < 1:786361/285‑1 (MQ=255) aaaTTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAAGAACCGGACGTTATGATTTAGCGGTGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGACAGCTCCCAGTAAACAGGAATGAATTGTTAAAGGTATAGTTATATc > 2:941090/1‑290 (MQ=255) atTGTTAATATTTATTAATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTCTGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTCTCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGtt > 2:858926/1‑290 (MQ=255) gTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATATTTTATGTTCATg > 1:409508/1‑290 (MQ=255) attaATGTATGCCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGt > 2:162290/1‑290 (MQ=255) gtatgcCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGTTATAGTAATAACTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCa > 1:672130/1‑290 (MQ=255) gtCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGCTTTGTGTAGTGTTCTGATTGCTCTCAGTAAATAGTACTGAATTATAAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGAATATTTGTAACCCATCGGa > 1:173592/1‑290 (MQ=255) gccAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCgg > 2:1006128/3‑290 (MQ=255) aGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGaaa > 1:997/1‑290 (MQ=255) aGGTGCGAGGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTTCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGaaa < 1:580335/290‑1 (MQ=255) gTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCAAACAGGGTTTAGCGCGTCCATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACTAGGCAGCAACCGGACGTTCAGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTTATTGCTCTCAGTCAATAGTACTGAATTATCACAGGAATAGTAATCTCTTTGTTGTACGTGGCTATTTTTAATCAATCgtaccaa > 2:972316/1‑284 (MQ=255) gATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGACTGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGTTATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCt > 1:481906/1‑290 (MQ=255) tGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAATGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAACGGTATAGTAATATTTTTTATGTTAGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTgt > 2:641250/1‑289 (MQ=255) gAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCtt > 1:659437/1‑290 (MQ=255) aTCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATTGCCACAGCCCTGACGGGTAAAGTCTCTGCGGGAGTGGCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCTTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCttt < 2:957585/290‑1 (MQ=37) aTCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACACCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGAGGTGTTCTGAATGCTCGAAGTAAATAGTAATGAATTATAAAAGGTATATAAATATCTTTTATGTTCGGGGATATTTGTAATCAATCGTAAAGATCCTGAttt > 2:568819/1‑290 (MQ=255) cGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAg < 1:73883/290‑1 (MQ=255) cGTCATGTTGTTCCCGGTTTAACTATGGCCAAAGCCCGGACGGGGAAATTGTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAg < 2:613331/290‑1 (MQ=25) aTTTTATTCCCGGAGTAAACAGTGCAACAGACCTTACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGAAATAATTAA‑AAACGATGCACACAAGGGTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAg < 2:714491/290‑1 (MQ=25) gTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGTGAGGGGCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGGACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGAttt < 1:751275/290‑1 (MQ=255) tATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGAttt > 1:155335/1‑290 (MQ=255) ttCCCAGATTAAATATGTCCACAGACCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATTATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTc < 2:740593/290‑1 (MQ=37) cccGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCTTGCTTTAGCAAGATTTTCCCt > 2:138419/1‑290 (MQ=255) cGGGTTAACTATGGCCACAGCCCTGACGGTGAACTTCTCTGCGGGAGTGACCTGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGTCACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTg < 2:108930/290‑1 (MQ=25) gATTAACTATGTCCACAGCCCTGTCGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTa < 1:537234/290‑1 (MQ=255) cTATGGACACAGACCGGACGGGGAACTTCGCGGCTGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGGTTAGCGCTGAAATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCTTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTg < 2:19647/290‑1 (MQ=25) gTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAAt < 2:219548/290‑1 (MQ=255) gTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAAt > 1:260209/1‑290 (MQ=255) gTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCACGTCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAAt < 2:466544/290‑1 (MQ=37) gatctaGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAAtg < 1:139468/285‑1 (MQ=255) cacaGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATAttcaaat < 1:167969/237‑6 (MQ=255) cacaGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATAttcaaat > 2:167969/1‑232 (MQ=255) cacaGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAAtgtg > 1:356609/1‑290 (MQ=255) aGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTATTATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTACCTGTATTGCTTAAAttaattc > 2:139468/1‑284 (MQ=37) cccTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGGTTTGTGTAGTGTTCGGAATGCACTCAGTAAATCGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATAACTTTTATGTTCGTGTATATTTGTAATCAATCGGCACACTCATGCTTTAGAAAGATTTTACCTGTATTGCTCAATTGTGACTtc > 2:367976/1‑290 (MQ=255) aCTTCGCGGCGGGAGGGTCAGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATGATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCaa < 2:36823/290‑1 (MQ=25) tctcTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTGATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCt < 1:710016/290‑1 (MQ=255) ctGCGGGAGGGTACGGGAATAATTAA‑AAACGAGGCACACAGGGTTTAGCGAGTACATGTATTGTATTATGCCAACACACCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATc < 1:17966/290‑1 (MQ=25) gCGGGATGGTCCTTGAATAATTAA‑AAACGATTCAAACAGGGTTTAGTGCGTACATTTATTGTATGATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCAt < 2:654239/290‑1 (MQ=21) gggAGTGTCCGGGAATAATTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTCTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAg > 1:792551/1‑290 (MQ=255) taatTAA‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGa > 2:649792/1‑290 (MQ=255) a‑aaaCGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCgta > 2:215931/1‑289 (MQ=255) aaCGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTAtt > 1:130776/1‑290 (MQ=255) cacacaGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTACATAGTAATGAATTATCAACGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAATTGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATACGATGCTTCTTTCTTgag > 2:401540/1‑290 (MQ=255) caGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTCTGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCTTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACTTATCATAGGACGTTTCTATAAGTTGCGTATTTCTTGAGAAtt > 2:17722/1‑290 (MQ=25) aGGGTTTAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAAttt < 1:217670/290‑1 (MQ=255) ttAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGTACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACAt < 1:192452/290‑1 (MQ=255) ttAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAACGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACAt > 2:948971/1‑290 (MQ=255) cgagcaagTACACATATTGCAGGATGGCAAGGCCCCGGTGC‑TGGTACGGGAGAAACCGGAGGTTATGATGTTGCGTTGAAAGAGTTGTGTAATGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATAGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACAt < 2:500159/283‑1 (MQ=21) tatgtcgTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTTTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACAtt < 2:511422/285‑1 (MQ=255) tAGCGCGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACAtt < 2:1053591/290‑1 (MQ=255) gcgcGTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACATTTa < 1:997190/290‑1 (MQ=255) cgTACATGTATTGTATTATGCCAACACCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACATTTACaa > 2:372976/1‑290 (MQ=255) gTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAAc < 1:135346/290‑1 (MQ=255) aggtattgtattATGCCAACACCCCGGTGC‑TGATACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCGTGGATATTTGTAATCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCACTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCttt < 2:201756/288‑1 (MQ=255) | AATAAGCAGGGCCAGCGCAGTAGCGAGTAGCATTTTTTTCATGGTGTTATTCCCGATGCTTTTTGAAGTTCGCAGAATCGTATGTGTAGAAAATTAAACAAACCCTAAACAATGAGTTGAAATTTCATATTGTTAATATTTATTAATGTATGTCAGGTGCGATGAATCGTCATTGTATTCCCGGATTAACTATGTCCACAGCCCTGACGGGGAACTTCTCTGCGGGAGTGTCCGGGAATAATT‑A‑AAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGC‑TGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTT > NZ_LN832404/575794‑576356 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |