Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_LN832404 | 576,326 | 0 | G | A | 46.8% | 47.0 / inf | 291 | N70N (AAC→AAT) | EK12AG100_RS02865 | DUF1398 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (69/86); new base A (62/74); total (131/160) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.06e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
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tATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACAATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACATTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTTTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCAttatcgtttttatcgct > 2:43518/1‑294 (MQ=255) tCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTATTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACAATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACATTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTTTAAATCTTTTCGCAATTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGAAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGCAGTTTGCATTATCGGTTTTATCGCTTc > 2:607086/1‑296 (MQ=255) gtTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGCGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAACTGGCAACCTAAGCCATTGGTAACAACTTCCATGTGATACGAGGGAGCGTAGTTTGCCTTATCGTTTTTATCGTTTCACTCTTGTCTGACCTCCATGTGtttt > 2:301202/1‑296 (MQ=255) | ATAATTAAAACGATGCACACAGGGTTTAGCGCGTACACGTATTGCATTATGCCAACGCCCCGGTGCTGACACGGAAGAAACCGGACGTTATGATTTAGCGTGGAAAGATTTGTGTAGTGTTCTGAATGCTCTCAGTAAATAGTAATGAATTATCAAAGGTATAGTAATATCTTTTATGTTCATGGATATTTGTAACCCATCGGAAAACTCCTGCTTTAGCAAGATTTTCCCTGTATTGCTGAAATGTGATTTCTCTTGATTTCAACCTATCATAGGACGTTTCTATAAGATGCGTGTTTCTTGAGAATTTAACATTTACAACCTTTTTAAGTCCTTTTATTAACACGGTGTTATCGTTTTCTAACACGATGTGAATATTATCTGTGGCTAGATAGTAAATATAATGTGAGACGTTGTGACGTTTTAGTTCAGAATAAAACAATTCACAGTCTAAATCTTTTCGCACTTGATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGGTCTGACCTCTTTGTGTTTT > NZ_LN832404/576031‑576621 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |