Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_LN832404 | 1,595,365 | 0 | A | C | 85.7% | 365.2 / 40.6 | 128 | pseudogene (466/1323 nt) | hipA | type II toxin‑antitoxin system serine/threonine protein kinase toxin HipA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (8/11); new base C (58/51); total (66/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.58e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
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GGCAAGCGAAGTAAAACCGTTCGCTCAGCATTCCAACGCCTGTCAAAACGTTCGACCGCTAACGCGCGCACATTTCCCGCTTTAATGATTTCTGCGTCCGGAACATTCAACCCAAGTTCTTTCGCCAGCAGCAGACAGTAATACTCATTATCAACGCTTTGGCTGAGATCGAGCGTCGCATTGGGCTGCCTGATTTCGCCAATCGGTAATTTAATGATGTGCGTCGTCGGCGTTATTCCTTTCGGAATGCACCAGTCATTGCCTATTCTGAGCAGTGCTGTCTTCTACTGTGCGCCAGCAACCGAGATGCGAAAGTCATTTTCTTCTCTAATCATGCCTAGCGGGATATCTGCTTTATAAGCCGTTAATACTTCTTCAAGTCTGGCTTCAGTAAGCTTTTCCCATGCCATTATCGGATGCGTTACGGTTTCGTCTTCGGGTATTAACGTCACGGCACCAACGCTGTCTCGCCCTATTTCTGACAATAAATCAAACGGTTGTCTGGATTTGGCATGATAACGTTTAACGATCCGGTCACGTACAATCGGGCTATCGGGTAACAGGTTATCGAAGAAG > NZ_LN832404/1595079‑1595654 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |