Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_LN832404 | 1,647,333 | 0 | T | A | 83.7% | 284.5 / 45.0 | 107 | Q209L (CAG→CTG) | EK12AG100_RS08235 | DUF968 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (8/9); new base A (42/47); total (50/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
ACAAAGAGATCATGTGCTTTTGTTCCCATTCCGCCCTGCCCGTGACCAATCAGATGATGCGGATCGTCGGCTGGCATACCGCAGCAA‑GCACACGGCTGTGTCTTAACCCAACGTGTGTATTTCTCCTTAACCCAGCGGCGACGTT‑TAGGCAGCTTCATGAAAGATTCCGGAGACTCTGGATCAACGGTGATGCTTACCACCGTCTTTTCCTGTGGTGATTTTTGTTGCTGGTGGGCGTAAGGCAACGGTGCAAGATTTTTTGTGCGTTGTTTCAATATGCTGGTGGCGGTCTGCTCTCCCGGTACGATGTCGCTTTCGCGGTACACCGAGCAGATTTTTTCCGCTGGTAATCCCAGCGAACGACGCGATACAGCCTCAGGTAGTGCATCCACCACCTGATTGCAGACCGCCCACCAGGATAATTCAGCCAAAGATAATTCCCGCTCCTGCGTACCGCTTATTGCGTGACGGATGACGTCAATCACCCATGCTGTCAGATTTTGTTGAGCAAGCAGCTCCAGTGATTCCGATGTCTGGTCACGCAGTTGGTTGTCGCAGTGCCAGCACAACACCATTGCGCCGGT > NZ_LN832404/1647042‑1647625 | acaAAGAGATCATGTGCTTTTGTTCCCATTCCGCCCTGCCCGTGACCAATCAGATGATGCGGATCGTCGGCTGGCATACCGCAGCAA‑GCACACGGCTGTGTCTTAACCCAACGTGTGTATTTCTCCTTAACCCAGCGGCGACGTT‑TAGGCAGCTTCATGAAAGATTCCGGAGGCTCTGGATCAACGGTGATGCTTACCACCGTCTTTTCCTGTGGTTATTTTTGTTGCTGGCTGTGTTACGCTACCTGTGAAAGATTCTGTGTGCGTTGTTTCACTATGCTGGTGGCAGTCAGc > 2:142583/1‑294 (MQ=255) 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gtggCGGTCAGCTCTCCCGGTACGATGTCGCTTTCGCGGTACACCGAGCAGATTTTTTCCGCTGGTAATCCCAGCGAACGACGCGATACAGCCTCAGGTAGTGCATCCACCACCTGATTGCAGACCGCCCACCAGGATAATTCAGCCAAAGATAATTCCCGCTCCTGCGTACCGCTTATTGCGTGACGGATGACGTCAATCACCCATGCTGTCAGATTTTGTTGAGCAAGCAGCTCCAGTGATTCCGATGTCTGGTCACGCAGTTGGTTGTCGCAGTGCCAGCACAACACCAtt < 1:241528/294‑1 (MQ=255) cGGTCTGCTCTCCCGGTACGATGTCGCTTTCGCGGTACACCGAGCAGATTTTTTCCGCTGGTAATCCCAGCGAACGACGCGATACAGCCTCAGGTAGTGCATCCACCACCTGATTGCAGACCGCCCACCAGGATAATTCAGCCAAAGATAATTCCCGCTCCTGCGTACCGCTTATTGCGTGACGGATGACGTCAATCACCCATGCTGTCAGATTTTGTTGAGCAAGCAGCTCCAGTGATTCCGATGTCTGGTCACGCAGTTGGTTGTCGCAGTGCCAGCACAACACCATTgcgc < 1:116928/294‑1 (MQ=255) cTGCTCTCCCGGTACGATGTCGCTTTCGCGGTACACCGAGCAGATTTTTTCCGCTGGTAATCCCAGCGAACGACGCGATACAGCCTCAGGTAGTGCATCCACCACCTGATTGCAGACCGCCCACCAGGATAATTCAGCCAAAGATAATTCCCGCTCCTGCGTACCGCTTATTGCGTGACGGATGACGTCAATCACCCATGCTGTCAGATTTTGTTGAGCAAGCAGCTCCAGTGATTCCGATGTCTGGTCACGCAGTTGGTTGTCGCAGTGCCAGCACAACACCATTGCGCCGGt > 1:434514/1‑294 (MQ=255) | ACAAAGAGATCATGTGCTTTTGTTCCCATTCCGCCCTGCCCGTGACCAATCAGATGATGCGGATCGTCGGCTGGCATACCGCAGCAA‑GCACACGGCTGTGTCTTAACCCAACGTGTGTATTTCTCCTTAACCCAGCGGCGACGTT‑TAGGCAGCTTCATGAAAGATTCCGGAGACTCTGGATCAACGGTGATGCTTACCACCGTCTTTTCCTGTGGTGATTTTTGTTGCTGGTGGGCGTAAGGCAACGGTGCAAGATTTTTTGTGCGTTGTTTCAATATGCTGGTGGCGGTCTGCTCTCCCGGTACGATGTCGCTTTCGCGGTACACCGAGCAGATTTTTTCCGCTGGTAATCCCAGCGAACGACGCGATACAGCCTCAGGTAGTGCATCCACCACCTGATTGCAGACCGCCCACCAGGATAATTCAGCCAAAGATAATTCCCGCTCCTGCGTACCGCTTATTGCGTGACGGATGACGTCAATCACCCATGCTGTCAGATTTTGTTGAGCAAGCAGCTCCAGTGATTCCGATGTCTGGTCACGCAGTTGGTTGTCGCAGTGCCAGCACAACACCATTGCGCCGGT > NZ_LN832404/1647042‑1647625 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |