Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_LN832404 | 576,481 | 0 | C | T | 84.4% | 405.5 / 55.4 | 153 | D19N (GAC→AAC) | EK12AG100_RS02865 | DUF1398 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (14/10); new base T (67/62); total (81/72) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
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gAATAAAACAATTCACAGTTTAAATCTTTTCGCACTTG‑ATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGCTTCAATCTGGTCTGACCTCTTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCAATTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGGAGGGAAATACAACCGACAGATGTATGTAAGGCCAACGTGCTCAAACCtt > 1:847534/1‑294 (MQ=255) aaaCAATTCACAGTCTAAATCTTTTTGCACTTG‑CTCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGTTTCAATCTGTTCTGACCTCCTTGTGTTTTGTTGCTGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCACTTATTAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGCGGTCCTGCTGGCATTCTGTAGGGAAGTACATCCGATCGATGTATGTAAGGACACAGTGCTCAGATAtttctcc > 2:573087/1‑289 (MQ=255) cAATTCACAGTTTAAATCTTTTCGCACTTG‑ATCGAATATTTCTTTAAAAATGGCAACCTGAGCCATTGGTAAAACCTTCCATGTGATACGAGGGCGCGTAGTTTGCATTATCGTTTTTATCGCTTCAATCTGGTCTGACCTCTTTGTGTTTTGTTGATGATTTATGTCAAATATTAGGAATGTTTTCAATTAATAGTATTGGTTGCGTAACAAAGTGAGGTCCTGCTGGCATGCTGGCGGGAAAGACAACCGACAGAGGTATGTAAGGAAAACGTGCGCAAACATTcagacaga > 2:958643/1‑294 (MQ=255) | 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |