| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 4502108 | 199 (1.420) | noncoding (1408/1426 nt) | IS4 | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
AATGTTGAGTTCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCTCAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCTTTCAGATGTTCCGCCATTTT > NC_000913/4501858‑4502357 | tCCTCGAACCCTTACCAATTAAGGGACATAGCCAGATACGCAACTGGCTGATGCAAGCAGTCTAATGTCTTTAGATCCGCTGGCCTGCGGGCATGACAATGTCAAACAGTCAAAGATTGTGGCGTTGACGGTCAGTCTTGGGGACAAAAAAGCACAGTATTCTCGTTGGCAACCAGATAATTTAACAGTTGATGCTGAAACGAAATAGGCATCTAGATTCTGTAATGCCAGTCAGGTACGAAACTGACTgg > 2:176660/1‑251 (MQ=255) 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2:743029/1‑251 (MQ=255) tAGGCATCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCa < 1:805421/164‑1 (MQ=255) tCTTGGTTCTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTg > 1:755197/1‑179 (MQ=255) cTGTAATGCCATTCAGTTAAGCAACTGACTTGCTCTTTTTCGGGGCTGTGTGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCt < 2:617902/251‑1 (MQ=255) cTGTAATGCCAGTCAGTTAAGCAACTGACTGGCTCTTTTTCGGGGCTGTGGGGTATTTCCAGGGCCTCTCCTTTACCACTCTCGGGAAGGCCCTTTCCCTTCTTGTCGGTAATTTCACAAGTTGTCCCATACTTGCAAGATCGCGCATCAGCTCCGGTATACGTCCCGGTGAAGCGCCCTGCAATGTCATCAGCATTCTCATCACCATTCCGCATGATTCTGAGAAACTCAGTTGATTCGGCCAGTAACCt < 1:372803/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |