| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 150459 = | 213 (2.080) | 3 (0.030) | 3/458 | 9.7 | 1.6% | coding (495/1239 nt) | yadC | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| ? | NC_000913 | 150584 = | 161 (1.610) | coding (370/1239 nt) | yadC | putative fimbrial‑like adhesin protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TTTGACATTATTCAGTGTGAAATTGACATAAATGTGGTTGCTGTGATCTACAACTTTTGTACCAGGACTGTAGGCCTTAAACGAATAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTAATACAGACCAGGAACAGATGTATTAAATAGTTTATGTCCGCCATAATCTTTACCTGAATAGACCATGGCATTTTCAATAGTTATTGGACCAGGATTCGCTCTGCCAGATGTATTGCAGTAAAGAATACCACCAC > NC_000913/150210‑150709 | gAAATTGACATAAATGTGGTTGCTGTGATCTACAACTGTTGTACCAGGACTGTAGGCCTTAAACGAATAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGgaaaagaaaa < 2:946862/251‑1 (MQ=255) tAAATGTGGTTGCTGTGATCTACAACTTTTGTACCAGGACTGTAGGCCTTAAACGAATAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCttggtt > 2:109896/1‑251 (MQ=255) tgGTTGCTGTGATCTACAACTTTTGTACCAGGACTGTAGGCCTTAAACGAATAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGCATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAg < 1:647345/250‑1 (MQ=255) tGCTGTGATCTACAACTTTTGTACCAGGACTGTAGGCCTTAAACGAATAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACCTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGAtct > 2:82866/1‑251 (MQ=255) gTACCAGGACTGTAGGCCTTAAACGAATAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGa > 1:231647/1‑251 (MQ=255) aaaCGAATAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACCTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCGGTTATTGTAt < 1:82825/251‑1 (MQ=255) gAATAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTCGTGTACTATACAACCAATAGCACAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGtt > 2:402776/1‑250 (MQ=255) aaTAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTAt > 1:517079/1‑251 (MQ=255) gtAAAGGTAATTTGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAGGTGTCGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCGTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTCGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATg < 2:222001/250‑1 (MQ=255) ttgatgtattgattagatGGAATTTCTTATTACGTGTAGAGTCGACATTAGTATCTTGATAAAAGTCAAGAATTATGTTATGTACGATACCACCAGTTTACCAAAACATGTCGTGGTCTTATGCTTTGTTGAAACCCTGAGTGTTTAGGTCGGTTTATGCAACGAAAAAGATAAATGCTTGATTAGAAGGATCTCCGATATGGATTCCTGACGAATGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCagaccagacc < 2:759575/234‑1 (MQ=255) ttactgcaCTTGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATACAATTCAACAGTGGTGTTTTGTACTCTACCCCCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCGGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCGGTCTGTGACAGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGTTCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCagaccagacc < 2:527741/244‑1 (MQ=255) ttGATGAACTGTATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTTTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATGGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCagaccagacc < 1:470304/251‑1 (MQ=255) ttGATGAACTGGATAACTTGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCagaccagacc < 2:60076/251‑1 (MQ=255) ttGATGAACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCagaccagacc < 1:981344/251‑1 (MQ=255) gatgaACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATAGTATGCAGACAAGACCCt > 1:335835/1‑251 (MQ=255) gaACTGGATAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTATGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACATTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCATCCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGa < 1:712317/251‑1 (MQ=255) ggATAACTGAACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTCTAAAATTCCACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTa < 2:517192/251‑1 (MQ=255) tAACTGGACTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGgaaaagaaaa < 1:776872/161‑1 (MQ=255) agcaaatgtgaataagaaacagggATCAAAATTATTGTCTGTTTAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCACAACCTATCGTAGTCTTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAATGATCTCAGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATgg < 2:579674/229‑1 (MQ=255) cTTGCTGATTAAGTGTAGGATCGAAATTAGTATCTGTATAAAATTCAACAGTTATGTTGTGTACTATACCACCAATAGCCCAAAACTTATCGTAGTCGTCTGCTTTGTTGCAACCCTTAGTTTGTAGATCGCTGTCTGTGACGGAAAAGAAAAATTCTTGGTTGGAAGGATCTCCGATATAGATTCCTGGCGATTGAATGTCAGTTATTGTATCGTATGCAGACCAGACCCTTGATATTAACATGGTGTaa < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |