New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 3365914 = | NA (NA) | noncoding (837/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
AACCGGACATGGTGCTAGATATAAAAGATGAGCAGCAATCATGCCGTATTCACCTTACATTCCCAGAAGATGCACCAAAAGATGTGTTCTATGAGACAGCAACAGGAGAGTGCCAATGAAACGGATAATAACAGGATGCCTGCTGCTGAACTTCGCCATGGCCGCTCAGGCAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTAAAA‑CAACACAATTAGCAGACAGAACAATCACGCTGGTAATGCAATGCGATCAGGACGCTCATATTCGTGTTCAGTTGAATACCGCTAATATTTCCAACAACGGATTTGGATTTGGCCCGAATGGTTCATTAAATCTGATCGCCAGCGATGCATTTTCAGGTAGTAACAATCTCGACCTGGCGTTAGCCAGTGGCAAAAATGACAATCCGGGCAGCACAGGAACAGCATCAATTAGGGAAGGTGCGA > NC_000913/3365070‑3365566 | aaCCGGACAGGATGCTAGATATAAAAGATGAGCATCAATCATGCCGTATTCACCTTACATTCCCAGAAGATGCACCAAAAGATGTGTTCTATGAGACAGCAACAGGAGGGTGCCAATGAAACGGATAATAACAGGATGCCTTCTGCTTAACTTCGCCATGGCCGAGCAGACAGAGTGTAATATCTCCAGTAGCATACAAAATATCGACTATGGCAAACGAAGTGCTGCCATGCGCCAAGTTGACCGGGGTa < 1:718640/251‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |