New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 764467 = | 112 (1.090) | 3 (0.030) | 3/454 | 9.7 | 2.8% | coding (288/870 nt) | sucD | succinyl‑CoA synthetase, NAD(P)‑binding, alpha subunit |
? | NC_000913 | 766310 = | 104 (1.050) | coding (327/1977 nt) | mngA | fused 2‑O‑a‑mannosyl‑D‑glycerate specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TGACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGTGCTGCTGGCGATTCCCCCCAATGAAGCGGGTACTACGCATATGCAACTGCTGACAGCGCTGACCACGCGCCTTGCGGATGATGAGATTCGGGCGCGTATACAGTCGGCGACGACGCCTGATGAGTTG‑CTCTCGGCGCTGGATGACAAGGGAGGCACGCAACCTTCTGCCTCTTTTTCCAACGCGCCAACTATCGTCTGCGTAACGGCCTG > NC_000913/766060‑766558 | gACCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCCCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACCCAGCGAGCCGCTTCAGTggg > 2:453631/1‑251 (MQ=255) aCCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCCGTGGGa > 1:598048/1‑251 (MQ=255) aCCCACCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCCCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCAGTGAAAGCCCTGGCCCGACCGCCTTCAGTGAAGGGTTGGCCGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAACGAAGCG‑GCGTTTGCGCTGGCCACAATCAGCGACCCGCCTCTGTgggg > 2:416772/1‑250 (MQ=255) aCCGCGATGCGTTGTGTCTGAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGGAGGc > 1:958484/1‑251 (MQ=255) cgcatttcGTTGTGTCGTAATGCTCGCGTTTCCAGCCGTGAAGGGGCCATCCACGCGTTGACTCAACTTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGt < 1:257417/244‑1 (MQ=255) tggcttGTGTCTGAATTCGCGCTTTCCCCGCCGGGAAGAGGCCATCCACGCGTTTACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATg < 2:341282/247‑1 (MQ=255) gtCTGAATTCGCGCTTTCCCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTg < 1:725089/240‑1 (MQ=255) gAATGCGCGCTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCCTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGTGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGATGGCGTTGATGCGCCGGAAggcg > 1:528869/1‑248 (MQ=255) gcttcaaatttttttagtagacattCCCCGCGTTTACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGGGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTa < 2:1016816/227‑1 (MQ=255) gcTTTACCAGCCGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTa > 1:1070837/1‑251 (MQ=255) 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ccGTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGtgctgc > 1:1082811/1‑251 (MQ=255) gTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGTGctgctg > 1:639795/1‑251 (MQ=255) gTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGTGctgctg > 1:484507/1‑251 (MQ=255) gTGAAGAGGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGGGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCGTCAGTGGGAAGGCGTGGATGGCACGGAAGCCGGTGATTTAgcggtctcttat > 2:725216/1‑244 (MQ=255) agagGCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAGGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGTGCTGCTGGCGa < 1:840956/251‑1 (MQ=255) gagTCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCGGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGTGCTGCTGGCGAt < 1:1041555/251‑1 (MQ=255) gagGCCACCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGGGCCCTTTCTGGAAGAATTTTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGTGCTGCTGGCGAt < 2:639914/251‑1 (MQ=255) ggCCATCCACGCGTTGACTCAACGTCTTGCTGCTCTGGGGAAAATTTCCAGTACTGAGCAATTTCTGGAAGAAGTGTATCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGTGCTGCTGGCGATTc < 1:927942/251‑1 (MQ=255) ggCCACCCACCCGTTGACTCCACGTCTTGCTGCCCTGGGGAAAATTTCCAGTCCTTAGCAATTTCTGGACGAAGTGTCTCGCCGTGAAAGCCTTGGCCCGACCGCCTTAGGTGAAGGGTTGGCTGTGCCGCATGGCAAAACTGCTGCGGTAAAAGAAGCG‑GCGTTTGCGGTCGCCACACTCAGCGAGCCGCTTCAGTGGGAAGGCGTTGATGGCCCGGAAGCAGTTGATTTAGTGGTGCTGCTGGCGATTc < 2:484617/251‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |