New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_hsa_pgi | 381819 = | NA (NA) | 8 (0.110) | 8/282 | 7.3 | NA | coding (146/906 nt) | insD1 | IS2 transposase TnpB |
? | NC_000913_3_hsa_pgi | 381841 = | NA (NA) | coding (168/906 nt) | insD1 | IS2 transposase TnpB | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
CGCATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_hsa_pgi/381973‑381819 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgtatACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGA > NC_000913_3_hsa_pgi/381841‑381988 CGCATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCACGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT < 2:746405/149‑1 CGCATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT > 2:475926/1‑149 CGCATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACAT < 1:942867/149‑1 gaATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC < 2:685507/147‑1 GCATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGATGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC < 1:766257/149‑1 GCATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCTTACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATC < 1:462958/149‑1 GCATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGCAGCACATC > 2:1242538/1‑149 CATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC < 1:642942/149‑1 CATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC < 1:416844/149‑1 CATTCTGGCGCAGGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATCCCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCC < 1:679122/149‑1 ATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCG < 2:421949/149‑1 TTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 1:223486/149‑1 TTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTATGCCTGTATGCTAAGCAGCGCCCATAACCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTATACGATAACATGGTGTAAACGGAGAAGCACATACGT > 2:256654/1‑149 TTCTGGCGCAGGATCCGGTAACCACGTTTGGAATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCAATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGT < 2:600042/149‑1 taTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCAACACGTGCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA < 2:261218/147‑1 TCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTA < 2:1077490/149‑1 ATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGCGCTGCCAACGTAGGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCGGCTTCGCCGACAGGCAGCACTGGATGGGATGGCTGg > 1:729085/1‑148 TCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTA > 1:1077086/1‑149 ATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACATGCAGCACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCAT > 1:1082091/1‑149 TGTATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGC > 1:311401/1‑149 GTATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCC > 1:1236415/1‑149 TATACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCA > 2:612434/1‑149 TACGGAGAAGCACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGA > 1:557170/1‑149 CACATCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTT < 2:1077086/149‑1 gCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT < 1:711559/148‑1 aCCGTATACACCAGGTTATCGGAGAGCTGCCAACGGATGGATATCGTCGGGGATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGACCTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGATTACCGGACCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT < 2:831828/148‑1 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCCGACAGGCAGAACTTGATGGTATTCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAACGGATAATGCTCCAGAATGAGCTGTTGCTT > 2:400666/1‑149 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT < 1:771410/149‑1 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT < 2:648528/149‑1 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT > 1:430233/1‑149 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT < 1:410032/149‑1 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT < 2:761205/149‑1 TCCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTT < 2:819380/149‑1 CCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG < 2:469930/149‑1 CCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > 2:1136464/1‑149 CCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > 1:487532/1‑149 CCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > 1:970510/1‑149 CCGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > 1:780467/1‑149 CGTTTACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA < 2:1190215/149‑1 CGTATACAGCATGTTATAGGAGAGCTGCCAACGTATGGTAATCGTCTGGTTTGTTCGCTGGTTCGGAGACAGGCAGAACTTGTTGTGATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGATTGCGCTGTTGCTTGA < 1:1214708/149‑1 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGc > 2:383143/1‑148 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA < 1:543452/149‑1 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA < 2:952859/149‑1 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA < 2:783876/149‑1 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA < 2:782702/149‑1 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA < 2:674367/149‑1 CGTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGA < 2:164600/149‑1 GTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAG > 1:365872/1‑149 GTATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAG < 1:1237043/149‑1 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGC < 2:482340/149‑1 TATACACCATGTTATCGGAGAGCTACCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGC < 2:514176/149‑1 ATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGCCAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACAGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGCGCG > 1:379426/1‑149 ATACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCG > 2:120881/1‑149 TACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGACGGGTATGGGCGCAGCTTCGCAGACAGGCAGAACATGATGGTAAGCATTCGATCACTGCCCACCCTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAAATCGCTGTTGCTTGAGCGA > 2:347848/1‑149 CGCATTCTGGCGCATGATCCGGTAAACACGTTTGGCATTGATCGCAGGCATACCATCAAGTTCTGCCTGTCTGCGAAGCAGCGCCCATACCCGACGATAACCATACGTTGGCAGCTCTCCGATAACATGGTGTATACGGAGAAGCACATCCGTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913_3_hsa_pgi/381973‑381819 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgtatACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGGTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTGAGCGA > NC_000913_3_hsa_pgi/381841‑381988 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |