New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913_3_pae_pgi | = 16507 | NA (NA) | 23 (0.170) | 19/246 | 11.7 | NA | coding (1063/1113 nt) | insL1 | IS186 transposase |
? | NC_000913_3_pae_pgi | = 16511 | NA (NA) | coding (1067/1113 nt) | insL1 | IS186 transposase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
GATTGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_pae_pgi/16351‑16507 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatccagcGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATCGCAG < NC_000913_3_pae_pgi/16511‑16363 GATTGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGTTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATA < 3:87051/150‑1 ATTGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAA < 1:1259707/150‑1 TTGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAAT > 2:967668/1‑150 TTGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAAT < 2:1169991/150‑1 TGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTATTCGGGTCAAAATTTTGTTTCACCTGTATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATC < 3:622621/150‑1 TGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCTTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATC > 4:940548/1‑150 TGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATC < 1:967668/150‑1 TGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATC < 1:1595483/150‑1 TTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCA > 1:1514800/1‑150 TTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCA < 2:1219320/150‑1 TTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATC > 2:639179/1‑148 TTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATC < 1:639179/148‑1 TTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGATTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCA < 4:258412/150‑1 TACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG < 3:591864/150‑1 TACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG > 2:1373682/1‑150 TACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG < 3:1018704/150‑1 CGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCA > 4:466129/1‑146 CGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCA < 3:466129/146‑1 ATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGA < 2:1307432/150‑1 TGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGAT < 2:993810/150‑1 TGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGAT < 1:1075599/150‑1 GGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATT < 3:17786/150‑1 GGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATT < 2:548276/150‑1 GCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAA > 1:1391060/1‑131 GCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAA < 2:1391060/131‑1 AATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGT < 2:1677106/150‑1 ATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTC < 3:797848/150‑1 ATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTC < 3:534789/150‑1 TTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCG < 4:215548/150‑1 GCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTC > 2:931964/1‑144 GCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTC < 1:931964/144‑1 AAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCA > 2:1452143/1‑116 AAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCA < 1:1452143/116‑1 GCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAA < 1:992533/110‑1 GCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAA > 2:992533/1‑110 TCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG < 4:714026/110‑1 TCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG > 3:714026/1‑110 CAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAA < 2:1686569/137‑1 CAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAA > 1:1686569/1‑137 TTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG > 2:145775/1‑103 TTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG < 1:145775/103‑1 GCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGTACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAA < 1:1028734/150‑1 ACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGAGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTGATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATC < 2:13826/150‑1 GGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG > 3:642134/1‑91 GGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAG < 4:642134/91‑1 GATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGC < 1:72180/150‑1 GCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGTATTTTTAATTGACGACATAAGCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTT < 2:53358/150‑1 GCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCC > 1:887436/1‑58 GCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCC < 2:887436/58‑1 CGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGC < 2:912633/92‑1 CGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGC > 1:912633/1‑92 GTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGAT > 2:339145/1‑64 GTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGCGATGGCTGGAT < 1:339145/64‑1 ATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGC > 2:85888/1‑93 ATAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGC < 1:85888/93‑1 ATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCA < 4:446954/150‑1 ATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTC < 1:1440740/84‑1 ATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTC > 2:1440740/1‑84 CCAGCGATTGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGC > 3:482615/1‑40 CCAGCGATTGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGC < 4:482615/40‑1 CCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATC > 4:972670/1‑150 CCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATC > 4:942334/1‑150 CCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATC < 1:1168913/150‑1 CCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATC < 2:568910/150‑1 CCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTT > 2:1446969/1‑118 CCAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTT < 1:1446969/118‑1 CAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGGCAGTTCAATTTGCCATCG > 1:193493/1‑150 CAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCCATTTGCCATCG < 4:210432/150‑1 CAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCA < 1:351051/107‑1 CAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCA > 2:351051/1‑107 CAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTT > 1:613730/1‑85 CAGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTT < 2:613730/85‑1 AGCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCCAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATCGC > 4:416374/1‑150 GCGATGGCTGGATTATTTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATCGCA < 4:924618/150‑1 GCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATCGCA < 4:392432/150‑1 GCGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATCGCA > 1:1477482/1‑150 CGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATCGCAG > 1:1007093/1‑150 GATTGTTACCGTCTGCGATGGCAAATTGAACTGGCTTTTAAGCGGCTCAAAAGTTTGCTGCACCTGGATGCTTTGCGTGCAAAGGAACCTGAACTCGCGAAAGCGTGGATATTTGCTAATCTACTCGCCGCATTTTTAATTGACGACATAATCCAGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913_3_pae_pgi/16351‑16507 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatccagcGATGGCTGGATTATGTCGTCAATTAAAAATGCGGCGAGTAGATTAGCAAATATCCACGCTTTCGCGAGTTCAGGTTCCTTTGCACGCAAAGCATCCAGGTGCAGCAAACTTTTGAGCCGCTTAAAAGCCAGTTCAATTTGCCATCGCAG < NC_000913_3_pae_pgi/16511‑16363 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |