| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 225500 = | 150 (1.440) | 22 (0.260) +GTATTCTACGGCTGAACCATGTAA |
10/232 | 2.2 | 23.3% | noncoding (1/76 nt) | alaV | tRNA‑Ala |
| ? | NC_000913 | = 4037217 | 25 (0.240) | noncoding (77/77 nt) | ileT | tRNA‑Ile | |||||
GAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGATTAAATAAA > NC_000913/4037080‑4037356 | gaagCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAt < 2:158966/141‑1 (MQ=34) aagCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAtt < 2:1699753/141‑1 (MQ=34) aagCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAtt < 2:541578/141‑1 (MQ=34) aagCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAAtt < 2:307912/141‑1 (MQ=34) gCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTg > 2:1731445/1‑141 (MQ=34) gCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTg > 2:1732629/1‑141 (MQ=34) tttGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGc < 1:1915598/141‑1 (MQ=32) ttGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCa > 1:1316097/1‑141 (MQ=32) ttGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCa > 1:1641572/1‑141 (MQ=32) ttGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCa > 2:915594/1‑141 (MQ=32) gAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCaaa < 1:186597/141‑1 (MQ=31) gAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCaaa < 1:267474/141‑1 (MQ=31) gAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCaaa < 1:267507/141‑1 (MQ=31) gAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCaaa > 1:912641/1‑141 (MQ=31) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCGGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:1873631/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGTGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:761596/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 2:1891079/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 2:402198/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:920138/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:1150485/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:768100/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:72904/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:176691/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:71528/1‑141 (MQ=11) aaGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAAt > 1:1872460/1‑141 (MQ=11) gCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagag < 2:446286‑M2/141‑49 (MQ=255) ataggtctgtagctcAGTTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgctttgcac > 2:903501‑M2/8‑79 (MQ=255) ataggtctgtagctcAGTTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgctttgcac > 2:432732‑M2/8‑79 (MQ=255) ataggtctgtagctcAGTTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcac > 1:178768‑M2/8‑79 (MQ=255) tGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggag < 1:893458‑M2/141‑70 (MQ=255) cACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttg > 1:582819‑M2/1‑50 (MQ=255) cACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttg > 1:1412490‑M2/1‑50 (MQ=255) cTGATAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctcc < 1:1364166‑M2/141‑97 (MQ=255) aTAAGGGTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccacc > 1:1357038‑M2/1‑42 (MQ=255) gggTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtccgcggttcgatcccgcttggctccaccactt < 2:981283‑M2/141‑104 (MQ=255) ggTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccaccacttt > 1:787844‑M2/1‑37 (MQ=255) ggTGAGGTCGGCAGTTCAAATCTGCCCAGACCTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcttggctccaccacttt > 1:1822778‑M2/1‑37 (MQ=255) tctgcccagacctACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaa > 2:1171852‑M2/7‑17 (MQ=255) tctgcccagacctACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaa > 2:1171837‑M2/7‑17 (MQ=255) ctgcccagaccTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaat > 2:667848‑M2/6‑16 (MQ=255) ctgcccagaccTACCAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaat > 2:667861‑M2/6‑16 (MQ=255) ccAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgctttgcacgcaggaggtctgcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaatacttcagagtgta > 2:895237‑M2/1‑3 (MQ=255) ccAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgctttgcacgcaggaggtctgcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaatacttcagagtgta > 2:90705‑M2/1‑3 (MQ=255) ccAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgctttgcacgcaggaggtctgcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaatacttcagagtgta > 2:90810‑M2/1‑3 (MQ=255) ccAttacatgcgtcagccgtagaatacggggccctagctcagctgggagagcgcctgctttgcacgcaggaggtctgcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaatacttccgagtgta > 2:90709‑M2/1‑3 (MQ=255) cAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgctttgcacgcaggaggtctgcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaatacttcagagtgtac > 2:1507531‑M2/1‑2 (MQ=255) cAttacatggttcagccgtagaatacggggccatagctcagctgggagagcgcctgccttgcacgcaggaggtcagcggttcgatcccgcatagctccaccatctctgtagtggttaaataaaaaatacttcagagtgtac > 2:287621‑M2/1‑2 (MQ=255) | GAAGCGTTCTTTGAAGTGCTCACACAGATTGTCTGATGAAAATGAGCAGTAAAACCTCTACAGGCTTGTAGCTCAGGTGGTTAGAGCGCACCCCTGATAAGGGTGAGGTCGGTGGTTCAAGTCCACTCAGGCCTACCAAATTTGCACGGCAAATTTGAAGAGGTTTTAACTACATGTTATGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCTTTGCACGCAGGAGGTCTGCGGTTCGATCCCGCATAGCTCCACCATCTCTGTAGTGATTAAATAAA > NC_000913/4037080‑4037356 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |