New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1286708 = | 178 (1.640) | 13 (0.140) | 8/238 | 3.0 | 4.8% | intergenic (+182/‑1) | narI/ychS | nitrate reductase A subunit gamma/putative uncharacterized protein YchS |
? | NC_000913 | = 1287241 | 363 (3.940) | intergenic (‑5/+3) | rttR/tyrV | small RNA RttR/tRNA‑Tyr | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
TTTATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAA > NC_000913/1286568‑1286840 | tttATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCg < 2:748595/141‑1 (MQ=255) tttATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCg < 2:56893/141‑1 (MQ=255) tcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctgtcgctcgagtcgaacctttgtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtg > 1:1651782‑M1/141‑141 (MQ=255) tcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtg > 2:1347600‑M1/141‑141 (MQ=255) tcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtg > 1:1247546‑M1/141‑141 (MQ=255) cgcccttcgggtcgttgcctgcggcatcgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGa > 1:1726714‑M1/140‑141 (MQ=255) cgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGa > 1:868626‑M1/140‑141 (MQ=255) cgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGa > 1:1692811‑M1/140‑141 (MQ=255) cgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGa > 1:1346799‑M1/140‑141 (MQ=255) cccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAtg > 2:65146‑M1/138‑141 (MQ=255) gggCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAtggt > 1:581759/1‑141 (MQ=255) gggCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGAtggt > 2:1836061/1‑141 (MQ=255) tcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaacctttgtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAtggtgg > 1:102515‑M1/134‑141 (MQ=255) gggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAtggtggtg > 1:1435447‑M1/132‑141 (MQ=255) gttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGa > 1:236528‑M1/127‑141 (MQ=255) gttgcctgcggcaacgctctctcgctgacgctcgagccgaaccttagtcgaagcgtctcatccttccccgcatgggcagaatatttgattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGa > 1:1533952‑M1/127‑141 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 1:1418892/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 2:1422431/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 2:1808278/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 2:203556/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 2:904608/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 1:928290/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 1:1254197/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 2:34335/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 1:1554298/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 1:1530319/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 1:1065166/141‑1 (MQ=255) gCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGa < 2:305780/141‑1 (MQ=255) ttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGaa > 1:1504199‑M1/126‑141 (MQ=255) ttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGaa > 1:1089447‑M1/126‑141 (MQ=255) tgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatattttattgcggattcgttggtaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGAAg > 1:1600271‑M1/125‑141 (MQ=255) tgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGAAg > 2:673076‑M1/125‑141 (MQ=255) tgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGAAg > 1:1376322‑M1/125‑141 (MQ=255) tgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGAAg > 1:1477070‑M1/125‑141 (MQ=255) gggTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAgg < 1:1775030/141‑1 (MQ=255) aGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAc > 2:1582951/1‑141 (MQ=255) aGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAc > 2:1583049/1‑141 (MQ=255) ttGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTc > 1:1051621/1‑141 (MQ=255) tGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCa < 2:462159/141‑1 (MQ=255) tGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCa < 2:787092/141‑1 (MQ=255) gTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAg < 1:127806/141‑1 (MQ=255) aTGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTg > 2:1603530/1‑141 (MQ=255) tggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTc < 2:529164‑M1/40‑1 (MQ=255) cgcttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTc < 1:363969/141‑1 (MQ=255) ggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGaa > 1:1157958‑M1/101‑116 (MQ=255) gcttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCg < 1:84077/141‑1 (MQ=255) cttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGc < 2:240482/141‑1 (MQ=255) cttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGc < 2:1231393/141‑1 (MQ=255) cttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGc < 2:1110829/141‑1 (MQ=255) ttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGcc < 1:1342457/141‑1 (MQ=255) ttATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGcc < 1:1342423/141‑1 (MQ=255) cgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGcc > 1:529164‑M1/99‑141 (MQ=255) tATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCGGCGCTGCGCGCTTCGccc > 1:247638/1‑141 (MQ=255) tATCCGACCTACAGGGGAGGAAATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGAAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTAGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGccc > 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tGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACg < 1:284090/141‑1 (MQ=255) ggCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGctct > 1:605371/1‑141 (MQ=255) cGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCGGCGGCAAAGctctagcg > 1:752513/1‑137 (MQ=255) cttccccgcttgggcagaatatttgattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAt > 1:1907232‑M1/65‑67 (MQ=255) cttccccgcttgggcagaatatttgattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAt < 2:1907232‑M1/3‑1 (MQ=255) cttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGa > 1:631637‑M1/65‑66 (MQ=255) cttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAt > 1:198920‑M1/65‑67 (MQ=255) ttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAtg < 2:1390290‑M1/4‑1 (MQ=255) ttccccgcatgggcagaatatttaattgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGAtg > 1:315412‑M1/64‑67 (MQ=255) tAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGTGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTg > 2:1152671/1‑141 (MQ=255) cGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGgcgc < 1:183766/141‑1 (MQ=255) gggCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAAcc < 2:1634841/141‑1 (MQ=255) gggCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAAcc < 2:550506/141‑1 (MQ=255) ttgcggattcgttgggaagttcagggacttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGAAG‑ATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGaa > 1:725853‑M1/39‑141 (MQ=255) tgagtattcgttgggtagttcagggacttttgtaagtGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGaa > 1:113100‑M1/38‑141 (MQ=255) tAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGaa < 2:779266/141‑1 (MQ=255) tAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGaa < 2:1284357/141‑1 (MQ=255) tAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGaa < 2:108529/141‑1 (MQ=255) tAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGaa < 1:407067/141‑1 (MQ=255) cgCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:1972606/140‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGTTGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCCCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:370670/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGATGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 1:1071077/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:600077/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:95377/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 1:647981/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 1:1808763/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 1:1873735/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:1185690/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:1533153/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:1245813/141‑1 (MQ=255) aGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCAGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAg < 2:1013052/141‑1 (MQ=255) gCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGc < 2:559805/141‑1 (MQ=255) tAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATc < 2:320449/141‑1 (MQ=255) ggTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTcc < 1:1462868/141‑1 (MQ=255) gATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCCTCCCCGCtt < 2:245688/141‑1 (MQ=255) attTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTTCGGCAACGCGCACTAGCTGGCGCTAAACACGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCAACCTTCCCCGCGTGGGc > 2:1828111/1‑141 (MQ=14) attTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTGCGGCAACGCTATCTAGCTGGCGCTCAAGTCGAAACTTTGTAGAAGCATATAATACTTCCCCGCATGGGc > 2:1338087/1‑141 (MQ=14) attTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCCACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGc > 2:630981/1‑141 (MQ=255) acttttgaaagtGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGc > 1:685603‑M1/13‑141 (MQ=255) ttAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAg < 1:638411/141‑1 (MQ=255) ttAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAg < 1:507620/141‑1 (MQ=255) | TTTATGGGCACGGTGCGGGGTGAGTTGTCGGATGCGCTTCGCTTATCCGACCTACAGGGGAGGATATTGTAGGCCCGGTAAACGTGGTGCCATCGGGCAAAATTAGCTCGGAGTAACAGGTTTTGATTATTTAAGGAAGCGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAA > NC_000913/1286568‑1286840 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |