| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3428664 | 196 (1.370) | 59 (0.550) +ACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTC |
20/210 | 1.6 | 28.7% | noncoding (99/1542 nt) | rrsD | 16S ribosomal RNA |
| ? | NC_000913 | = 4035603 | NA (NA) | noncoding (73/1542 nt) | rrsA | 16S ribosomal RNA | |||||
ATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCACTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3428539‑3428664‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTACCGTTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGACGCTCA < NC_000913/4035603‑4035515 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCACATCCG‑GGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTATCGTCC > 2:2141570/1‑141ATGGCAAGAGGCCCGAAGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCC > 2:679040/1‑141 CCCGAGGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTC < 1:504825/141‑1 TCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAAC > 2:2378560/1‑141 TCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACT > 2:385499/1‑141 TCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACT > 2:194449/1‑141 TCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGGTATGCGGTATTAGCTACCGGTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTCACGTCCCCCGAAGGTTCCGTTAACg > 2:669434/1‑140 CCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTT < 1:634554/141‑1 TTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCG > 2:1100177/1‑141 TTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCACGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCG > 2:810218/1‑141 TTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCCATCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCG > 2:595598/1‑141 CGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTTCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATG > 1:990646/1‑141 CGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTTCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATG > 1:990472/1‑141 ccatCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCC < 1:1186880/137‑1 catCGTTTCCAATGGTTATCCCCCACC‑TCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCA < 1:44672/138‑1 catCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCA < 2:2219958/138‑1 catCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCA < 2:2220121/138‑1 catCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCA < 1:1153833/138‑1 catCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCA < 1:41961/138‑1 catCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCA < 1:406041/138‑1 catCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCA < 1:2288433/138‑1 TACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCA < 1:861600/141‑1 atCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAG < 1:2032598/139‑1 tCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGC < 1:1295538/140‑1 tCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGC < 1:1295676/140‑1 tCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGC < 1:1295677/140‑1 tCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGC < 1:879001/140‑1 tCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGC < 1:878981/140‑1 tCGTTTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGC < 1:878980/140‑1 TTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTC > 1:1706158/1‑141 TTCCAATGGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTC > 1:1003296/1‑141 CCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAA > 2:565991/1‑141 CCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAA > 2:565922/1‑141 tgGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTG < 1:968207/139‑1 gGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGA < 1:1398212/140‑1 gGTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGA < 1:1210487/140‑1 GTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAG > 2:2270335/1‑141 GTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAG > 2:2270472/1‑141 GTTATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAG > 1:2416327/1‑141 TATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCC < 1:1758325/141‑1 TATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCC < 2:1296398/141‑1 TATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCC < 1:1358860/141‑1 TATCCCCC‑ACATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCC < 1:1359078/141‑1 tcccccaCATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCAT < 1:1771873/134‑1 tcccccaCATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCAT > 1:854940/8‑141 tcccccaCATCAGGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCAT < 2:1925433/134‑1 CA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 1:1276965/141‑1 CA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 1:2113154/141‑1 agGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTTCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 1:2061751/139‑1 agGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGTCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 1:1421504/139‑1 agGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 2:2162958/139‑1 agGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 1:61238/139‑1 agGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 2:1092644/139‑1 agGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 1:295362/139‑1 agGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 1:2073485/139‑1 agGGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCT < 1:60830/139‑1 A‑GGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTT > 1:48848/1‑141 GGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTC < 2:1884617/141‑1 GGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTC < 2:1204015/141‑1 GGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTC < 2:644766/141‑1 GGCAATTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTC < 2:644870/141‑1 aTTTCCTAGGCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATT > 1:816388/2‑141 cctaggCATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTTAAg < 1:2510617/135‑2 CATTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTTAAGATTTTG > 2:2360214/1‑141 TTACTCACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTTCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTTAAGATTTTGtc > 1:1780405/1‑139 CACCCGTCCGCCGCTCGACGCCGTTAACGTCCCCCGAAGGTTCAGTTAACTCGTTTCCGCTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTTAAGATTTTGttcggct > 1:368742/1‑134 ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ATGGCAAGAGGCCCGAGGGTCCCCCTCTTTGGTCTTGCGACGTTATGCGGTATTAGCTACCGTTTCCAGTAGTTATCCCCCTCCATCA‑GGCAGTTTCCCAGACATTACTCACCCGTCCGCCACTCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3428539‑3428664‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTACCGTTCGACTTGCATGTGTTAGGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTTAAAAGTTTGACGCTCA < NC_000913/4035603‑4035515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |