| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTT > NC_000913/3408343‑3408636 | tgtgtTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCg > 7:211739/1‑148 (MQ=255) tttGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCgg > 4:38697/1‑148 (MQ=255) tttGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCgg > 2:120562/1‑148 (MQ=255) gCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGa < 4:192962/147‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATAGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATcccc > 2:364946/1‑147 (MQ=255) ttGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGa > 5:24377/1‑148 (MQ=255) tGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGAt > 4:244842/1‑148 (MQ=255) gCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGa > 3:313194/1‑141 (MQ=255) gCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCAGCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCAcc > 6:403691/1‑148 (MQ=255) ccGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCGTCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCAc < 4:239265/146‑1 (MQ=255) ccGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGGACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCg > 3:338952/1‑148 (MQ=255) gCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTa < 3:55216/148‑1 (MQ=255) gCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTa < 7:183389/148‑1 (MQ=255) cATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTAc > 3:173672/1‑148 (MQ=255) aCTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCg > 4:99021/1‑147 (MQ=255) aCTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCg > 5:165571/1‑147 (MQ=255) cTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGga > 6:418134‑M2/1‑146 (MQ=255) cGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGgac > 3:58766‑M2/1‑143 (MQ=255) ggggcgctgtATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGGGGTCGCAATTCTGATGTGCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCcggtacggtgagatcggggatcaccgcccgaccta < 5:139306‑M1/145‑36 (MQ=255) 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aTGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATc < 1:273203/147‑1 (MQ=255) aTGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCa < 3:238220/148‑1 (MQ=255) cGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTc > 1:219/1‑147 (MQ=255) gTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATACCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCAGGCTGCACCCATGGCTGCGAACATGTCGa > 4:57239/1‑147 (MQ=255) tGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAAt < 8:116101/148‑1 (MQ=255) aCCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGgacctaacgctccggccaggtgcataccgaacatcagaattgcgaccacaatcgtaccgatgatgatcccccgatgtacggctttgctgtcttt > 7:368080‑M2/1‑50 (MQ=255) aCCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGgacctaacgctccggccaggtgcataccgaacatcagaattgcgaccacaatcgtaccgatgatgatcccccgatgtacggctttgctgtcttt < 8:368080‑M2/144‑95 (MQ=255) tGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTcc > 7:118237/1‑108 (MQ=255) tGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTcc < 8:118237/108‑1 (MQ=255) tGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGTGATCATGTCGACAATTAACGc > 7:63383/1‑148 (MQ=255) gAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAAct > 5:97953/1‑148 (MQ=255) gCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAActgc < 2:346625/148‑1 (MQ=255) tAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGgacctaacgctccggccaggtgcataccgcacatcagaattgcgaccccaatcgtaccgatgatgatcccccgatgtacggctttgctgtctttataagagatacagcgcccc < 5:139306‑M2/148‑114 (MQ=255) aGGTCcggtacggtgagatcggggatcaccgcccgacctaacgctccggccaggtgcataccgaacatcagaattgcgaccacaatcgtaccgatgatgatcccccgatgtacggctttgctgtctttataagagatacagcgcaccg > 6:165571‑M1/1‑5 (MQ=255) gTCcggtacggtgagatcggggatcaccgcccgacctaacgctccggccaggtgcataccgaacatcagaattgcgaccacaatcgtaccgatgatgatcccccgatgtacggctttgctgtctttataagagatacagcgcaccg > 3:58766‑M1/1‑3 (MQ=255) gTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAg > 1:1510/1‑148 (MQ=255) tCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATc < 1:312459/115‑1 (MQ=255) tCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATc > 2:312459/1‑115 (MQ=255) cGGGCGGTGATCCCCGCTCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCACCGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCCCCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGtt > 7:308280/1‑148 (MQ=255) cGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGtt > 7:308278/1‑148 (MQ=255) | TGTGTTTTGGCGTGATTGGCCTGCCGCATACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTT > NC_000913/3408343‑3408636 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |