New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 3408489 | 93 (1.040) | 3 (0.030) | 3/236 | NT | 3.4% | coding (883/1452 nt) | panF | pantothenate:sodium symporter |
? | NC_000913 | = 3408518 | 82 (0.950) | coding (912/1452 nt) | panF | pantothenate:sodium symporter | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
ACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCT > NC_000913/3408372‑3408664 | aCTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCg > 4:99021/1‑147 (MQ=255) aCTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCg > 5:165571/1‑147 (MQ=255) cTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGga > 6:418134‑M2/1‑146 (MQ=255) cGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGgacct > 6:165571‑M2/1‑143 (MQ=255) cGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGgac > 3:58766‑M2/1‑143 (MQ=255) ggTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTg < 8:211739/148‑1 (MQ=255) ggTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTg < 3:38697/148‑1 (MQ=255) ggTGCGCTGTAGCTCTTATAAAGCCAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGAGGTCGCAATGCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTg < 5:180868/148‑1 (MQ=255) ggagTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGACCTACATCGCGGGAACATAAAAGGTACCATTGACGTCGCAATTATCATTTTCGCAAAGCACCATGCCGCACAGTTAAGACGGGCGGTTATACCAGCTCTCACCGTAAAGGACCTGGTgct > 2:69047/4‑146 (MQ=255) gcTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGAt < 8:425445/148‑1 (MQ=255) cTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATc < 7:4319/148‑1 (MQ=255) gTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATcc > 5:18120/1‑147 (MQ=255) tATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATcc < 3:244842/146‑1 (MQ=255) tctcTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAAc > 6:266801/1‑148 (MQ=255) ctctTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTg < 1:20827/136‑1 (MQ=255) ctctTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTg > 2:20827/1‑136 (MQ=255) ttATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACg < 6:24377/145‑1 (MQ=255) tataAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTaa > 8:39857/1‑148 (MQ=255) ataAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTa < 1:120562/146‑1 (MQ=255) aaaGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATgg > 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tACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCAcc > 7:357020/1‑148 (MQ=255) tACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCAcc > 6:211621/1‑148 (MQ=255) aTCGGGGGATCATGATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCAGCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGtt < 8:437040/148‑1 (MQ=255) tCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGttt > 1:420931/1‑148 (MQ=255) cGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTtg > 7:299779/1‑148 (MQ=255) 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2:312459/1‑115 (MQ=255) tCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATc < 1:312459/115‑1 (MQ=255) cGGGCGGTGATCCCCGCTCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCACCGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCCCCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGtt > 7:308280/1‑148 (MQ=255) cGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGtt > 7:308278/1‑148 (MQ=255) gggCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGtt < 2:219/147‑1 (MQ=255) gCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCg < 7:290716/148‑1 (MQ=255) aTCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCt > 4:244136/1‑144 (MQ=255) aTCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCt < 3:244136/144‑1 (MQ=255) tCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGa < 3:57239/147‑1 (MQ=255) ccGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCAt > 8:280742/1‑148 (MQ=255) cGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCAt > 3:389176/1‑147 (MQ=255) ctcACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGAt > 3:125392/1‑86 (MQ=255) ctcACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGAt < 4:125392/86‑1 (MQ=255) cACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTa > 8:45331/1‑143 (MQ=255) cACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTa < 7:45331/143‑1 (MQ=255) aCCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGAtc > 3:75692/1‑148 (MQ=255) ccGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGAtct < 7:72872/148‑1 (MQ=255) aCCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCg < 1:387436/125‑1 (MQ=255) aCCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCg > 2:387436/1‑125 (MQ=255) aCCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCGAt > 7:137639/1‑148 (MQ=255) ccGGACCTGGGGATCCCATCGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGAGCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTAt < 8:385711/147‑1 (MQ=255) ggACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATAATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTATATCt > 5:42894/1‑147 (MQ=255) | ACTGCGGTGCGCTGTATCTCTTATAAAGACAGCAAAGCCGTACATCGGGGGATCATCATCGGTACGATTGTGGTCGCAATTCTGATGTTCGGTATGCACCTGGCCGGAGCGTTAGGTCGGGCGGTGATCCCCGATCTCACCGTACCGGACCTGGTGATCCCAACGTTAATGGTAAAAGTGCTGCCACCGTTTGCTGCCGGGATCTTCCTGGCTGCACCGATGGCTGCGATCATGTCGACAATTAACGCCCAACTGCTGCAAAGTTCCGCTACGATCATTAAAGATCTCTATCT > NC_000913/3408372‑3408664 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |