| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
GGAGATAGATTAGTTGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTATTTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATT > CP009273/19649‑19943 | gagaTAGATTAGTTGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTATTTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATTTGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTCCTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGt > 2:269270/1‑149 (MQ=255) gatagatTAGATGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTAGTTGCACGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATATGATGACTTCGTNCATGGGGATACTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGGaa > 1:560948/1‑149 (MQ=255) atccatTAGGTATCCATTACCACGATTTTCTCGCACCGCAGTATGTCTCCCCTTTAGACATTGTTTCCACATGTATTCGGTCGAATAAATAAAGGAATCTGATTACTCCCCTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTgtcaat < 1:1525806/145‑6 (MQ=255) atTAGTTGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTATTTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGGTGAGGCAAAGAGGAGTAATTGCTGGTAATGACt 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aaGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTGATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAgg < 2:292868/149‑1 (MQ=255) agagTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGACGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGt > 1:873009/1‑149 (MQ=255) agtggtAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTa < 1:515851/149‑1 (MQ=38) agtagtAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTa > 2:1462101/1‑149 (MQ=40) agtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGc > 2:804769/1‑149 (MQ=38) agtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGc < 2:163748/149‑1 (MQ=38) agtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCCCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGc < 2:139418/149‑1 (MQ=38) gtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGCACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTCTGcc > 1:1823956/1‑149 (MQ=255) gtaATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGcc > 1:120482/1‑149 (MQ=37) taATTGGTGGTAATGACTCCAACGTATTGATAGTGTTTTATGCTCAGATAATGCCCGATGCCTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACCGCGCGTTCGATCCCGACCGGCCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGCTATGCCg > 1:1216592/1‑149 (MQ=11) taATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCg > 2:2322415/1‑149 (MQ=35) aaTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTACCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGc > 2:2147024/1‑149 (MQ=25) aTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCCGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCt < 1:228604/149‑1 (MQ=21) aTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCt > 1:2649468/1‑149 (MQ=34) aTTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGAGAGTGTTTTATGTTGAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCCCCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCt < 1:2302238/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGGCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTc < 2:1432374/149‑1 (MQ=18) ttGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTc > 1:977095/1‑149 (MQ=33) tGCTGGTAATGACTCCAAGTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGTGACTTCCGTCCCAGCCCTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGCTCTGCCGCCCa > 1:1718530/1‑149 (MQ=11) gctgctAATGACTCCAACTTATTGATATGGTCTTATGTTCAGATAACGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCaa < 1:787356/149‑1 (MQ=11) cTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAAt < 2:2169790/149‑1 (MQ=31) tGGTAATGACTCCAGCTTATTGATAGTGTGTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTGTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGATGATTCTGTTGCTGCCTAAGATTCAGGTTATGCCGCTCAAtt < 1:1771428/149‑1 (MQ=11) | GGAGATAGATTAGTTGTACATTACCACGATTTTGACTCGGCTCATTATTTGCCCGCTTGAGACATTGTTTCCATATGTACGCGGGCGAATAAATAGAGGAATCTGATTACTTCCTTCATGGGGATGCTGAAAAGAGTAGTAATTGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATT > CP009273/19649‑19943 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |