| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2507756 = | NA (NA) | 131 (1.190) | 94/284 | 0.0 | 94.4% | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase |
| ? | CP009273 | = 3052017 | 8 (0.070) | intergenic (‑248/+8) | serA/rpiA | D‑3‑phosphoglycerate dehydrogenase/ribose 5‑phosphate isomerase, constitutive | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2507903‑2507756‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATTTCCTCAACAT < CP009273/3052017‑3051869 TTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGCATTGCTGACCCGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 1:1498422/1‑149 TAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTACGTTCGCGCTTATGG > 1:582506/1‑149 TAGACCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTACTTAATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG < 1:372341/149‑1 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAGCCCTTAAGTTGGCGCTTGTGGGGtta > 1:387493/1‑146 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTACGTTAGCGCTTATG > 2:760648/1‑143 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG > 2:355693/1‑143 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTACCGTGAGAGTAATTCATCCGCCCGTTAAACCATATCAGTCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCCTATG > 2:372431/1‑143 CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATCTGGGACAGAATTGCTGACAAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGAACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCCTATGG > 2:707506/1‑143 CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACC < 1:1759644/149‑1 CCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGG > 2:1343300/1‑143 gcCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGA < 2:180088/141‑1 ATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCC < 1:1423364/149‑1 ACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGGGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGGggtatcc > 2:1111174/1‑136 TGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCC > 2:548487/1‑143 cggagGTATCCAGTGCTTCGGGCTTACCAATCTGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAACCCATCGGCACGTTAAATCATAGCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGT < 2:1491365/138‑1 CCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTATCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGT > 2:1519210/1‑143 CCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCCTCGGCCCGTTCAATCATATCCGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTCAGCGCTTATGAGGAACCTCCCCCGT > 2:1033132/1‑143 CCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAA > 1:1180676/1‑149 CCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGT > 2:819460/1‑143 AGTATCCAGTTCTGCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATT < 1:1880070/149‑1 GTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTC > 1:881268/1‑149 ctCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGTCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAACCCATTTATTATGGGTAACCTCCCCCGTTAAAAAAA < 2:1706096/141‑1 TCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCT < 1:521316/149‑1 tctGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTT < 1:1761424/146‑1 CCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAAT > 2:465012/1‑143 gAGTTGTCCGGGCTTACCAATAGGGGCCATAATTGCTCATCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGGAACCCCCCCCGTTAAAAAAATT < 2:1605943/142‑1 AGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAACAAAATTC > 2:1002298/1‑143 TTCTTGGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGACAACTGAAATCCCAACAAGCGTTTTGCCTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTC < 2:630957/143‑1 TTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCCTT > 1:204273/1‑149 TTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATT < 1:1359299/149‑1 TTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTC > 2:1634185/1‑143 TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATAATATCGGGCGTAATACCACAACCCTTACGTTAGCGCTTCTGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTC > 2:547104/1‑143 GGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAACAAAATTCTCTTCATTA > 2:1627326/1‑143 GCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGG > 1:33389/1‑149 cgAATATCGCCCATAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCAGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTTTGGTGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTG < 2:873328/141‑1 CAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTCAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACAT > 1:1213239/1‑149 CAATAGGGGCCAGAATTGCTTACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGG < 2:1044980/143‑1 AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATG > 1:1536369/1‑149 AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGT < 2:1735551/143‑1 atcggtCAGAATTGCGTACCAGTTAGCGTGAGAGTAATTCATCGCCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCGCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACTTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGAC < 2:174461/137‑1 ATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGT < 1:1054655/149‑1 ATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGAC < 2:1423955/143‑1 GGGCCAGACTGGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTCATCCATCGGCACGTTAAATCATACCAGGCGTAATACCACAACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTCAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCA < 1:541689/149‑1 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACG > 1:1365975/1‑149 CAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCT > 1:1740990/1‑149 CAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGT > 2:1281561/1‑143 AGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTT < 1:1529284/149‑1 TTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTAC < 1:816303/149‑1 TTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTAC < 1:1496372/149‑1 TGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCAATTACTGAATTCATATCAGGCATAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACC > 1:935492/1‑149 TGCTGACCAGTTATCGAGAGCGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCT > 2:1710699/1‑143 GCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCA < 1:769449/149‑1 CTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGCCATGTGTCACGCTTT > 2:1261750/1‑143 CTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAG < 1:324240/149‑1 ACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCCTCGGCACGTTAAATCATATCAGACGTAATACCACAACCATTAAGTTAGAGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAACAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTAC < 2:958885/143‑1 CCAGTTATCGTGAGAGTACTTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACC < 2:283295/143‑1 AGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCGGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAG > 2:838634/1‑143 AGTTAGCGGGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAG < 2:733238/143‑1 GTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTCAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATT > 1:1417639/1‑149 GAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAACTTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGC > 1:832156/1‑149 GAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCaa < 2:887320/143‑3 GAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGA < 2:1772336/143‑1 atgAATTCAGCGGCACGTTAAACCATATCAGACGTAATCCCACAAACCTTAAGTCAGCGCTTATGGGGAAACTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGAT < 2:510129/140‑1 TAAGTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCCTTAAGTATCGGGACATGCTGCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTG > 2:791855/1‑143 ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCT > 2:787440/1‑143 TCATCGGCACGTTAAATCATATCGGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAA < 1:249457/149‑1 TCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAA > 1:1901259/1‑149 cCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATC < 1:1087339/148‑1 GGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCT < 1:479068/149‑1 GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAACATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACAAGCCAATTGTCGATTGCTCTAAAAAA > 2:1452027/1‑143 GCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAA > 2:242892/1‑143 CACGTTAAATCATATCAGGCGTACTACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCCCTAACTAAATCCTat > 1:1214145/1‑147 TAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACC > 1:993937/1‑149 TCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCA > 1:1746973/1‑149 ATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTATTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAACCCAc > 2:467111/1‑142 TCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTC > 1:634188/1‑149 TCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGC > 2:1425718/1‑143 gtCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATC < 1:430428/147‑1 GGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATA < 2:1292579/143‑1 ctcgATACCACAGCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCA < 1:517875/145‑1 GTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTC > 2:1667564/1‑143 AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCAT < 2:951941/143‑1 AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCAT < 2:1588159/143‑1 ATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATC > 2:699659/1‑143 accCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAACATTCTCTTAATTAAATTTGATGAAATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTCAACCAGCATATTTATCCAA > 2:319968/4‑143 CACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTAC > 1:1731130/1‑149 ACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACC > 1:1325237/1‑149 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGCGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCGAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAAAATTACCTTTGC > 1:1241739/1‑149 TTAAGTTAGCGCTTATGGGGCACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCGCGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAATCAGCATATTTAGCCAACAATTACCTTTACGT > 1:129304/1‑149 TTAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGT < 1:779081/149‑1 TAAGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCTTGTTCATCCAAGAATTACagctgcgcg > 1:908298/1‑140 AGTTAGCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTG > 2:30600/1‑143 GCGCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCCAGAATTACCTTTGCGTGATATTTC > 1:516119/1‑149 GCTTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATTTCCT < 1:506649/149‑1 TTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAACACAGCGTATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATTTCCTCA > 1:526850/1‑149 TTATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATT > 2:659462/1‑143 TATGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATTTCCTCAA < 1:869225/149‑1 ATGGGGAACCACCCCCGTTAAAAAAATTCCATTCATGGAGTTTAGTGACCTGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCATCTAAACCAGACTATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATTTC > 2:802356/1‑143 TGGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATTTCC < 2:29899/143‑1 GGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATTTCCTCAACAT > 1:754684/1‑149 TTAGAGCCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2507903‑2507756‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGAACCTCCCCCGTTAAAAAAATTCTCTTCATTAAATTTGGTGACATGTGTCACGCTTTTACCAGGCAATTGTCGATTGCTCTAAATAAATCCTCTAAACCAGCATATTCATCCAAGAATTACCTTTGCGTGATATTTCCTCAACAT < CP009273/3052017‑3051869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |