| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2298015 | 161 (1.980) | 11 (0.140) | 9/290 | 9.3 | 8.4% | noncoding (120/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | CP009273 | = 2298152 | 82 (1.030) | noncoding (257/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGAC > CP009273/2298004‑2298300 | aCCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATcc < 1:739450/149‑1 (MQ=255) cccGTAGGTTAGAAAAGGCGGTCACGCCGCATCCCACACCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGa < 1:338231/149‑1 (MQ=255) cccGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGGGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAGCCg > 2:909768/1‑148 (MQ=255) cgaaGGTCAGACAAGGCGGCCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAc < 2:471219/145‑1 (MQ=255) cGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGCCGGTAAAGGCGGTTACGCCGCAGCCGAc > 2:786126/1‑148 (MQ=255) ctcgcgttcataaGGAGGTGACGCCGTAGCCGACATCGAACGCCCGAGCCGGTTGCCTTATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCTGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACa < 2:1195601/137‑1 (MQ=11) tagggtggataaGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACACCGCATCCGACAt < 2:877230/138‑1 (MQ=2) tAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATCAGGCGGTTACGCCCCATCCGACATc > 1:112921/1‑149 (MQ=255) aGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACACCCAACGCCCGCGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATc < 2:205689/148‑1 (MQ=255) ggTCAGACAGGGCGGTCACGCCGCATCCGACCTCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGCGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAGGCCGCATCCGACATCt < 2:881303/148‑1 (MQ=255) tCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAc < 1:144422/149‑1 (MQ=39) tCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCAACCGACATCTaa > 2:416664/1‑148 (MQ=255) cAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGCCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAc < 2:1231742/148‑1 (MQ=38) aGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGAGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGGAAAGGCGGATACCGCGCAgacgacggcgaacg > 2:298079/1‑140 (MQ=11) aGACAAGGCGGTCACGCCGCATACGACATCCAACGCACGAGCCGGTTGCCTGATGCGGCGCAAGCGCGTCTTGTAAGGCCTACACCGCGGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGACAAGGCGGGTACGCCGCATCCGACATcccacg > 2:1186828/1‑143 (MQ=11) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGGCTCGGCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGcc < 1:997036/149‑1 (MQ=255) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCTTCCGACCTGTCACGcc > 1:677252/1‑149 (MQ=255) cAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGCGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGccc < 2:185175/148‑1 (MQ=25) aaGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAATGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCGACCCCCaa > 1:963335/1‑149 (MQ=255) aaGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCaa > 1:1013102/1‑149 (MQ=35) aaGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGCCGGATAAGGCGGGTACGCCGCATACGACagacaacggacga > 1:1297803/1‑137 (MQ=11) agccggctaCGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAg < 1:362604/141‑1 (MQ=2) ggCGGTCACGCCGCATCCGACATCCCACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGc < 1:1067806/149‑1 (MQ=25) gCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGcc > 1:636870/1‑149 (MQ=35) gCGGCCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGcc < 1:681701/149‑1 (MQ=25) ggTCCCGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCg < 2:1024467/148‑1 (MQ=18) gTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATCAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGt > 1:1087335/1‑149 (MQ=25) gTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGGCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGt < 1:834902/149‑1 (MQ=21) tCACCCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAAcagacatctcatt < 2:328240/148‑13 (MQ=11) aaCGCCGCACCCCACACCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGtt < 2:1248930/147‑1 (MQ=12) ccccgcATCCGACACCCTCCCCCCGCGCCGGGCGCCTGCTGCGTCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGc < 2:1085498/146‑1 (MQ=11) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGATCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTCCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCt < 1:839113/149‑1 (MQ=17) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTGGGAAAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACCTCTAACGCCCCAGCCGGTTGCCt > 1:315548/1‑149 (MQ=255) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACCTCTAACGCCCAAGCCGGTTGcc > 2:369180/1‑148 (MQ=17) ccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGATAGGCCGTATCATACAGCGAACGccccccagcaatacctt > 1:1329607/1‑135 (MQ=11) cgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGa > 1:1029163/1‑149 (MQ=32) gcttCCGACATCCGACGCCCGCGCCGGTTGCCCGATGCGCCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGa < 2:193221/145‑1 (MQ=11) gcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCCAGCCGGTTGCCTGa > 2:513236/1‑148 (MQ=17) gcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGAt < 1:30588/149‑1 (MQ=32) cATCCGACATCTAACGCCCGAGCCGTTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATg < 1:287112/149‑1 (MQ=17) cATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTGGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAGCGCCCAAGCCGGTTGCCTGATg > 1:1057807/1‑149 (MQ=17) aTCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGGGAAGTGCTCCACACCGTAGGTCGGGTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACCTCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATg > 2:932832/1‑148 (MQ=255) gACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGGTGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGCAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGACGACGACAGCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGAc < 2:571580/148‑1 (MQ=11) 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cccaCGCCCGACCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCTTCTTATCAGGCCTAAACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgc < 1:303660/146‑1 (MQ=255) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATACGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgc < 1:1066622/149‑1 (MQ=17) ccAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGGCGGGTGAGGCGGGTACGCCGCGTCCGACGCCTGACGTGCAGGCCGGGGGGCTGGCGGGACGCTgg > 2:816498/1‑148 (MQ=11) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCCTCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGCTCCCTGACGCGACGCTGgcg > 2:210512/1‑148 (MQ=255) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTCCCTGGTGGCACGCTGgcgc > 1:576128/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAACCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcgc < 1:909666/149‑1 (MQ=17) tcGCCCGACCCGGTGGCCTTACGCGCCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcgc < 2:43171/147‑1 (MQ=11) aCGCCCGAGGCGGTTGCCGGATGCGAGGTTGGCGCGTCTTAACAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcgc < 2:505022/148‑1 (MQ=11) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTCTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:702406/149‑1 (MQ=17) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGt < 1:1183037/149‑1 (MQ=32) 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gcaaGGTGGTTACGCCGCACCGGACATCCAGCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTc < 2:1171889/146‑1 (MQ=11) aTAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGGGCTCCACCCCGTAGGTTGGATGAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCACCGTcc > 1:183862/1‑149 (MQ=255) aTAAGGCGGTTACGCCGCACCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTc < 2:647537/148‑1 (MQ=255) aGGCGGTTCCGCCGCTTCCGACATCCAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGGTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAg < 1:115464/149‑1 (MQ=255) ggTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCgg < 1:1231556/149‑1 (MQ=39) ttACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGtt < 1:910633/149‑1 (MQ=255) gccgcATCCGACATCCAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCt < 1:1211128/149‑1 (MQ=255) ggcgtCCGACATCCGACGCCCGTGCCGGTGGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCGCCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACTTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGa < 1:1288733/145‑1 (MQ=11) cgcATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGa > 1:905233/1‑149 (MQ=37) cgcATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGa > 1:1358194/1‑149 (MQ=37) cggccGACATCCAACCCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGGCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATg < 1:512462/146‑1 (MQ=255) aTCCCACATCTAACGGCCTAGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTGGAGCGTCTTATCAGGCCTCCACCGCTGCGAAGTGCTCTACCCCTCTGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATg < 2:817459/148‑1 (MQ=14) tCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCGTCCGACATCCAACGCCCCGGCCGGCTGCCCGATGCg > 1:682701/1‑149 (MQ=11) cGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACGTACAACGGCCGAGCCGGGTGCGTgtgtcgc > 2:1207673/1‑142 (MQ=11) cGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGGTGCCTGATGCggc > 1:393699/1‑147 (MQ=12) cGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACAGCCAACGTCGGAGCCGGGTGCCTGATGCgtc > 1:695494/1‑147 (MQ=255) | ACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGAC > CP009273/2298004‑2298300 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |