| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1162858 = | NA (NA) | 6 (0.070) | 6/274 | 12.0 | NA | noncoding (1/30 nt) | REP103 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP103 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | CP009273 | 1162888 = | NA (NA) | intergenic (+43/‑167) | ndh/ycfJ | respiratory NADH dehydrogenase 2/cupric reductase/uncharacterized protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
AATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTGGCAT > CP009273/1162746‑1163030 | aaTGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAgg < 1:1432057/149‑1 (MQ=255) tGCATCAGATTGCGCCGCAGGGCTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGaa < 1:29663/149‑1 (MQ=255) cagcAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGGCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGa < 2:409319/140‑1 (MQ=255) cATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGa > 2:391711/1‑143 (MQ=255) aTCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGGTGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAg > 2:1023906/1‑143 (MQ=255) aTCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAg > 1:1281009/1‑149 (MQ=255) aTCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGGTTGAAGTTGCATTAATCGACGTAGACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAAcgg > 1:177414/1‑147 (MQ=255) cAGATTGCGCTGCATGGTAACTTTAAAACCAGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGAATTAACGACTCATCCGCCCTTGAGGa > 2:289179/1‑143 (MQ=255) tGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATc > 1:596464/1‑149 (MQ=255) gcgcTGCATGTTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCg < 1:79921/149‑1 (MQ=255) cTGCATGGTTACTTTAAAACCGGAGCAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCa < 1:939855/149‑1 (MQ=255) cATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAGCGGGGCGATCGGCAGcc > 1:569032/1‑149 (MQ=255) cATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGCTCg > 2:666749/1‑143 (MQ=255) cATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGAAACAGCGCGAtag > 2:667116/1‑141 (MQ=255) aTGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTAAACTGGCGGATGTGGCATAAACGGCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCgg > 2:732687/1‑143 (MQ=255) ggTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCcgcg > 1:387294/1‑149 (MQ=255) gTTACTTTACATCCGGATTAATGTAGCTGGTGGGGAGTATTAACCTCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTATTCCACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAg < 2:1153219/143‑1 (MQ=255) tttAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGCTGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGACCAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTAt > 1:45566/1‑149 (MQ=255) tttAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATAGACGTACACTGGCGGATGTGGCGTAAACGCGTCATCCGCCCTTGAGTAACAGCGAGCTCCGCAGCCGCGGTGTAt > 1:508276/1‑149 (MQ=255) ttAAAACCGGATTAATGGTGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGt < 2:549662/143‑1 (MQ=255) ttAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGt > 2:1170130/1‑143 (MQ=255) ttAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGt < 2:746448/143‑1 (MQ=255) ttAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATc > 1:1273636/1‑149 (MQ=255) ttAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATc < 1:135027/149‑1 (MQ=255) tAAAACCGGTTTAATGGTGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTGTCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGCGGAACGGCGCGATCGGTAGCCGCGtt < 2:334721/143‑1 (MQ=255) aaCCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGc > 1:597265/1‑149 (MQ=255) aCCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTAt > 2:627594/1‑143 (MQ=255) cggagcaaggatgCTGGTGTGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCACCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATc < 1:1270834/140‑1 (MQ=255) tgATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTACCCGCGTGCTCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTGATCGACGCACACTGGCGGATGGGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGAGCGGCAGCCGCGTTGTATCAg < 2:1099062/142‑1 (MQ=255) tAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCTTTATCCGTCCGCCTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTc < 1:806323/149‑1 (MQ=255) aaTGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGCACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTGGTATGAGGcgac > 2:285084/1‑140 (MQ=255) gCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATTCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCa < 2:991984/143‑1 (MQ=255) tggtggGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTACCAGGCATCCTTTCAGa > 2:971842/1‑143 (MQ=255) tggtggGGAGTATTAACCGCGTTATCCGACCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCCGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTGTCAGActcctc > 1:804058/1‑149 (MQ=255) gtggGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACCCTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAGCAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGCATCAGGCATCATTTCAGAct > 2:1250492/1‑143 (MQ=255) gaagaaTTAACCGCGTTATCCGTCCCCGTTTGAAGTCGCATTAATCGACGTACACTGGCCGATGTCGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGCAACAGCGCGATCAACAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCATTCAGActccac < 2:1257535/138‑3 (MQ=255) gggTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACtcctcc < 2:743458/141‑1 (MQ=255) gTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATTCTTTCTTACTCCTCCGa < 2:503120/143‑1 (MQ=255) tATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGaa > 2:512099/1‑143 (MQ=255) aTTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTaa < 1:535630/149‑1 (MQ=255) cgcgTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTAttt > 1:14171/1‑149 (MQ=255) ttATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTAt < 2:386516/143‑1 (MQ=255) tATCCGTCCGCGTTTGAAGGTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTCGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGc > 1:1089157/1‑149 (MQ=255) ttGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCtt > 1:1271376/1‑149 (MQ=255) aaGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTc < 1:586210/149‑1 (MQ=255) aGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCa > 1:641687/1‑149 (MQ=255) gTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCt < 2:1099685/143‑1 (MQ=255) cATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTc < 2:777133/143‑1 (MQ=255) aTTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCAAGCCATTCCCGCGCTTTTCa > 2:1179012/1‑143 (MQ=255) ttAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCAt < 2:1177075/143‑1 (MQ=255) aaTCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTtcttct > 2:146610/1‑143 (MQ=255) aTCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCTGCGCTTTTCATCTtctgtct < 1:428203/149‑1 (MQ=255) aTCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCgtctgtct > 1:612351/1‑149 (MQ=255) cGACGTACACTGGCGGATGTGGCATCAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGa < 1:1007982/149‑1 (MQ=255) cGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGa < 1:174559/149‑1 (MQ=255) aCGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTtctgt > 2:521848/1‑143 (MQ=255) tACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTCTCATCTtctgtctc > 2:1030523/1‑142 (MQ=255) cacTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGGATCCTTTCAGACTCCTCCGACTCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTATTCACAGTCTGTCTGAt > 2:409623/1‑143 (MQ=255) acTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGCTa > 2:338199/1‑143 (MQ=255) ggCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCtttt < 1:338084/149‑1 (MQ=255) aTGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCt > 1:396446/1‑149 (MQ=255) tgtgGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCtt < 1:735876/149‑1 (MQ=255) tgtgGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCCTTGTATCAGGCATCCTTTCAGTCTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCtt < 1:736278/149‑1 (MQ=255) ggtgGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCtt < 1:1161558/148‑1 (MQ=255) tgGCATAACCGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTtct < 2:1095143/143‑1 (MQ=255) ggcgtttatgccacATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGc > 1:1075542/14‑149 (MQ=255) ggCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGc < 1:1263739/149‑1 (MQ=255) ggCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGc > 1:1315780/1‑149 (MQ=255) ggCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCGTTTCTCCTTCGc > 1:234266/1‑149 (MQ=255) gCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCt < 1:189203/149‑1 (MQ=255) gCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTCTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCt > 1:667854/1‑149 (MQ=255) aTAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTTATAGCTGCTTTTCTCCtt > 2:69990/1‑143 (MQ=255) cTCATCCGCCCTTGAGGAACCGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCACCCTTTCAGCCTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTg < 1:395106/149‑1 (MQ=255) tCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGCTACCTCACCCACTCCTTCGCTTGCAt > 2:1395991/1‑143 (MQ=255) tCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCAt > 2:861666/1‑143 (MQ=255) cATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATg > 2:280411/1‑143 (MQ=255) aTCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGa > 2:52486/1‑143 (MQ=255) tCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTGGCag > 1:400177/1‑148 (MQ=255) ccGCGCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGAtt < 2:542517/143‑1 (MQ=255) cGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTg < 2:122582/143‑1 (MQ=255) cGCCCTGGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTg < 2:169883/143‑1 (MQ=255) | AATGCATCAGATTGCGCTGCATGGTTACTTTAAAACCGGATTAATGATGCTGGTGGGGAGTATTAACCGCGTTATCCGTCCGCGTTTGAAGTTGCATTAATCGACGTACACTGGCGGATGTGGCATAAACGCCTCATCCGCCCTTGAGGAACAGCGCGATCGGCAGCCGCGTTGTATCAGGCATCCTTTCAGACTCCTCCGAATCCTTAAGTATTTCCAGCCATTCCCGCGCTTTTCATCTTCTGTCTGATAGCTGCTTTTCTCCTTCGCTTGCATGATTGGCAT > CP009273/1162746‑1163030 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |