| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2793464 = | 175 (1.350) | 5 (0.040) | 3/234 | NT | 3.3% | coding (2179/2982 nt) | pip | possible bacteriophage infection protein |
| ? | CP000730 | 2793513 = | 136 (1.140) | coding (2130/2982 nt) | pip | possible bacteriophage infection protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TACCACAGTTAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/2793613‑2793464‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctgatttttATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATCAC > CP000730/2793513‑2793652 gagagaAGTGAGAAGAGCGATTAGCTAATGCGACAGCAAGTGTGAAGAAGTATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAATGGCTTTATCAGATTTAG < 2:315805/135‑1 CCACAGTTAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCT > 2:756240/1‑141 CCACAGATAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCT > 2:215986/1‑141 aACAGTTAGAACAGCTATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTG < 2:842482/140‑1 ACAGTTAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGA < 1:560424/141‑1 AGTTAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATT < 2:1180411/141‑1 GTTAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTT > 1:1211430/1‑141 TTAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAGTGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTT > 1:790547/1‑141 TTAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTT > 1:1288725/1‑141 TAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTTTTTTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCT > 2:955038/1‑141 TAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCT > 2:1107673/1‑141 TAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCT > 1:1103789/1‑141 AAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTG > 2:582819/1‑116 AAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTG < 1:582819/116‑1 ttttttttttgtCTGATTTGTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTATTAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTCCCGTCGCATTATTTAATCGTTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTT > 2:912064/13‑141 ttttttttCTGATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCA > 2:1274379/9‑141 CTGATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGC < 2:487226/141‑1 CTGATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGC < 2:487233/141‑1 TGATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCT > 2:519929/1‑141 GATTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTA > 2:1466498/1‑141 TTTTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACA < 2:774016/141‑1 TTTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATC > 1:358612/1‑141 TTATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAATTTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATCA > 2:1592495/1‑141 TATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTCGTTAATAGATGTTATAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATCAC > 1:1649759/1‑141 TATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATCAC > 2:687900/1‑141 TATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATCAC < 1:643275/141‑1 TATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATCAC < 2:503919/141‑1 TATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCGAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATCAC > 2:1461363/1‑141 TACCACAGTTAGAACAGCGATTAACTAATGCGACAGCAAGTGTGAATAAAAATTTACCAACGTTATTAAATGGTTATGATCAAGCGGTAGGATTACTAAATAAAAATCAGCCACAAGCGAAAAAGGCTTTATCAGATTTAGCTGATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/2793613‑2793464‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctgatttttATTTAGTAATCCTACCGCTTGATCATAACCATTTAATAACGTTGGTAAATTTTTATTCACACTTGCTGTCGCATTAGTTAATCGCTGTTCTAACTGTGGTAAGTCATTGCGCACAAAGTTAGCAGCTTTAGCTACATCAC > CP000730/2793513‑2793652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |