| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
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tCTATGCTAATTCCTGTTAACTGTATTATAACAACTTTACAGCAAAAAAATGCAAAATCAACTAATAAATTAATGAAATGACCGACACCCTCGCTTCTACTCCAATTTAACAAAATACTATATTAGTACTATATTTTTCAt > 2:36669/1‑141 (MQ=255) tGCTAATTCCTGTTAACTGTATTATAACAACTTTACAGCAAAAAAATGCAAAATCAACTAATAAATTAATGAAATGACCGACACCCTCGCTTCTACTCCAATTTAACATAATACTATATTAGTACTATATTTTTCATTAAc > 2:77424/1‑141 (MQ=255) tGCTAATTCCTGTTAACTGTATTATAACAACTTTACAGCAAAAAAATGCAAAATCAACTAATAAATTAATGAAATGACCGACACCCTCGCTTCTACTCCAATTTAACAAAATACtat > 1:860919/1‑117 (MQ=255) tGCTAATTCCTGTTAACTGTATTATAACAACTTTACAGCAAAAAAATGCAAAATCAACTAATAAATTAATGAAATGACCGACACCCTCGCTTCTACTCCAATTTAACAAAATACTATATTAGTACTATATTTTTCATTAAc > 2:841868/1‑141 (MQ=255) tGCTAATTCCTGTTAACTGTATTATAACAACTTTACAGCAAAAAAATGCAAAATCAACTAATAAATTAATGAAATGACCGACACCCTCGCTTCTACTCCAATTTAACAAAATACTATATTAGTACTATATTTTTCATTAAc > 1:142686/1‑141 (MQ=255) | TTTGATGCATGTATCGTGCACTTATTTAGTGGTACTGTGTTTACGCATTGGCTACGCAAACACGATGATAAATAGGCGACCTAGCTACACCGAAAAAAATCCCCTCACTATTGCGAGTAGTGAGGGGATTGGTGTATCTATGCTAATTCCTGTTAACTGTATTATAACAACTTTACAGCAAAAAAATGCAAAATCAACTAATAAATTAATGAAATGACCGACACCCTCGCTTCTACTCCAATTTAACAAAATACTATATTAGTACTATATTTTTCATTAAC > CP000730/2653403‑2653683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |