| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 1072165 = | 102 (1.270) | 7 (0.090) | 7/260 | 10.0 | 6.6% | intergenic (‑637/+168) | iraE/folD | possible chitinase/bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP(+))/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase |
| ? | CP000730 | 2699372 = | 100 (1.280) | intergenic (+276/‑15) | copA/merP | P‑ATPase superfamily P‑type ATPase copper (Cu2+) transporter/MerTP family mercury (Hg2+) permease, binding protein MerP | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CCTTCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGTAAAA‑TTTATTTCGTCGTCCCACCCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAA‑GCTTGTTACAAGCGAATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCATTATAACTTTGTAGAGC > CP000730/1072026‑1072303 | ccTTCAAAGCCTTCATTTATACAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGTTTAAAAGACTTTATTATAACTCAGttatt < 2:330643/141‑1 (MQ=255) ttCAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACGTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATTTGGGTTAAAAGAATTTATTAAAACTCAGttattaa > 2:817394/1‑140 (MQ=255) cAAAGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAggg < 2:206388/141‑1 (MQ=255) aaaGCCTTCATTTATTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAGGGa < 1:623705/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAGGGAGTGGGACAGAAAt < 2:191278/141‑1 (MQ=255) aTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAGGGAGTGGGACAGAAAt < 2:130217/141‑1 (MQ=255) aTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAGGGAGTGGGACAGAAAt < 2:485629/141‑1 (MQ=255) aTTCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCAATAAAGGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAGGGAGTGGGACAGAAAt > 1:285608/1‑141 (MQ=255) ttCAATGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCATATTTTTCTTGTTATTCATTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAGGGAGTGGGACAGAAATg < 2:926104/141‑1 (MQ=255) aTGTCTACTTTGAAGGGAGCATTTGATCGATTAATGTCCCAGATTTTTCTTGTTATTTTTTGCAATTGCAAAATAATATTTAATGTGGGTTAAAAGACTTTATTAAAACTCAGTTATTAGGGAGCGTGACAGAAATGatat > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |