New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 533277 = | 93 (1.160) | 6 (0.080) | 6/250 | 10.3 | 6.4% | intergenic (+2848/‑2877) | veg/rplY | hypothetical protein/ribosomal protein L25 |
? | CP000730 | = 533297 | 88 (1.180) | intergenic (+2868/‑2857) | veg/rplY | hypothetical protein/ribosomal protein L25 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
AAACAGATGAAGTAGTACCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTATTTT > CP000730/533138‑533411 | aaaCAGATGAAGTAGTACCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑t > 2:493017/1‑141 (MQ=255) gATGAAGTAGTACCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑tttttt > 1:422303/1‑141 (MQ=255) gATGAAGTAGTACCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑tttttt < 1:193517/141‑1 (MQ=255) aTGAAGTAGTACCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑ttttttt > 2:274448/1‑141 (MQ=255) tGAAGTAGTACCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTa > 2:783339/1‑141 (MQ=255) aaGTAGTACCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGt > 2:489687/1‑141 (MQ=255) gtaaaaGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTGGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTa < 2:652340/136‑1 (MQ=255) aCCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTAtt < 2:880913/141‑1 (MQ=255) gATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATg > 2:655653/1‑141 (MQ=255) tAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGtt < 2:105839/141‑1 (MQ=255) aaaaaCGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGACGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGttt > 1:782852/1‑141 (MQ=255) aaaaCGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCGTTGTCGGCAG‑TATTTTTAGTTTGTATTAATGtttt < 2:785708/141‑1 (MQ=255) aaaCGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGttttt < 2:220021/141‑1 (MQ=255) aaCGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGtttttt < 2:995852/141‑1 (MQ=255) aCGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGttttttt < 1:281612/141‑1 (MQ=255) aCATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTtttttatttt < 2:757240/141‑1 (MQ=255) aCATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTtttttatttt > 2:171174/1‑141 (MQ=255) aTCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTtttttattttta < 2:513604/141‑1 (MQ=255) agaagaTTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTtttttagtttgtatt < 2:909668/141‑6 (MQ=255) agaTTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGaaa > 1:724111/1‑141 (MQ=255) aTTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAgg < 2:243951/141‑1 (MQ=255) aTTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAgg < 2:287112/141‑1 (MQ=255) ttCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAGTTTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAgg < 2:481063/141‑1 (MQ=255) ttCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGc < 1:981935/141‑1 (MQ=255) ttCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGc > 2:676913/1‑141 (MQ=255) tCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTtttttatttttactccacgcct > 2:452676/1‑131 (MQ=255) tCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCt > 2:168387/1‑141 (MQ=255) cAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCta > 1:135585/1‑141 (MQ=255) cAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCta > 1:490148/1‑141 (MQ=255) cAGAAGAAGCTTAATAAAGTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCta > 1:749906/1‑141 (MQ=255) agaagCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCtaataa < 1:493905/141‑1 (MQ=255) ttAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAatatat < 2:647808/141‑1 (MQ=255) aaTCANATTAATAGTAAGCGATTTAATAAAATTACCATAAGTTGATTTGATACGGTAGATATATCATAAATCTTTGTCGTCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTNTTTATTTNTAATGAAAGGCTAATAAATATATAc < 1:93444/141‑1 (MQ=255) aTTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATACATATATACGTTaa > 2:604327/1‑141 (MQ=255) aTTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTaa < 1:48158/141‑1 (MQ=255) aTTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTaa > 1:883840/1‑141 (MQ=255) ttttATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAAc < 1:655653/141‑1 (MQ=255) tttATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACa > 1:697573/1‑141 (MQ=255) tttATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACa < 2:802948/141‑1 (MQ=255) atatTTAGCGATGTAATACCTTCGCAATAAGTTGATTGGATACTGGCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTCGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGAt < 2:97136/141‑1 (MQ=255) atatTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGtagacaatt > 2:192043/1‑133 (MQ=255) atTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTa > 1:556828/1‑141 (MQ=255) tttAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTat > 1:990648/1‑141 (MQ=255) tttAACAATGTAATAAATTTGAAATAAGTTAATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAACTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATTAAAGGCTAAGAAATATATACGTTAACAGATTat < 1:493017/141‑1 (MQ=255) tGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGatat < 1:536196/141‑1 (MQ=255) gTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATg < 2:232702/141‑1 (MQ=255) gTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGGCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATg < 2:807363/141‑1 (MQ=255) tAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGttt > 1:93722/1‑84 (MQ=255) tAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGttt < 2:93722/84‑1 (MQ=255) aCATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAat > 2:56808/1‑141 (MQ=255) cATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAatt > 1:996441/1‑141 (MQ=255) tttGAAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAattat < 1:636620/141‑1 (MQ=255) aGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTATGGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCAtt > 1:761033/1‑141 (MQ=255) aGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCAtt > 2:735670/1‑141 (MQ=255) aGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCAtt > 1:209903/1‑141 (MQ=255) atttgatACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGa > 1:937625/1‑141 (MQ=255) tttgatACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑ttttttt < 2:475013/45‑1 (MQ=255) tttgatACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑ttttttt > 1:475013/1‑45 (MQ=255) tttgatACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATACACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGAt > 2:695967/1‑141 (MQ=255) ttgatACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAGGTTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTTATTGCtttta > 2:278892/1‑137 (MQ=255) cTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAAtt < 1:390403/141‑1 (MQ=255) tCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCg < 2:342365/141‑1 (MQ=255) tCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCg > 2:459504/1‑141 (MQ=255) gATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATTAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGtt > 1:998796/1‑141 (MQ=255) aaagcataaagcTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGc > 2:923665/1‑122 (MQ=255) aaagcataaagcTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGc < 1:923797/122‑1 (MQ=255) aaagcataaagcTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGc > 2:923797/1‑122 (MQ=255) aaagcataaagcTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGc > 2:923666/1‑122 (MQ=255) aaagcataaagcTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGc < 1:923666/122‑1 (MQ=255) aaagcataaagcTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGc < 1:923665/122‑1 (MQ=255) agcataaagcTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAat > 1:830480/1‑141 (MQ=255) ctttatgcTTTATCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAatga > 1:534276/7‑141 (MQ=255) ctttatgcTTTATCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAatga > 1:591681/7‑141 (MQ=255) cataaagcTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAatga > 2:692800/1‑141 (MQ=255) 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tttgtattaatg‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTTATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGt > 2:403108/12‑141 (MQ=255) cTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCGTTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGt > 1:559984/1‑141 (MQ=255) cTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGt < 2:724111/141‑1 (MQ=255) cTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGt < 2:649424/141‑1 (MQ=255) tttGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTa < 1:876393/141‑1 (MQ=255) ttGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTggggaagaattgttt > 2:552047/1‑127 (MQ=255) ttGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTAt > 2:106199/1‑141 (MQ=255) ttGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGAGTTTGAATGATGATAGTAt > 1:302772/1‑141 (MQ=255) gTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTAttt > 1:138437/1‑141 (MQ=255) gTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTAttt > 2:626611/1‑141 (MQ=255) gTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTAttt > 2:523856/1‑141 (MQ=255) gTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTAttt > 2:115664/1‑141 (MQ=255) tCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTAtttt < 1:172697/141‑1 (MQ=255) tCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTAtttt > 1:237145/1‑141 (MQ=255) tCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTAtttt > 2:364408/1‑141 (MQ=255) | AAACAGATGAAGTAGTACCAGATAAAAACGCTACATCAGAAGATTCAGAAGAAGCTTAATCAATTTTATATTTAGCGATGTAATACATTTGCAATAAGTTGATTTGATACTGTCGATAAAGCATAAAGCTTTGTCGGCAG‑TTTTTTTAGTTTGTATTAATGTTTTTTTATTTTTAATGAAAGGCTAATAAATATATACGTTAACAGATTATGATGATATGAAAATTATTGATTCATTGCTGATAAAAATTGCGTTTGAATGATGCTCGTATTTT > CP000730/533138‑533411 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
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