| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 830841 = | 91 (1.030) | 4 (0.050) | 4/234 | NT | 5.0% | intergenic (+10/‑404) | raiA/secA1 | possible ribosome‑associated inhibitor protein Y/Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase subunit SecA |
| ? | CP000730 | 830871 = | 68 (0.850) | intergenic (+40/‑374) | raiA/secA1 | possible ribosome‑associated inhibitor protein Y/Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase subunit SecA | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
AGCGGTATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAG > CP000730/830702‑830981 | atacaatagactgacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaaa > 2:672854‑M1/140‑141 (MQ=255)atacaatagactgacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaaa > 1:584824‑M1/140‑141 (MQ=255)agCGGTATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTaa > 2:849511/1‑141 (MQ=255) gCGGTATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTaaa < 2:123182/141‑1 (MQ=255) gTATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCa > 1:805202/1‑141 (MQ=255) gTATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCa > 2:566673/1‑141 (MQ=255) tATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCAc > 2:572631/1‑141 (MQ=255) atagactgacctactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtctctatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatctgcttttggagtataaaAAAGCAc < 2:53718‑M1/7‑1 (MQ=255) agactgacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaaaaaaaaaa > 2:517554‑M1/133‑135 (MQ=255) tACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTtg < 2:612606/141‑1 (MQ=255) gactgacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgattttggagtataaaAAAGCACTtg < 1:392638‑M1/10‑1 (MQ=255) ctgacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaAAAGCACTtgtg > 2:725838‑M1/130‑141 (MQ=255) ctgacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaAAAGCACTtgtg < 1:200755‑M1/12‑1 (MQ=255) ctgacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaAAAGCACTtgtg < 1:1004034‑M1/12‑1 (MQ=255) ctgacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaAAAGCACTtgtg < 2:1022790‑M1/12‑1 (MQ=255) cAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTtgtg < 1:1022267/141‑1 (MQ=255) cAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTtgtg < 1:420374/141‑1 (MQ=255) cAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTtgtg < 2:57057/141‑1 (MQ=255) gacatactattattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaaaaaaaataaaaaa > 2:722026‑M1/128‑130 (MQ=255) aaTGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTtgtgca < 2:462625/141‑3 (MQ=255) gAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGttttt < 2:631229/141‑1 (MQ=255) aTCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTtgtgcaaaaac < 1:928273/141‑8 (MQ=255) attattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaAAAGCACTTGTGTTTTTGcaca > 2:492373‑M1/120‑141 (MQ=255) ttattaacttaacattcaaatatatacatccattaacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaAAAGCACTTGTGTTTTTGCACaa > 2:680015‑M1/119‑141 (MQ=255) ttAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAg < 2:183358/141‑1 (MQ=255) ttAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAg < 1:327307/141‑1 (MQ=255) tAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTtgtgcaaaaacacaagt < 1:1061462/141‑14 (MQ=255) gTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAATTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCt < 1:303656/141‑1 (MQ=255) cATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCttt < 1:697672/141‑1 (MQ=255) tGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCttttt > 1:44527/1‑141 (MQ=255) gACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCtttttt < 1:245859/141‑1 (MQ=255) cttcttTGTATTCACAGACAGGGAAACTGGTGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAGCGCAGTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTtat < 2:32514/141‑1 (MQ=255) cttcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTtat < 1:66112/141‑1 (MQ=255) cttcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCCTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTtat < 1:853194/141‑1 (MQ=255) ttcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTtata > 1:950993/1‑141 (MQ=255) tcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTta > 2:818346/1‑138 (MQ=255) tcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATAc > 2:581274/1‑141 (MQ=255) cttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACt > 2:787995/1‑141 (MQ=255) tGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCa < 1:996685/141‑1 (MQ=255) tGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCa > 1:481851/1‑141 (MQ=255) tGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCa < 2:1086496/141‑1 (MQ=255) aTTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCaaaa < 1:638314/141‑1 (MQ=255) aTTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTACACTCCaaaa < 1:955419/141‑1 (MQ=255) ttCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAg > 1:50755/1‑141 (MQ=255) ttCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAg > 1:1025085/1‑141 (MQ=255) cacaGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCa < 1:582401/141‑1 (MQ=255) accgacagaGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCAGTAAAGACGGTAAATATGGATTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCACAAGCaa > 2:1023648/4‑141 (MQ=255) gAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGt < 2:76822/141‑1 (MQ=255) aCAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTc > 1:980324/1‑141 (MQ=255) aCAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTc > 1:1071403/1‑141 (MQ=255) aaGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGa > 1:627916/1‑141 (MQ=255) gTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATa > 1:461345/1‑141 (MQ=255) cGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGt < 1:461338/141‑1 (MQ=255) cGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGt < 1:335689/141‑1 (MQ=255) cGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGt < 1:208884/141‑1 (MQ=255) gTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTa > 1:455250/1‑141 (MQ=255) gTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTa > 1:820909/1‑141 (MQ=255) ccgccgTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATttg > 2:77686/1‑141 (MQ=255) ccgccgTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACGTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATttg < 1:302514/141‑1 (MQ=255) gccgTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATttgtt > 1:985964/1‑141 (MQ=255) gTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTtgaa < 1:605744/141‑1 (MQ=255) ttacggcGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTtgaat > 2:502997/7‑141 (MQ=255) aaaGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTtgaatg < 1:206386/141‑1 (MQ=255) aaaGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTtgaatg < 1:503227/141‑1 (MQ=255) cGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACa < 1:425992/141‑1 (MQ=255) tAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAg < 2:681058/141‑1 (MQ=255) tatGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGTTCTTTTGTTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTTAATGAAACATAGTGAc > 2:294416/1‑141 (MQ=255) tatGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGAc > 1:733005/1‑141 (MQ=255) tGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTa > 2:256586/1‑141 (MQ=255) ggCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTAt > 1:192833/1‑141 (MQ=255) ggCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTAt > 1:163401/1‑141 (MQ=255) gCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATg < 1:809316/141‑1 (MQ=255) cTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGc > 2:587489/1‑141 (MQ=255) ttGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCt < 2:1072292/141‑1 (MQ=255) ttGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCt < 1:787995/141‑1 (MQ=255) ttGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCt < 1:126365/141‑1 (MQ=255) gATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTaa < 1:315990/141‑1 (MQ=255) aTTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAAt < 1:115776/141‑1 (MQ=255) ttCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATg < 1:568502/141‑1 (MQ=255) tCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGt > 1:943843/1‑141 (MQ=255) aaaaaTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGTACAAGTGCTTTTTTATAATCCAAAAGCAAATTAAGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGtt < 2:280436/140‑1 (MQ=255) gtcataatttgcttttggagtataaaAAAGCACTTGTGCAAAAACACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTa < 1:942240‑M1/115‑1 (MQ=255) aaCTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTaa < 1:717544/141‑1 (MQ=255) aaCTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTaa > 1:1058836/1‑141 (MQ=255) tAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATgg > 1:717630/1‑141 (MQ=255) aGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGa > 2:200755/1‑141 (MQ=255) tGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTCACTATGCTAATGTTAATGGATg > 2:454612/1‑141 (MQ=255) cAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGtata < 2:1044093/141‑1 (MQ=255) cAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGtata < 2:717630/141‑1 (MQ=255) cAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGtata > 1:668225/1‑141 (MQ=255) aTAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGtatata > 1:163419/1‑141 (MQ=255) tAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTatatat < 2:81023/141‑1 (MQ=255) aaaTTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATAtt < 1:811240/141‑1 (MQ=255) aTTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGTAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTg < 2:863460/141‑1 (MQ=255) ttAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGa > 2:654341/1‑141 (MQ=255) aGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATg < 1:895369/141‑1 (MQ=255) gTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATgt > 1:822905/1‑141 (MQ=255) ttAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATgtta < 2:62371/141‑1 (MQ=255) AAAGCACTTGTGTTTTTGCACATGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATgttaag > 1:17562‑M1/1‑141 (MQ=255) AAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATgttaag > 2:722100‑M1/1‑141 (MQ=255) | AGCGGTATTACAAATGAATCTATTAGGTCATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAG > CP000730/830702‑830981 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |