| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 830841 = | 91 (1.030) | 4 (0.050) | 4/234 | NT | 5.0% | intergenic (+10/‑404) | raiA/secA1 | possible ribosome‑associated inhibitor protein Y/Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase subunit SecA |
| ? | CP000730 | 830871 = | 68 (0.850) | intergenic (+40/‑374) | raiA/secA1 | possible ribosome‑associated inhibitor protein Y/Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase subunit SecA | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCTATTGTATAG > CP000730/830731‑831011 | aTGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCtttt < 2:6410/141‑1 (MQ=255) tGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCttttt > 1:44527/1‑141 (MQ=255) gACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCtttttt < 1:245859/141‑1 (MQ=255) cttcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTtat < 1:66112/141‑1 (MQ=255) cttcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCCTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTtat < 1:853194/141‑1 (MQ=255) ttcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTtata > 1:950993/1‑141 (MQ=255) tcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTta > 2:818346/1‑138 (MQ=255) tcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTta < 1:818346/138‑1 (MQ=255) tcttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATAc > 2:581274/1‑141 (MQ=255) cttTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACt > 2:787995/1‑141 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1:955419/141‑1 (MQ=255) ttCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAg > 1:1025085/1‑141 (MQ=255) ttCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAg > 1:50755/1‑141 (MQ=255) cacaGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCa < 1:582401/141‑1 (MQ=255) accgacagaGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCAGTAAAGACGGTAAATATGGATTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCACAAGCaa > 2:1023648/4‑141 (MQ=255) taacattagcatagtcactatgtttcattcaacaaattacattatcgaactatgaaatagtcataatttgcttttggagtataaaaaagcacttgtgtttttgcacaagtgctttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGAc < 1:942240‑M2/26‑1 (MQ=255) 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2:492373‑M2/23‑141 (MQ=255) TGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTaataat > 1:1000775‑M1/1‑141 (MQ=255) ttGCACAAGTGCTTTTTTATCCTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGt < 2:487644/141‑1 (MQ=255) ttGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGt > 1:1044911/1‑141 (MQ=255) ttGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGt < 1:502997/141‑1 (MQ=255) ttGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGt < 1:572631/141‑1 (MQ=255) ttGCACAAGTGCTTTGTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTTACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGt < 2:431581/141‑1 (MQ=255) tGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTc > 1:344398/1‑141 (MQ=255) tGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATAATGGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTc > 1:314605/1‑141 (MQ=255) gCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTg > 1:431414/1‑83 (MQ=255) gCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTg < 2:431414/83‑1 (MQ=255) cacaagtgctttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAg > 2:725838‑M2/13‑141 (MQ=255) cacaagtgctttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAg < 2:1022790‑M2/129‑1 (MQ=255) cacaagtgctttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAg < 1:200755‑M2/129‑1 (MQ=255) cacaagtgctttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAg < 1:1004034‑M2/129‑1 (MQ=255) caagtgctttTTTATACTCCAAAATCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTc < 1:392638‑M2/131‑1 (MQ=255) caagtgctttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTc < 2:300412‑M2/131‑1 (MQ=255) tttttttttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCt > 2:517554‑M2/10‑141 (MQ=255) gtgctttTTTATACTCCAAAAGCAGATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGAGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTAGGTCAGTCTAt < 2:53718‑M2/134‑1 (MQ=255) ttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCTATTGtat > 2:672854‑M2/3‑141 (MQ=255) tttATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGt > 1:133502/1‑126 (MQ=255) tttATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGt < 2:133502/126‑1 (MQ=255) tttATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCTATTGTATAg > 2:505925/1‑141 (MQ=255) | ATGACTTCTTTGTATTCACAGACAGAGAAACTGATGGAACAAGTATCGTTTACCGCCGTAAAGACGGTAAATATGGCTTGATTCAAACTAGTGAACAATAAATTAAGTTTAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCTATTGTATAG > CP000730/830731‑831011 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |