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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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ttcagattcagaCAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactc > 1:1053140/1‑141 (MQ=255) ttcagaatcagaCAGAGACTCAGAAGATGAATCAGCCTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactc < 2:91323/141‑1 (MQ=17) gattcagaCAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGATAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactcagac < 1:966576/141‑1 (MQ=255) ttcagaCAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactcagactc > 1:229790/1‑141 (MQ=255) agacagaGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactcagactcaga > 1:949607/1‑141 (MQ=255) gacagaGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcggacagcgattcagactcagat > 2:132713/1‑140 (MQ=255) gacagaGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGTGATTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATtcagatagcgactcagactcagaa > 2:89018/1‑140 (MQ=255) tcgagaCACAGATAGCGATTCAGACTCAGAGAGCGACTCAGATGCAGACACTGACACAGATTCAGACAGTGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATGGCGACTCAGCTtcagacagcgactcagactcagacag < 2:66793/139‑1 (MQ=14) cagaGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactcagactcagacag > 1:412244/1‑141 (MQ=255) cagaGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactcagactcagacag < 2:701808/141‑1 (MQ=255) cTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCCGACCGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactcagactcagacagcgactc < 1:613787/141‑1 (MQ=255) | CAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGACAGCGACTC > CP000730/618269‑618545 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |