| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 62,817 | +TCAATT | 94.2% | intergenic (+82/+229) | USA300HOU_0056 → / ← speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 62817 | 2 (0.050) | 31 (0.880) +TCAATT |
28/244 | NT | 94.2% | intergenic (+82/+229) | USA300HOU_0056/speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase |
| ? | CP000730 | 62818 = | 2 (0.050) | intergenic (+83/+228) | USA300HOU_0056/speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase | |||||
TTAAAACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTC‑‑‑‑‑‑TATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTAT > CP000730/62691‑62949 | ttaAAACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttg < 1:440644‑M1/141‑15 (MQ=255) aaaaCAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgtt < 2:243138‑M1/141‑17 (MQ=255) gCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaatttaa > 1:93239‑M1/1‑117 (MQ=255) aaaCAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTAGGTTAATTGAAAATAGACAGGAATAAATTGATTGCATCCTTGACCGCGAAGTGGAGTATGCTCtcaatttatttgtgttgaaagtaata > 1:109785‑M1/1‑115 (MQ=255) ggCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagct < 2:60095‑M1/141‑33 (MQ=255) ggCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagct < 1:238681‑M1/141‑33 (MQ=255) ttACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttca > 2:261813‑M1/1‑106 (MQ=255) ttACTACAAAAAATGTTTGTGTAATGCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGGCGAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttca > 1:237601‑M1/1‑106 (MQ=255) tactacAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcat > 2:79214‑M1/1‑105 (MQ=255) aaaTGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgataga < 1:246860‑M1/141‑46 (MQ=255) aaaTGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgataga > 2:337352‑M1/1‑96 (MQ=255) ttgaggaattctgaTAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtca < 2:265502‑M1/135‑52 (MQ=255) tAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaat < 1:420442‑M1/141‑57 (MQ=255) tAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaat < 2:149025‑M1/141‑57 (MQ=255) tAATTATTATAACGTCCTATTATTTTAATTAAAAATAGACAAAAATAAATTGAGTGCATCCCTTACTGCAAAGTGAAGGATGCTCTGAATTTATTTTTGTTGAAATTAATTTAAGCTTCATTCTGATAGATATTCATtaat < 2:299166/141‑1 (MQ=255) ccTATTATGTTAATCGAAAATAGCCAACAATAAATTGACAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatatatttctgtttaaattcatataagcttaatccttatagttagtcattactaattatttgcaaatc > 2:388430‑M1/1‑70 (MQ=255) gTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaa > 2:360101‑M1/1‑62 (MQ=255) tGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccg > 1:206297‑M1/1‑56 (MQ=255) gAAAATAGACAAAAAGAAATTGAGAGCACTCCTTTCCTCTAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtatgcaaatcgttattaagtaccgt < 1:382004‑M1/141‑87 (MQ=255) aaTAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgt < 2:323339‑M1/141‑90 (MQ=255) tAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgtta > 2:295542‑M1/1‑50 (MQ=255) aaaaaTAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcg < 2:245794‑M1/141‑97 (MQ=255) gagaGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcat < 2:8553‑M1/141‑108 (MQ=255) gagaGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcat > 1:58334‑M1/1‑34 (MQ=255) agCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaa < 1:161396‑M1/141‑111 (MQ=255) tACCGCAAAGTGAAGGATGCTC‑‑‑‑‑‑TATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGAtttt < 1:326798/141‑1 (MQ=255) ccGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaaatcctcgtaga > 1:898‑M1/1‑20 (MQ=255) tttgcggtaagggatgctctcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaaatcctcgtagat > 1:196131‑M1/12‑19 (MQ=255) cGCAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaaatcctcgtagat < 2:347574‑M1/141‑123 (MQ=255) cAAAGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaaatcctcgtagattt < 1:423583‑M1/141‑125 (MQ=255) aaaGTGAAGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaaatcctcgtagatttt < 2:61258‑M1/141‑126 (MQ=255) aaGGATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaaatcctcgtagattttatcaag < 1:394568‑M1/141‑132 (MQ=255) ggATGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaaatcctcgtagattttatcaagaa > 1:387799‑M1/1‑8 (MQ=255) aTGCTCtcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacagcgtcatcattcataaaatcctcgtagattttatcaagaatt < 1:181528‑M1/141‑136 (MQ=255) ctctcaatttatttttgttgaaattaatataagcttcattctgatagatagtcattaataattgtttgcaaatcgttattaagtaccgttgttacaccgtcatcattcataaaattctcgtagtttttatcaagaatttat < 2:242658‑M1/141‑139 (MQ=255) | TTAAAACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTC‑‑‑‑‑‑TATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAATTTAT > CP000730/62691‑62949 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |