| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
AAAAAACCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGTTCACATTCGGTCCAACATTGATACTCAACGACCAGCCAGAATCATACTCTGTTTATACGGGCATTTATTGAAATGTCCGTATTTTATAAATAGGCCGTCCCCTCAAGAGTAAACACCATAGTATTTAAAACCATCACACGAAAAATTC > NC_000913/2987706‑2988295 | aaaaaaCCAAAAAGCGGGATTAAGGGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAAGAAGGTTTTTACGTCTAGTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTc < 1:1105632/301‑1 (MQ=255) 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aaTGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATgg < 2:227159/301‑1 (MQ=255) aTGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCACAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATAATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATggg > 1:1119779/1‑301 (MQ=255) agaTTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGCTTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGTAATCGTTAGCTACTTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCACTGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCTTTATTTATCATTTACCGGAGGTAAAACATTAACTCAGCAGGAATTCACCATAATgggttcta > 1:958991/1‑296 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |