| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2988001 | 297 (2.180) | 3 (0.020) | 3/526 | NT | 1.0% | coding (466/633 nt) | yqeH | putative LuxR family transcriptional regulator |
| ? | NC_000913 | = 2988008 | 292 (2.150) | coding (473/633 nt) | yqeH | putative LuxR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 318 total aligned reads displayed.
CCACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGTTCTGGATATGGATATCCGTAGCATCTACGCGTACAAGCAACGAATCGAAAAGAGAATGGGTGGTAAAATAAACGAATTATTTATTCGTTCACATTCGGTCCAACATTGATACTCAACGACCAGCCAGAATCATACTCTGTTTATACGGGCATTTATTGAAATGTCCGTATTTTATAAATAGGCCGTCCCCTCAAGAGTAAACACCATAGTATTTAAAACCATCACACGAAAAATTCAGAAGCATTACGA > NC_000913/2987712‑2988308 | ccACAATGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGAGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGACGAGAACACAACTCAGCAATATCTGATGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTTTCATTTACCTGAGGTATCACATTAATTCAGATGGAATTCACCATa > 1:866610/1‑301 (MQ=255) aaaggacaggaTTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTTAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGAAATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAAt < 1:852353/292‑1 (MQ=255) aTGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCACTATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAAAACATTACATCAGATAGAATTCGCCATAATggg > 2:236362/1‑301 (MQ=255) tGCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTTAAAAAGACTGGATTGACGATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATgggg < 2:617631/301‑1 (MQ=255) gCGAGATTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACACCTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCAAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTCCCGGAGGTAAACAATTAACTAAAATGGAATTCACCATAATGGGGt > 2:1281474/1‑301 (MQ=255) agaTTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGCTTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGTAATCGTTAGCTACTTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCACTGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCTTTATTTATCATTTACCGGAGGTAAAACATTAACTCAGCAGGAATTCACCATAATgggttcta > 1:958991/1‑296 (MQ=255) agaTTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCTAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCCGACAACTATTTATTGGTCTTTATTTATCATTTACCGGCTGTAACCCATTCCCTCAGATTGAATTCACCTTACTGGGGtata > 1:675236/1‑301 (MQ=255) agaTTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAAt > 1:1157368/1‑293 (MQ=255) gaTTAAGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTatat > 1:889879/1‑301 (MQ=255) tttaGCGGATATATTTTTGTCGATTTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAAGGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTATATgg < 1:779498/298‑1 (MQ=255) tatatatTTTGTGAGATGTTTCAGTAATTGTTTGACGTCTATGCATTGAAAAAGAATGGATTGACGATCTTGCAAGGACTGACAGGGGGATTGGTTTAGGAAGAGAACGCAATAGGCAATCGTTAGCTAATGACTGGCGAAAACAAAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCTGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTATATgg < 1:994615/293‑1 (MQ=255) gATATATTTTTGTCGATGTTTCAGTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACCGGATTGATTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTGTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATGACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCAt < 1:1357360/280‑1 (MQ=255) ttGTCGTTTTTTCAGGCAGTTTTTGACGGCTATTGCTTGAAAAAGGATGGATTGACTAGCCTGCAAGTACTGACAGGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGAAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTATATGGTTTCTGGTTATAATcc < 1:1224635/301‑1 (MQ=255) 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tttttCATTAAGTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTAACTTGCAAGTAATGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAGCACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAg < 1:716785/301‑1 (MQ=255) gTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATCTGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTATTTATTGGTAGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGAATTCACCATAATGGGGTATATGTTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGACGt > 2:431772/1‑301 (MQ=255) gTTTTTTACGTCTATTCCTTGAAAAAGACTGGATTGACTATCTTGCAAGTACTGACATGGGGATTGTTTTAGTCAGCGACCGCAATATGCAATCGTTAGCTAATTACTGGCGAAAACACAACTCAGCAATATATGCTGTCATATATAATGATGATGGTCTTGATGTTGCCAATGAAAAGATCAGACAACTCTTTATTGGTCGTTATTTATCATTTACCGGAGGTAACACATTAACTCAGATGGACTTCACCATAATAGGGTATATGGTTTCTGGTTATAATCCATATCAGATTGCTGAAGt > 2:357863/1‑301 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |