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cccTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaaga < 1:347981/138‑1 (MQ=255) cccTATGGGATTATTGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTgaaaga > 2:347991/1‑138 (MQ=255) attattGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAATATTTTGCATCTAAGGCAGAAACTGATAATTTAAGAAAGGAGTCATATCCTCTGAAAAGAAAATGTCCCACAGGTACAGATAGAGTTGCTGCTTATCATAc < 2:276757/300‑1 (MQ=255) attGCAGACTTGGGATGATGCCAGATCTGGAGCATGTACGGGGGGAGTTTGTGGTGTTCTTTCACGTATAATAGGACCAAGTAAATTTGATAGTACTGCAGATGCTGCGTTAGATGCTTTGAAAGAAACGCAGAATAGATCTCTATGTAATGATATGGAATACTCTGGTATTGTCTGTAAAGATACTAATGGAAAATATTTTGCATCTAAGGCAGAAACTGATAATTTAAGAAAGGAGTCATATcc < 1:1055260/246‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |