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gAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAAGTAAAATTCCTGACTGAGAAAAGACATGTCGGCTATTGTGTAAAGCCATATAGCTCAGACGATGAATATCTACTCGTATTCAGTTGTTTATTGAGGGTGAGTTCCGACCCTGAAACAACAAATAAAATGAACAGTCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATAc > 1:246571/1‑243 (MQ=255) aaTTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAAGTAAAATTCCTGACTGAGAAAAGACATGTCGGCTATTGTGTAAAGCCATATAGCTCAGACGATGAATATCTACTCGTATTCAGTTGTTTATTGAGGGTGAGTTCCGACCCTGAAACAACAAATAAAATGAACAGTCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATAc > 2:874789/1‑242 (MQ=255) aaTTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAAGTAAAATTCCTGACTGAGAAAAGACATGTCGGCTATTGTGTAAAGCCATATAGCTCAGACGATGAATATCTACTCGTATTCAGTTGTTTATTGAGGGTGAGTTCCGACCCTGAAACAACAAATAAAATGAACAGTCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATAc < 1:874757/242‑1 (MQ=255) 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aaTTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAAATTCGTAGTGAGGAAAAGTAAAATTCCTGACTGAGAAAAGACATGTCGGCTATTGTGTAAAGCCATATAGCTCAGACGATGAATATCTACTCGTATTCAGTTGTTTATTGAGGGTGAGTTCCGACCCTGAAACAACAAATAAAATGAACAGTCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGc < 1:1139418/251‑1 (MQ=255) | GCGGTGGATATATCAATATACACAAATGTAGAAGATGATTATTTTTTTCTTATTTTTCCCTAACAAATGATGATGGGGGTAGGTTTAAGAAAACATTGACAGTGAGGGCCAGGGAACAAGTGGCGAAAATCGTATCAAAGAATGATCCAGATACAAAAAAAGTGTGGTGTAAATATGGTAAGATACCAGGGCAAGGGGATGGTGTAAACCTTTTTTTTGTTGGTGAAATTAATGTTACGCATTATTTTATAACAAATATTGGAGCTGGATTGCCTGATGCTTGTGCAGAGTAATTGCTTGAATTAAGAGTCTATCCCATATCGAAGTCGTCAACTTCGTAGTGAGGAAAAGTAAAATTCCTGACTGAGAAAAGACATGTCGGCTATTGTGTAAAGCCATATAGCTCAGACGATGAATATCTACTCGTATTCAGTTGTTTATTGAGGGTGAGTTCCGACCCTGAAACAACAAATAAAATGAACAGTCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGTGTTTAATGTGAGTC > NC_000913/528838‑529426 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |