| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2325648 = | 107 (1.050) | 3 (0.030) | 3/536 | NT | 2.8% | coding (893/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter |
| ? | NC_000913 | 2325669 = | 104 (1.040) | coding (914/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
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ttATCACCCGCATGATGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATATTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTCCTACATAAAACGCCCATGGCTTATCAGCGTGCTATCAGCGGGgcag > 2:906265/1‑300 (MQ=255) ccGCATGATGAGGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGt < 1:906303/301‑1 (MQ=255) ccatgaggtggcgaaagCCGTCTGACATGGTTAGTATCGATCCAAAACTCCTCATGGTAGAGGCTGATGTTAAAAAGCAGCTACCGAAAGAGGCCCCACCCTCCGGTCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTCCTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTAc < 2:114309/288‑1 (MQ=255) aaggatgatgCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGTTCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATGCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTAc < 2:899543/297‑1 (MQ=255) tgatgACAAGACTGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACCACTCATGGAAGAGGCTGATTTGCAAAAGCAGCAACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATTGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCgg < 2:411215/301‑1 (MQ=255) atgCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGt < 1:139305/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |