| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2325648 = | 107 (1.050) | 3 (0.030) | 3/536 | NT | 2.8% | coding (893/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter |
| ? | NC_000913 | 2325669 = | 104 (1.040) | coding (914/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TGATGCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTCTGGGCGGACTCATTACCGAATTCTTCATCAATGTTGCGAACAAAGACACCTTCCCGGTAATGACCTTTTTTAGTTCTGCACTGATTAACTTCGCCGTTCCGTCTGGCGGCGGTCACTGGGTTATTCAGGGACCTTTCGTGATACCCGCAGCCCAGGCGCTGGGCGCTGATCTCGGTAAATCGGTAATGGCGATCGCCTACGGCGAGCAATGGATGAACATGGCACAACCATTCTGGGC > NC_000913/2325369‑2325966 | atgCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGt < 1:139305/300‑1 (MQ=255) tgCCAAAACCGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCATGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCATTACTGCCGGTAt > 2:120749/1‑301 (MQ=255) aaaCCGTCTGCCGTGGCGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGAATTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTgg < 2:715072/301‑1 (MQ=255) cGTCTGACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCa > 2:804703/1‑301 (MQ=255) gACGTGGTGAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTc > 1:690969/1‑300 (MQ=255) ggtgAGTATCGATCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGAAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCtt > 1:865514/1‑300 (MQ=255) tctccagtaccgatttacccagatcagcgcccagcgcctgggctgcgggtatcacgaaaggtccctgaataacacagtgaccgccgccagacggaacggcgaagttaagcagtgcagaactaaaaaaggtcattaccgggaaggtgtctttgttcgcaacattgatgaagaattcggtaatgagtccgcccagaccggaatgctccatcatcagttggatcccagcgtagaaggggaattgcaccagaatgccggcagtactgcgtgctgccgGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGc < 1:859237‑M2/28‑1 (MQ=255) aTCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGAt > 2:111289/1‑301 (MQ=255) aTCCAAAACTACTCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGAAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGAATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGACCATGGCTTCAACATCACCATCCATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGATCTGCTGCTACATAATACGCCAATGGCTTATAGCCGTGCTCTCAGCACGGCAGCAGGCAGTACTGCAGGTATTCTGGGGCAATTCCCCTTATACGCATGGAt > 2:363595/1‑301 (MQ=255) actactCATGGAAGAGGCTGATTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACtg < 1:111290/301‑1 (MQ=255) 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aTTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTc < 1:250766/300‑1 (MQ=255) aTTTTCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCATGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGGATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTc < 1:120750/300‑1 (MQ=255) ttCAAAAGCAGCTACCGAAAGATGCCCCACCATCCGAGCGACTGGAAGAAAGCCGCATTCTGACGTTGATCATCGGCGCACTCGGTATCGCTTACCTTGCGATGTACTTCAGCGAACATGGCTTCAACATCACCATCAATACCGTCAACCTGATGTTTATGATTGCGGGTCTGCTGCTACATAAAACGCCAATGGCTTATATGCGTGCTATCAGCGCGGCAGCACGCAGTACTGCCGGTATTCTGGTGCAATTCCCCTTCTACGCTGGTATCCAACTGATGATGGAGCATTCCGGTTTggg > 1:139191/1‑301 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |