| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3042074 | 123 (1.230) | coding (762/981 nt) | ygfZ | iron‑sulfur cluster repair protein, plumbagin resistance | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
GGTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGCTCTGGTTGCTGGCAGGTAGCGCCAGCCGACTGCCGGAAGCTGGTGAAGACTTAGAGCTGAAAATGGGCGAGAACTGGCGTCGTACCGGTACGGTACTGGCTGCGGTAAAACTGGAAGATGGTCAGGTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATAACGATATGGAACCGGATAGCATCTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACATTGCATATCGAGCCGCTGCCGTATTCGCTCGAAGAGTAAATCTCTTTATCGCATCAGGCATTTATCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGTCTGGGA > NC_000913/3041770‑3042358 | ggTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTTACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATCCCGGACAAGAGATGGTGGCGCGATCACAATTCCGTGGTGCCAATAAACATTCGCCTTGGTTGCTGGCcgg > 2:580714‑M1/1‑298 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ctatGGTTGCTGGCAGGTAGCGCCAGCCGACTGCCGGAAGCTGGTGAAGACTTAGAGCTGAAAAGGGGCGAGAACTGGCGTCGTACCGGTACGGCTCTGGCTGCGGTAAAACTGGAAGATGGTCAGGTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATACCGATATGGAACCGGATAGCAGCTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACATTGCATAGCGAGCCGCTGCCGTATTAGCCCGATGAGTAAATCTCGTTATCGCATCCGGCATTTATCGCCTGATTAGGCGCGGGCGTGTCTCATCaggg > 1:168840/4‑296 (MQ=255) tgtGCTGGCCGGTGGCCCCATCTGACTGCCGGAAGACGGTCAAGTGTTAGAGAGGAAATGGGGAGAGATGGGTCGTCGGACTGGAACGGTACTGGCTGCGGTAACAGTGGAAGTTGGTCGGTTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATAACGATATGGAACCGTATAGCATTTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACAGTGCATATCGAGCCGCTTCCGTATTCGCTCGAAGAGTAAATCTCTTTATCACATCAGGCATTTATCGCCTGATGCGGCGCTGGCGCGTCTTATCATGTCTGGGa < 2:228467/298‑1 (MQ=255) | GGTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGCTCTGGTTGCTGGCAGGTAGCGCCAGCCGACTGCCGGAAGCTGGTGAAGACTTAGAGCTGAAAATGGGCGAGAACTGGCGTCGTACCGGTACGGTACTGGCTGCGGTAAAACTGGAAGATGGTCAGGTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATAACGATATGGAACCGGATAGCATCTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACATTGCATATCGAGCCGCTGCCGTATTCGCTCGAAGAGTAAATCTCTTTATCGCATCAGGCATTTATCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGTCTGGGA > NC_000913/3041770‑3042358 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |