| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3042074 | 123 (1.230) | coding (762/981 nt) | ygfZ | iron‑sulfur cluster repair protein, plumbagin resistance | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
ACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGCTCTGGTTGCTGGCAGGTAGCGCCAGCCGACTGCCGGAAGCTGGTGAAGACTTAGAGCTGAAAATGGGCGAGAACTGGCGTCGTACCGGTACGGTACTGGCTGCGGTAAAACTGGAAGATGGTCAGGTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATAACGATATGGAACCGGATAGCATCTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACATTGCATATCGAGCCGCTGCCGTATTCGCTCGAAGAGTAAATCTCTTTATCGCATCAGGCATTTATCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGTCTGGGAT > NC_000913/3041779‑3042359 | acCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCCGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGGGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGCTATGGTTGCAGGCAGGGAgcccga > 2:503407/1‑296 (MQ=255) 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ggTTGCTGGCAGGTAGCGCCAGCCGACTGCCGGAAGCTGGTGAAGACTTAGAGCTGAAAATGGGCGAGAACTGGCGTCGTACCGGTACGGTACTGGCTGCGGTAAAACTGGAAGATGGTCAGGTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATAACGATATGGAACCGGATAGCATCTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACATTGCATATCGAGCCGCTGCCGTATTCGCTCGAAGAGTAAATCTCTTTATCGCATCCGGCATTTATCGCCTGATGCGCCGCTGGCGAGTCTTATCATGTCTgggg > 2:596840/1‑300 (MQ=255) tgtGCTGGCCGGTGGCCCCATCTGACTGCCGGAAGACGGTCAAGTGTTAGAGAGGAAATGGGGAGAGATGGGTCGTCGGACTGGAACGGTACTGGCTGCGGTAACAGTGGAAGTTGGTCGGTTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATAACGATATGGAACCGTATAGCATTTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACAGTGCATATCGAGCCGCTTCCGTATTCGCTCGAAGAGTAAATCTCTTTATCACATCAGGCATTTATCGCCTGATGCGGCGCTGGCGCGTCTTATCATGTCTGGGa < 2:228467/298‑1 (MQ=255) ggTAGCGCCAGCCGACTGCCGGAAGCTGGTGAAGACTTAGAGCTGAAAATGGGCGAGAACTGGCGTCGTACCGGTACGGTACTGGCTGCGGTAAAACTGGAAGATGGTCAGGTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATAACGATATGGAACCGGATAGCATCTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACATTGCATATCGAGCCGCTGCCGTATTCGCTCGAAGAGTAAATCTCTTTATCGCATCAGGCATTTATCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCa > 1:266242/1‑281 (MQ=255) | ACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGCTCTGGTTGCTGGCAGGTAGCGCCAGCCGACTGCCGGAAGCTGGTGAAGACTTAGAGCTGAAAATGGGCGAGAACTGGCGTCGTACCGGTACGGTACTGGCTGCGGTAAAACTGGAAGATGGTCAGGTCGTGGTACAGGTCGTCATGAATAACGATATGGAACCGGATAGCATCTTCCGCGTACGCGACGATGCGAATACATTGCATATCGAGCCGCTGCCGTATTCGCTCGAAGAGTAAATCTCTTTATCGCATCAGGCATTTATCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGTCTGGGAT > NC_000913/3041779‑3042359 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |