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Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
AAAAGGATCAATGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTACCCTGAAAGGTTGCGGTGCGCTGGATTGGGGAATGCAGTCACGCTTATCGCGGATATTTAATCCGAAAACGGGTAAAACCGTGATGCTGGCTTTTGACCATGGTTATTTTCAGGGACCGACTACCGGACTTGAACGCATTGATATAAATATCGCCCCGCTGTTTGAACATGCCGATGTATTAATGTGTACGCGCGGCATTTTGCGCAGCGTAGTTCCCCCTGCGACCAAT > NC_000913/1605902‑1606402 | aaaaGGATCAATGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCTGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTAGTACCGATCAAcc > 1:886382/1‑251 (MQ=255) aaGGATCAATGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCta > 1:355‑M2/1‑249 (MQ=255) agtccggagagtaacggaatagcagagggcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtacgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCaa < 1:773715‑M2/9‑1 (MQ=255) aTGAAAACGGGCGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggcc > 1:1060759‑M2/1‑241 (MQ=255) 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cGACAAGCTGGATATCAAGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTTATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGGTATGGACGATTTAGACGATCTTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtataatggcctcatgaatctc < 2:475099‑M2/251‑22 (MQ=255) atagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataccgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAATCGCAAAAAAATATCCCTTTTAcc < 2:367060‑M2/27‑1 (MQ=255) atagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTAcc < 1:60085‑M2/27‑1 (MQ=255) atacaagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgacgacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggaatccgcatagtgcgctgggtgatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTAcc < 1:998657‑M2/27‑1 (MQ=255) gtttgagaagagacaggggcgtaggtcAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTAGGACTACGAAGCGGATGGTAATGTCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggccccctgaatctcca > 2:785551‑M2/14‑228 (MQ=255) aaGATCGATATCTAGGGTGTAGTTCCGGTTTAAGTCTCGCCAAACAGCTTTCAGGTCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGTATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGTTATTCAACAAAGACAATTTCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGTGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggccccctgaatctccaga > 2:970024‑M2/1‑226 (MQ=255) agggcttcgtgaaaacgataaagcgtgacgacatcattatcatgcccaaaccagccgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattatagcgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcgacgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTACCCTGAAAg < 1:836523‑M2/34‑1 (MQ=255) atagacaggggCGTAGGTCAGGTTGCAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATTACGACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTTTTACCGGCGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggccccctgaatctccagacaacca > 2:699473‑M2/6‑220 (MQ=255) cgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTACCCTGAAAGGTTGCgg > 1:180288‑M2/211‑251 (MQ=255) gtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaataaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCAACCGCAAAAAAATATCCCTTTTACCCTGAAAGGTTGCGGt < 1:880785‑M2/42‑1 (MQ=255) aGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcac > 1:1100069‑M2/1‑213 (MQ=255) aGGGCGTAGGTCAGGTTGAAGTCTCGCCAAACAGCGTTCAGGGCTATGACTACGAAGCGGATGGTAATGGCATCGTACTGTTACCGGAGCGCGTGATATTCAACAAAGAGAATATCGGCAAATACGATTTCTGATGTGCATTACTTAACCGGAGTAAGTTATGGCAGATTTAGACGATATTAAAGATGGTAAAGATTTTCGTACCGATCAACCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcac > 1:106800‑M2/1‑213 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |