New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 2497916 | 143 (1.110) | 3 (0.030) | 3/232 | NT | 2.1% | intergenic (+21/+65) | corA/scrA | MIT family metal ion transporter CorA/PTS family sucrose porter component IIBC |
? | CP000730 | = 2497963 | 147 (1.250) | intergenic (+68/+18) | corA/scrA | MIT family metal ion transporter CorA/PTS family sucrose porter component IIBC | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
GAATGTGCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAATGATGAATGATATT > CP000730/2497778‑2498056 | gAATGTGCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCt > 1:1646679/1‑141 (MQ=255) aaTGTGCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCtt < 2:636543/141‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTaa > 1:1441894/1‑141 (MQ=255) gCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGt > 1:169557/1‑141 (MQ=255) gCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGt < 2:906973/141‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGt > 1:1586494/1‑141 (MQ=255) gCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGt > 1:163033/1‑141 (MQ=255) gTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTc > 2:553717/1‑141 (MQ=255) ttGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCa > 2:1141844/1‑141 (MQ=255) aTTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTAt < 1:140613/141‑1 (MQ=255) ttGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTAtt < 2:640587/141‑1 (MQ=255) tgatgaCCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTg > 1:1204034/1‑141 (MQ=255) gtgaCCATAGTTATATATCGTGGATTATTGTGGTTGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGGTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAATGTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCa < 2:98453/140‑1 (MQ=255) tgaCCATAGTTATATATCTAGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAt < 2:574701/141‑1 (MQ=255) gaCCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAtt < 1:1230975/141‑1 (MQ=255) gaCCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAtt < 2:716734/141‑1 (MQ=255) gaCCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCAtt > 1:1275818/1‑141 (MQ=255) acgaTAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTGAGGATTTTCTTATGGCGTATACAGAAATCATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCaaat < 2:102830/138‑4 (MQ=255) aCCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCaaat < 1:301511/141‑4 (MQ=255) ccATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTg > 2:386152/1‑141 (MQ=255) cATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGc < 1:1531309/141‑1 (MQ=255) gTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATg > 2:1502313/1‑141 (MQ=255) ttATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAGATGTTAGTATATTCTTATGCCGTACTCAGAACTTATAACTAAATTAAAAGGTATGACATCTTAATGTTTTTTCCGATTGGATTTGCCAtaa < 2:861165/141‑3 (MQ=255) tatataTCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGAc < 2:225101/141‑1 (MQ=255) tatataTCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGAc < 1:181635/141‑1 (MQ=255) tatataTCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGAc < 1:795602/141‑1 (MQ=255) tatatCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTg < 1:1207112/141‑1 (MQ=255) tatCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGAt > 1:572142/1‑141 (MQ=255) cTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACt < 1:1468113/141‑1 (MQ=255) attattGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGAt < 2:1083420/141‑1 (MQ=255) attattGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGAt > 1:456040/1‑141 (MQ=255) aTTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTAc < 1:1049579‑M2/141‑2 (MQ=255) aTTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTAc < 1:761628‑M2/141‑2 (MQ=255) ttGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGtaatcaaagtatcagtcattgcaaatgcaataggatgaaactttaagct < 1:56489‑M1/141‑50 (MQ=255) ggtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTActgtca < 2:957548‑M2/141‑7 (MQ=255) gtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTActgtcat > 1:1379649‑M2/1‑134 (MQ=255) gtaggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTActgtcat > 2:1543799‑M2/1‑134 (MQ=255) ggtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTActgtcatacc < 2:899099‑M2/141‑11 (MQ=255) gtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTActgtcatacct < 1:210863‑M2/141‑12 (MQ=255) gtaTTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTActgtcatacct < 2:755947‑M2/141‑12 (MQ=255) gttgatttcagcatGTCGTAACTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAAGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTTTTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCTTACCTCtt < 1:1553070/128‑1 (MQ=255) tCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCaa > 2:784237/1‑107 (MQ=255) tCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCaa < 1:784237/107‑1 (MQ=255) tCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCtttt < 2:1087994/141‑1 (MQ=255) tCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCtttt > 2:532835/1‑141 (MQ=255) cATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCttttt < 1:982453/141‑1 (MQ=255) aTTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCtttttt < 1:1512004/141‑1 (MQ=255) ttAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCttttttt < 2:1106288/141‑1 (MQ=255) aaTTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTAt > 2:1275340/1‑141 (MQ=255) ttCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTc > 1:742704/1‑141 (MQ=255) tGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTTTTTTTTTATTTTACa > 1:362644/1‑141 (MQ=255) tGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACa < 2:456040/141‑1 (MQ=255) tCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAAc < 2:168619/141‑1 (MQ=255) cGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGGAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACTGCTTAAAGTTTCGTCCTATTCCATTTGCAATGCCTGCTACTGTGAATACTGTCGGACATCTTTTTTTaacccacaccc < 2:797590/141‑11 (MQ=255) gTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAActt < 2:1436328/141‑1 (MQ=255) tAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAActtc < 1:1558759/141‑1 (MQ=255) aTTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAActtctt < 1:707048/141‑1 (MQ=255) ttAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAATGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATTCCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTAtt < 2:944121/141‑1 (MQ=255) aGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTg > 2:257380/1‑141 (MQ=255) aGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTg > 1:6846/1‑141 (MQ=255) aGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTg < 1:317668/141‑1 (MQ=255) gTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGc < 1:911962/141‑1 (MQ=255) gTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGc < 2:182184/141‑1 (MQ=255) ttttCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGcttt > 1:1338725/1‑141 (MQ=255) cTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGcttttctt < 2:24968/141‑1 (MQ=255) ggCGTAAACAGACATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTGTTTATTTGCTTTTCTTTTAGa > 1:506340/1‑141 (MQ=255) gCGTAAACAGAAATTATACCTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAATGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGAt < 1:116464/141‑1 (MQ=255) gCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGAt < 1:1506706/141‑1 (MQ=255) aCAGAAANTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATGTGCTTTTCTTTTAGATAAAAtt < 2:1247613/141‑1 (MQ=255) aGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTaa > 1:105084/1‑141 (MQ=255) gAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACGTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTaaa > 1:1121293/1‑141 (MQ=255) aTTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTa < 2:389329/141‑1 (MQ=255) aTTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTa < 2:398069/141‑1 (MQ=255) aaCTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTTTTTTTTTTCTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATATAATTAAAGTAATTGt > 2:1156081/1‑141 (MQ=255) aaCTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGt > 1:1629542/1‑141 (MQ=255) cTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTta < 2:289525/141‑1 (MQ=255) tAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCTATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTtat < 2:1443350/141‑1 (MQ=255) aTTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGc < 1:189006/141‑1 (MQ=255) aTTAAAAGGAATGACAGCTTAAAGTTTCACCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTTTTCTACTTCTTTTTTATTTTTTTTTCTTTTAGTTTAGATTAAAGTCACTGttgtcag > 2:893004/1‑136 (MQ=255) ttAAACAGTATGACAGCTTAATGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATTACGGATACTTTGATGACTGTCAGTCCTCTTTTTTTATTCTACGACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAGATTAAAGTAACTGTTATAGCa < 2:1607951/141‑1 (MQ=255) taaaaagnAATGATAGtaaccaaagtatcaatcattgcaaatgcaataggatgaaactttaagctgtcataacttttaatttagataccatctctatttacgccataagaaactactaacaattacgacaagaatcaatga < 2:1242013‑M1/139‑126 (MQ=255) tAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCaa < 1:1239898/141‑1 (MQ=255) aaGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTActgtcataccttttaatttagttataatttctgtttacgccataagaaaatactaacaattacgacaagaattaatgaaata < 2:388910‑M2/141‑83 (MQ=255) aaGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAatga < 1:541699/141‑1 (MQ=255) aaGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAatga < 1:541698/141‑1 (MQ=255) aaGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAatga > 1:768328/1‑141 (MQ=255) aGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTTTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAatgat > 2:814904/1‑141 (MQ=255) gTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAAtgatga > 1:749318/1‑141 (MQ=255) tATGACAGtaatcaaagtatcagtcattgcaaatgcaataggatgaaactttaagctgtcataccttttaatttagttataatttctgtttacgccataagaaaatactaacaattacgacaagaattaatgaaataccta > 1:650494‑M1/1‑8 (MQ=255) tGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAATGatgaatg < 2:136668/141‑1 (MQ=255) gACAGtaatcaaagtatcagtcattgcaaatgcaataggatgaaactttaagctgtcataccttttaatttagttataatttctgtttacgccataagaaaatactaacaattacgacaagaattaatgaaatacctacca > 1:402564‑M1/1‑5 (MQ=255) aCAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAATGATGAATGat < 1:755947/141‑1 (MQ=255) aCAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAATGATGAATGat < 2:1530497/141‑1 (MQ=255) aCAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAATGATGAATGat < 1:920703/141‑1 (MQ=255) cAGtaatcaaagtatcagtcattgcaaatgcaataggatgaaactttaagctgtcataccttttaatttagttataatttctgtttacgccataagaaaatactaacaattacgacaagaattaatgaaatacctaccaca < 1:85544‑M1/141‑139 (MQ=255) cAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAATGATGAATGata > 2:841921/1‑141 (MQ=255) cAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAATGATGAATGata > 2:366911/1‑141 (MQ=255) aGtaatcaaagtatcagtcattgcaaatgcaataggatgaaactttaagctgtcataccttttaatttagttataatttctgtttacgccataagaaaatactaacaattacgacaagaattaatgaaatacctaccacaa < 1:37975‑M1/141‑140 (MQ=255) gtaatcaaagtatcagtcattgcaaatgcaataggatgaaactttaagctgtcataccttttaatttagttataatttctgtttacgccataagaaaatactaacaattacgacaagaattaatgaaatacctaccacaat < 2:1194244‑M1/141‑141 (MQ=255) gtaatcaaagtatcagtcattgcaaatgcaataggatgaaactttaagctgtcataccttttaatttagttataatttctgtttacgccataagaaaatactaacaattacgacaagaattaatgaaatacctaccacaat < 1:1049579‑M1/141‑141 (MQ=255) | GAATGTGCCGTTGCCAATTGATGACCATAGTTATATATCTTGGATTATTGTGGTAGGTATTTCATTAATTCTTGTCGTAATTGTTAGTATTTTCTTATGGCGTAAACAGAAATTATAACTAAATTAAAAGGTATGACAGCTTAAAGTTTCATCCTATTGCATTTGCAATGACTGATACTTTGATTACTGTCATACCTCTTTTTTTATTCTACAACTTCTTTATTTGCTTTTCTTTTAGATAAAATTAAAGTAACTGTTATAGCAATGATGAATGATATT > CP000730/2497778‑2498056 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |